Совокупность животных растений и микроорганизмов: Совокупность растений,животных и микроорганизмов ,обитающих на определенной территории и взаимодействующих между собой и окр средой,называют:…

Содержание

Совокупность Растений, Животных И Микроорганизмов В Опр

Решение этого кроссворда состоит из 5 букв длиной и начинается с буквы Ц

Ниже вы найдете правильный ответ на совокупность растений, животных и микроорганизмов в опр, если вам нужна дополнительная помощь в завершении кроссворда, продолжайте навигацию и воспользуйтесь нашей функцией поиска.

ответ на кроссворд и сканворд

Среда, 20 Мая 2020 Г.

ЦЕНОЗ

ты знаешь ответ ?

ответ:

связанные кроссворды

Ценоз

области
То же, что биоценоз

Биоценоз в чрезвычайной ситуации — Энциклопедия пожарной безопасности

Главная страница
Энциклопедия

Биоценоз в чрезвычайной ситуации – совокупность растений, грибов, животных и микроорганизмов, населяющих данный участок суши или водоема и характеризующихся определенными отношениями между собой и приспособленностью к условиям окружающей среды в условиях воздействия поражающих факторов источников чрезвычайной ситуации.

Предыдущая статья

Биоценоз
Биоценоз – совокупность живых организмов, населяющих определенный биотоп (растения, грибы, животные и микроорганизмы) и имеющая определенный состав и сложившийся характер взаимоотношений как между ее компонентами, так и со средой. Термин введен немецким биологом Мебиусом (1877). Как правило, имеется ввиду принадлежность Б. одному биогеоценозу и биотипу.

Следующая статья

Биоцид
Биоцид –
1) разрушительное воздействие природных сил, хозяйственной или иной деятельности человека на устоявшиеся экологические системы, приводящее к нарушению целостности их компонентов и глубоким (необратимым) изменениям окружающей среды;
2) микроорганизмы (микробы, грибы, дрожжи), способные уничтожать живые, отмершие (животного и растительного происхождения) и неживые материалы и предметы, используя их как питательную среду. Некоторые представители…

читать полностью

Другие разделы портала

Учебный центр
Учебный центр
В Российской Федерации в области пожарной безопасности выполняют работы (оказывают услуги) только в рамках лицензируемых видов деятельности порядка 50 тысяч организаций. Кроме этого, на предприятиях различных форм собственности свою деятельность осуществляют работники, на которых возложены обязанности по организации соблюдения требований пожарной безопасности и профилактики пожаров.
Читать
полностью

Микробы управляют эволюцией животных и растений: концепция гологенома

1. Розенберг Э., Корен О., Решеф Л., Эфрони Р., Зильбер-Розенберг И.
2007.
Роль микроорганизмов в здоровье, болезнях и эволюции кораллов. Нат Рев Микробиол
5: 355–362. DOI: 10.1038/nrmicro1635. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

2. Зильбер-Розенберг И., Розенберг Э.
2008.
Роль микроорганизмов в эволюции животных и растений: гологеномная теория эволюции. FEMS Microbiol Rev.
32:723–735. дои: 10.1111/j.1574-6976.2008.00123.х. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

3. Маргулис Л.
1991.
Симбиогенез и симбионтизм, стр. 1–14. В
Маргулис Л., Фестер Р. (редактор), Симбиоз как источник эволюционных инноваций: видообразование и морфогенез. MIT Press, Кембридж, Массачусетс. [PubMed] [Google Scholar]

4. Ровер Ф., Сегуритан В., Азам Ф., Ноултон Н.
2002.
Разнообразие и распространение коралловых бактерий. Mar Ecol Prog Ser
243:1–10. дои: 10.3354/meps243001. [Перекрестная ссылка] [Академия Google]

5. Ледерберг Дж., Маккрей А.Т.
2001.
«Ome Sweet Omics» — генеалогическая сокровищница слов. Ученый
15:8. [Google Scholar]

6. Розенберг Э., Зильбер-Розенберг И.
2014.
Концепция хологенома: микробиота человека, животных и растений. Спрингер, Гейдельберг, Германия. [Google Scholar]

7. Гилберт С.Ф., Сапп Дж., Таубер А.И.
2012.
Симбиотический взгляд на жизнь: мы никогда не были личностями. Q Rev Биол
87:325–341. дои: 10.1086/668166. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

8. Окаша С.
2004.
«Ошибка усреднения» и уровни отбора. Биол Филос
19: 167–184. doi: 10.1023/B:BIPH.0000024406.61340.6c. [CrossRef] [Google Scholar]

9. Рознер Дж.Л.
2014.
В десять раз больше микробных клеток, чем клеток тела человека?
Микроб
9:47. doi: 10.1128/микроб.9.47.2. [CrossRef] [Google Scholar]

10. Lindow SE, Brandl MT.
2003.
Микробиология филлосферы. Appl Environ Microbiol
69: 1875–1883. doi: 10.1128/AEM.69.4.1875-1883.2003. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

11. Foster RC.
1988 год.
Микросреда почвенных микроорганизмов. Биол Плодородные почвы
6:189–203. дои: 10.1007/BF00260816. [CrossRef] [Google Scholar]

12. Thingstad TF.
2000.
Элементы теории механизмов контроля численности, разнообразия и биогеохимической роли литических бактериальных вирусов в водных системах. Лимнол Океаногр
45:1320–1328. doi: 10.4319/lo.2000.45.6.1320. [CrossRef] [Google Scholar]

13. Turnbaugh PJ, Hamady M, Yatsunenko T, Cantarel BL, Duncan A, Ley RE, Sogin ML, Jones WJ, Roe BA, Affourtit JP, Egholm M, Henrissat B, Heath AC, Найт Р. , Гордон Дж.И.
2009 г..
Основной микробиом кишечника у тучных и худых близнецов. Природа
457: 480–484. дои: 10.1038/nature07540. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

14. Voss JD, Leon JC, Dhurandhar NV, Robb FT.
2015.
Павнобиом: манипулирование хологеномом в пределах одного поколения хозяина и за его пределами. Фронт микробиол
6:697
http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2015.00697. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

15. Давид И.Б., Блэклер А.В.
1972.
Материнское и цитоплазматическое наследование митохондриальной ДНК у Xenopus. Дев Биол
29: 152–161. doi: 10.1016/0012-1606(72)

-8. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

16. Baumann P, Baumann L, Lai CY, Rouhbakhsh D, Moran NA, Clark MA.
1995.
Генетика, физиология и эволюционные взаимоотношения рода Buchnera: внутриклеточные симбионты тлей. Анну Рев Микробиол
49:55–94. doi: 10.1146/annurev.mi.49.100195.000415. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

17. Engel P, Moran NA.
2013.
Микробиота кишечника насекомых — разнообразие структуры и функций. FEMS Microbiol Rev.
37:699–735. дои: 10.1111/1574-6976.12025. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

18. Gilbert SF.
2014.
Рассказ о рождении голобионта: эпигенетическая передача человеческого микробиома. Фронт Жене
5:282 doi: 10.3389/fgene.2014.00282. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

19. Blaser MJ, Falkow S.
2009.
Каковы последствия исчезновения микробиоты человека?
Нат Рев Микробиол
7:887–894. DOI: 10.1038/nrmicro2245. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

20. Азамбуджа П., Гарсия Э.С., Рэтклифф Н.А.
2005.
Микробиота кишечника и передача паразитов насекомыми-переносчиками. Тенденции Паразитол
21: 568–572. doi: 10.1016/j.pt.2005.09.011. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

21. Шанкер С., Ли А., Соррелл Т.С.
1990.
Горизонтальная передача Campylobacter jejuni среди цыплят-бройлеров: экспериментальные исследования. Эпидемиол Заражение
104:101–110. doi: 10.1017/S0950268800054571. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

22. Ley RE, Hamady M, Lozupone C, Turnbaugh PJ, Ramey RR, Bircher JS, Schlegel ML, Tucker TA, Schrenzel MD, Knight R, Gordon JI.
2008.
Эволюция млекопитающих и их кишечных микробов. Наука
320: 1647–1651. doi: 10.1126/science.1155725. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

23. Лей Р.Е., Лозупоне К.А., Хамади М., Найт Р., Гордон Дж.И.
2008.
Миры внутри миров: эволюция микробиоты кишечника позвоночных. Нат Рев Микробиол
6: 776–788. doi: 10.1038/nrmicro1978. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

24. Sanders JG, Powell S, Kronauer DJ, Vasconcelos HL, Frederickson ME, Pierce NE.
2014.
Стабильность и филогенетическая корреляция в микробиоте кишечника: уроки муравьев и обезьян. Мол Эколь
23:1268–1283. doi: 10.1111/mec.12611. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

25. Yildirim S, Yeoman CJ, Sipos M, Torralba M, Wilson BA, Goldberg TL, Stumpf RM, Leigh SR, White BA, Nelson KE.
2010.
Характеристика фекального микробиома диких приматов, кроме человека, выявляет видоспецифические микробные сообщества. PLoS один
5:e13963. doi: 10.1371/journal.pone.0013963. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

26. Ochman H, Worobey M, Kuo CH, Ndjango JB, Peeters M, Hahn BH, Hugenholtz P.
2010.
Эволюционные отношения диких гоминидов, воспроизведенные кишечными микробными сообществами. ПЛОС Биол
8:e1000546. doi: 10.1371/journal.pbio.1000546. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

27. Домингес-Белло М.Г., Блазер М.Дж.
2011.
Микробиота человека как маркер миграции особей и популяций. Анну Рев Антропол
40:451–474. doi: 10.1146/annurev-anthro-081309-145711. [CrossRef] [Google Scholar]

28. Молес Л., Гомес М., Хейлиг Х., Бустос Г., Фуэнтес С., де Вос В., Фернандес Л., Родригес Х.М., Хименес Э.
2013.
Бактериальное разнообразие мекония недоношенных новорожденных и эволюция их фекальной микробиоты в течение первого месяца жизни. PLoS один
8:e66986. doi: 10.1371/journal.pone.0066986. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

29. Аагард К., Ма Дж., Энтони К.М., Гану Р., Петросино Дж., Версалович Дж.
2014.
Плацента содержит уникальный микробиом. Sci Transl Med
6:237. doi: 10.1126/scitranslmed.3008599. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

30. Gosalbes MJ, Llop S, Vallès Y, Moya A, Ballester F, Francino MP.
2013.
Типы мекониевой микробиоты, в которой преобладают молочнокислые или кишечные бактерии, по-разному связаны с материнской экземой и респираторными проблемами у младенцев. Клин Эксперт Аллергия
43:198–211. doi: 10.1111/cea.12063. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

31. Rodríguez JM, Murphy K, Stanton C, Ross RP, Kober OI, Juge N, Avershina E, Rudi K, Narbad A, Jenmalm MC, Marchesi JR, Collado MC.
2015.
Состав кишечной микробиоты на протяжении всей жизни с акцентом на раннем возрасте. Microb Ecol Health Dis
26:26050. дои: 10.3402/mehd.v26.26050. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

32. Fernández L, Langa S, Martina V, Antonio Maldonado A, Jiménez E, Martin R, Rodríguez JM.
2013.
Микробиота грудного молока: происхождение и потенциальная роль в здоровье и болезни. Фармакол Рез
69: 1–10. doi: 10.1016/j.phrs.2012.09.001. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

33. Емельянов В.В.
2003.
Митохондриальная связь с происхождением эукариотической клетки. Евр Дж Биохим
270: 1599–1618. doi: 10.1046/j.1432-1033.2003.03499.x. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

34. Гулд С.Б., Уоллер Р.Ф., Макфадден Г.И.
2008.
Эволюция пластид. Анну Рев Растение Биол
59:491–517. doi: 10.1146/annurev.arplant.59.032607.092915. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

35. Archambaud C, Sismeirod O, Toedling J, Soubigoud G, Becavin C, Lechat P, Lebreton A, Ciaudo C, Cossart P.
2013.
Кишечная микробиота препятствует ответу микроРНК при оральной инфекции Listeria. mBio
4:e00707-13. doi: 10.1128/mBio.00707-13. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

36. Цитрин Э.Дж., Колтон М.
2011.
Микробная защита от болезней растений, 123–138. В
Розенберг Э., Гофна У (редактор), Полезные микроорганизмы в многоклеточных формах жизни. Springer Verlag, Гейдельберг, Германия. [Google Scholar]

37. Олдройд Г.Э., Мюррей Д.Д., Пул П.С., Дауни Д.А.
2011.
Правила участия в бобово-ризобиальном симбиозе. Анну Рев Жене
45:119–144. doi: 10.1146/annurev-genet-110410-132549. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

38. Russell JB, Muck RE, Weimer PJ.
2009 г..
Количественный анализ деградации целлюлозы и роста целлюлозолитических бактерий в рубце. FEMS Microbiol Ecol
67:183–197. doi: 10.1111/j.1574-6941.2008.00633.x. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

39. Ватанабе Х., Токуда Г.
2010.
Целлюлолитические системы насекомых. Анну Рев Энтомол
55:609–632. doi: 10.1146/annurev-ento-112408-085319. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

40. Румфо М.Е., Пеллетро К.Н., Мустафа А., Бхаттачарья Д.
2011.
Создание фотосинтезирующего животного. J Эксперт Биол
214:303–311. doi: 10.1242/jeb.046540. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

41. Дубилье Н., Бергин С., Лотт С.
2008.
Симбиотическое разнообразие морских животных: искусство использования хемосинтеза. Нат Рев Микробиол
6: 725–740. doi: 10.1038/nrmicro1992. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

42. Коно М., Кога Р., Шимада М., Фукацу Т.
2008.
Динамика заражения сосуществующими бета- и гаммапротеобактериями в гнездовой эндосимбиотической системе мучнистых червецов. Appl Environ Microbiol
74:4175–4184. doi: 10.1128/AEM.00250-08. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

43. McCutcheon JP, von Dohlen CD.
2011.
Взаимозависимое метаболическое лоскутное одеяло в гнездовом симбиозе мучнистых червецов. Карр Биол
21:1366–1372. doi: 10.1016/j.cub.2011.06.051. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

44. Секиров И., Рассел С.Л., Antunes LC, Finlay BB.
2010.
Микробиота кишечника в норме и при патологии. Физиол Преподобный
90:859–904. doi: 10.1152/physrev.00045.2009. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

45. Лугтенберг Б., Камилова Ф.
2009.
Ризобактерии, стимулирующие рост растений. Анну Рев Микробиол
63:541–556. doi: 10.1146/annurev.micro.62.081307.162918. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

46. Ридаура В.К., Фейт Дж.Дж., Рей Ф.Е., Ченг Дж., Дункан А.Е., Кау А.Л., Гриффин Н.В., Ломбард В., Хенриссат Б., Бейн Дж.Р., Мюльбауэр М.Дж., Илькаева О, Семенкович К.Ф., Фунаи К., Хаяши Д.К., Лайл Б.Дж., Мартини М.К., Урселл Л.К., Клементе Д.К., Ван Треурен В., Уолтерс В.А., Найт Р., Ньюгард К.Б., Хит А.К., Гордон Д.И.
2013.
Микробиота кишечника от близнецов, диссонирующих по ожирению, модулирует метаболизм у мышей. Наука
341:1241214. doi: 10.1126/наука. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

47. Jungheim ES, Travieso JL, Hopeman MM.
2013.
Оценка влияния ожирения на репродуктивную функцию и фертильность женщин. Нутр Рев
71 (Приложение 1): S3–S8. doi: 10. 1111/nure.12056. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

48. Campbell JM, Lane M, Owens JA, Bakos HW.
2015.
Отцовское ожирение негативно влияет на мужскую фертильность и результаты вспомогательной репродукции: системный обзор и метаанализ. Репрод Биомед Онлайн
31: 593–604. doi: 10.1016/j.rbmo.2015.07.012. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

49. Корен О., Гудрич Дж. К., Каллендер Т. С., Спор А., Лайтинен К., Бэкхед Х. К., Гонсалес А., Вернер Дж. Дж., Ангенент Л. Т., Найт Р., Бэкхед Ф., Изолаури Э., Салминен С., Лей Р. Е.
2012.
Ремоделирование кишечного микробиома и метаболические изменения во время беременности. Клетка
150: 470–480. doi: 10.1016/j.cell.2012.07.008. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

50. Gilbert SF, Epel D.
2009.
Экологическая биология развития: интеграция эпигенетики, медицины и эволюции. Sinauer Associates, Сандерленд, Массачусетс. [Академия Google]

51. Макфолл-Нгай М.Дж.
2002.
Невидимые силы: влияние бактерий на развитие животных. Дев Биол
242:1–14. doi: 10.1006/dbio.2001.0522. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

52. Дуглас А.Е.
2010.
Симбиотическая привычка. Издательство Принстонского университета, Принстон, Нью-Джерси. [Google Scholar]

53. Pannebakker BA, Loppin B, Elemans CP, Humblot L, Vavre F.
2007.
Паразитическое ингибирование гибели клеток способствует симбиозу. Proc Natl Acad Sci U S A
104: 213–215. doi: 10.1073/pnas.0607845104. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

54. Ландманн Ф., Фостер Дж.М., Михальский М.Л., Слатко Б.Е., Салливан В.
2014.
Коэволюция между эндосимбионтом и его нематодой-хозяином: Wolbachia асимметричная задняя локализация и установление полярности AP. PLoS Negl Trop Dis
8:e3096. doi: 10.1371/journal.pntd.0003096. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

55. McFall-Ngai M, Heath-Heckman EA, Gillette AA, Peyer SM, Harvie EA.
2012.
Тайные языки сосуществующих симбиозов: взгляды из Симбиоз Euprymna scolopes-Vibrio fischeri . Семин Иммунол
24:3–8. doi: 10.1016/j.smim.2011.11.006. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

56. Lee YK, Mazmanian SK.
2010.
Сыграла ли микробиота критическую роль в эволюции адаптивной иммунной системы?
Наука
330: 1768–1773. doi: 10.1126/science.1195568. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

57. Ley RE, Peterson DA, Gordon JI.
2006.
Экологические и эволюционные силы, формирующие микробное разнообразие в кишечнике человека. Клетка
124:837–848. doi: 10.1016/j.cell.2006.02.017. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

58. Стаппенбек Т.С., Хупер Л.В., Гордон Дж.И.
2002.
Регуляция развития кишечного ангиогенеза местными микробами через клетки Панета. Proc Natl Acad Sci U S A
99:15451–15455. doi: 10.1073/pnas.202604299. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

59. Duan J, Chung H, Troy E, Kasper DL.
2010.
Микробная колонизация стимулирует экспансию γ/δ Т-клеток, экспрессирующих рецептор IL-1 1, и продуцирующих IL-17. Клеточный микроб-хозяин
7: 140–150. doi: 10.1016/j.chom.2010.01.005. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

60. Гилберт С.Ф., Эпель Д.
2015.
Экологическая биология развития: экологическая регуляция развития, здоровья и эволюции. Sinauer Associates, Сандерленд, Массачусетс. [Google Scholar]

61. Diaz Heijtz R, Wang S, Anuar F, Qian Y, Bjorkholm B, Samuelsson A, Hibberd ML, Forssberg H, Pettersson S.
2011.
Нормальная микробиота кишечника модулирует развитие и поведение мозга. Proc Natl Acad Sci U S A
108:3047–3052. doi: 10.1073/pnas.1010529108. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

62. Wikoff WR, Anfora AT, Liu J, Schultz PG, Lesley SA, Peters EC, Siuzdak G.
2009.
Метаболомический анализ показывает сильное влияние микрофлоры кишечника на метаболиты крови млекопитающих. Proc Natl Acad Sci U S A
106:3698–3703. doi: 10.1073/pnas.0812874106. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

63. Gonzalez A, Stombaugh J, Lozupone C, Turnbaugh PJ, Gordon JI, Knight R.
2011.
Континуум разум-тело-микроб. Диалоги Clin Neurosci
13:55–62. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

64. Шэрон Г., Сегал Д., Ринго Дж. М., Хефец А., Зильбер-Розенберг И., Розенберг Э.
2010.
Комменсальные бактерии играют роль в спаривании Drosophila melanogaster . Proc Natl Acad Sci U S A
107:20051–20056. doi: 10.1073/pnas.1009906107. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

65. Monachese M, Burton JP, Reid G.
2012.
Биоремедиация и толерантность человека к тяжелым металлам посредством микробных процессов: потенциальная роль пробиотиков?
Appl Environ Microbiol
78:6397–6404. doi: 10.1128/AEM.01665-12. [Статья PMC free] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

66. Кузьмина В.В., Первушина К.А.
2003.
Роль протеиназ энтеральной микробиоты в температурной адаптации рыб и гельминтов. Докл биологических наук
391: 326–328. [PubMed] [Google Scholar]

67. Pettay DT, Wham DC, Smith RT, Iglesias-Prieto R, LaJeunesse TC.
2015.
Микробное вторжение в Карибский бассейн индо-тихоокеанской коралловой зооксантеллы. Proc Natl Acad Sci U S A
112:7513–7518. doi: 10.1073/pnas.1502283112. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

68. Де Филиппо К., Кавальери Д., Ди Паола М., Рамазотти М., Пулле Дж. Б., Массар С., Коллини С., Пьерачини Г., Лионетти П.
2010.
Влияние диеты на формирование микробиоты кишечника, выявленное сравнительным исследованием детей из Европы и сельских районов Африки. Proc Natl Acad Sci U S A
107:14691–14696. doi: 10.1073/pnas.1005963107. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

69. Koenig JE, Spor A, Scalfone N, Fricker AD, Stombaugh J, Knight R, Angenent LT, Ley RE.
2011.
Последовательность микробных консорциумов в развивающемся кишечном микробиоме младенцев. Proc Natl Acad Sci U S A
108 (Приложение 1): 4578–4585. doi: 10.1073/pnas.1000081107. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

70. Turnbaugh PJ, Ridaura VK, Faith JJ, Rey FE, Knight R, Gordon JI.
2009.
Влияние диеты на микробиом кишечника человека: метагеномный анализ на гуманизированных гнотобиотических мышах. Sci Transl Med
1:6ra14. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

71. Collado MC, Isolauri E, Laitinen K, Salminen S.
2008.
Различный состав микробиоты кишечника при беременности у женщин с избыточной и нормальной массой тела. Am J Clin Nutr
88:894–899. [PubMed] [Google Scholar]

72. Моран Н.А., Ярвик Т.
2010.
Боковой перенос генов от грибов лежит в основе продукции каротиноидов у тлей. Наука
328: 624–627. doi: 10.1126/science.1187113. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

73. Митрева М., Смант Г., Хелдер Дж.
2009.
Роль горизонтального переноса генов в эволюции паразитизма растений среди нематод. Методы Мол Биол
532: 517–535. doi: 10.1007/978-1-60327-853-9_30. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

74. Дженкинс С., Самудрала Р., Андерсон И., Хедлунд Б.П., Петрони Г., Михайлова Н., Пинель Н., Овербек Р., Розати Г., Стейли Дж.Т.
2002.
Гены цитоскелетного белка тубулина в бактериях рода Prosthecobacter . Proc Natl Acad Sci U S A
99:17049–17054. doi: 10.1073/pnas.012516899. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

75. Никох Н., Танака К., Шибата Ф., Кондо Н., Хизуме М., Шимада М., Фукацу Т.
2008.
Геном Wolbachia , интегрированный в хромосому насекомого: эволюция и судьба латерально перенесенных эндосимбионтных генов. Геном Res
18: 272–280. doi: 10.1101/gr.7144908. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

76. Dyall SD, Brown MT, Johnson PJ.
2004.
Древние инвазии: от эндосимбионтов к органеллам. Наука
304: 253–257. дои: 10.1126/наука.1094884. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

77. McFadden GI, Van Dooren GG.
2004.
Эволюция: геном красных водорослей подтверждает общее происхождение всех пластид. Карр Биол
14: Р514–Р516. doi: 10.1016/j.cub.2004.06.041. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

78. Horiike T, Hamada K, Miyata D, Shinozawa T.
2004.
Происхождение эукариот предполагается как симбиоз Pyrococcus с гамма-протеобактериями по филогенетическому древу, основанному на содержании генов. Джей Мол Эвол
59:606–619. дои: 10.1007/s00239-004-2652-5. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

79. Dietrich C, Köhler T, Brune A.
2014.
Происхождение микробиоты кишечника термитов от тараканов: закономерности в структуре бактериального сообщества отражают основные эволюционные события. Appl Environ Microbiol
80:2261–2269. doi: 10.1128/AEM.04206-13. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

80. Hehemann JH, Correc G, Barbeyron T, Helbert W, Czjzek M, Michel G.
2010.
Перенос углевод-активных ферментов из морских бактерий в кишечную микробиоту японцев. Природа
464:908–914. дои: 10.1038/nature08937. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

81. Liu L, Chen X, Skogerbø G, Zhang P, Chen R, He S, Huang DW.
2012.
Микробиом человека: горячая точка микробного горизонтального переноса генов. Геномика
100: 265–270. doi: 10.1016/j.ygeno.2012.07.012. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

82. Дюпрессуар А., Лавиаль С., Хайдманн Т.
2012.
От наследственных инфекционных ретровирусов к добросовестным клеточным генам: роль захваченных синцитинов в плацентации. Плацента
33:663–671. doi: 10.1016/j.placenta.2012.05.005. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

83. Вагнер Г.П., Кин К., Муглия Л., Павличев М.
2014.
Эволюция беременности млекопитающих и происхождение децидуальной стромальной клетки. Int J Dev Biol
58:117–126. doi: 10.1387/ijdb.130335gw. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

84. Крисп А., Боскетти С., Перри М., Таннаклифф А., Миклем Г.
2015.
Экспрессия множества горизонтально приобретенных генов является отличительной чертой геномов как позвоночных, так и беспозвоночных. Геном Биол
16:50. doi: 10.1186/s13059-015-0607-3. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

85. Юэ Дж., Ху С., Хуан Дж.
2013.
Горизонтальный перенос генов в инновациях и адаптации наземных растений. Поведение сигнала установки
8:e24130. doi: 10.4161/psb.24130. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

86. Dodd DMB.
1989.
Репродуктивная изоляция как следствие адаптивной дивергенции у Drosophila pseudoobscura . Эволюция
43:1308–1311. дои: 10.2307/2409365. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

87. Coyne JA, Orr HA.
2004.
Спецификация. Синауэр, Сандерленд, Массачусетс. [Академия Google]

88. Шэрон Г., Сегал Д., Зильбер-Розенберг И., Розенберг Э.
2011.
Симбиотические бактерии несут ответственность за индуцированное диетой предпочтение спаривания у Drosophila melanogaster , что подтверждает гологеномную концепцию эволюции. Кишечные микробы
2: 190–192. doi: 10.4161/gmic.2.3.16103. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

89. Brucker RM, Bordenstein SR.
2013.
Хологеномная основа видообразования: кишечные бактерии вызывают гибель гибридов рода Nasonia . Наука
341: 667–669. doi: 10.1126/science.1240659. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

90. Wang J, Kalyan S, Steck N, Turner LM, Harr B, Künzel S, Vallier M, Häsler R, Franke A, Oberg HH, Ibrahim SM, Grassl GA, Кабелиц Д., Бейнс Дж. Ф.
2015.
Анализ кишечной микробиоты гибридных домашних мышей выявил эволюционную дивергенцию гологенома позвоночных. Нац Коммуна
6:6440. дои: 10.1038/ncomms7440. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

91. Mills E, Shechtman K, Loya Y, Rosenberg E.
2013.
Бактерии, по-видимому, играют важную роль, вызывая и предотвращая обесцвечивание кораллов Окулина патагонская . Mar Ecol Prog Ser
489: 155–162. дои: 10.3354/мепс10391. [CrossRef] [Google Scholar]

92. Вонг А.С., Частон Дж.М., Дуглас А.Е.
2013.
Непостоянная микробиота кишечника видов дрозофилы , выявленная с помощью анализа гена 16S рРНК. Intl Soc Microbiol Ecol J
7: 1922–1932. doi: 10.1038/ismej.2013.86. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

93. Schmitt S, Tsai P, Bell J, Fromont J, Ilan M, Lindquist N, Perez T, Rodrigo A, Schupp PJ, Vacelet J, Webster Н. , Хентшель У., Тейлор М.В.
2012.
Оценка сложной микробиоты губок: основных, изменчивых и видоспецифичных бактериальных сообществ морских губок. ИСМЕ J
6: 564–576. doi: 10.1038/ismej.2011.116. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

94. Franzenburg S, Fraune S, Altrock PM, Künzel S, Baines JF, Traulsen A, Bosch TC.
2013.
Бактериальная колонизация детенышей Hydra следует строгому временному шаблону. ИСМЕ J
7: 781–790. doi: 10.1038/ismej.2012.156. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

95. Ainsworth TD, Krause L, Bridge T, Torda G, Raina JB, Zakrzewski M, Gates RD, Padilla-Gamiño JL, Spalding HL, Smith C , Вулси Э.С., Борн Д.Г., Бонгертс П., Хёг-Гулдберг О., Леггат В.
2015.
Микробиом ядра коралла идентифицирует редкие бактериальные таксоны как вездесущие эндосимбионты. ИСМЕ J
9: 2261–2274. doi: 10.1038/ismej.2015.39. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

96. He S, Ivanova N, Kirton E, Allgaier M, Bergin C, Scheffrahn RH, Kyrpides NC, Warnecke F, Tringe SG, Hugenholtz P.
2013.
Сравнительный метагеномный и метатранскриптомный анализ микробиоты брюшка задней кишки высших термитов, питающихся древесиной и навозом. PLoS один
8:e61126. doi: 10.1371/journal.pone.0061126. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

97. Консорциум проекта микробиома человека
2012.
Основа для исследования микробиома человека. Природа
486: 215–221. дои: 10.1038/nature11209. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

98. Sankar SA, Lagier JC, Pontarotti P, Raoult D, Fournier PE.
2015.
Микробиом кишечника человека, таксономическая загадка. Сист Аппл Микробиол
38: 276–286. doi: 10.1016/j.syapm.2015.03.004. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

99. Fierer N, Hamady M, Lauber CL, Knight R.
2008.
Влияние пола, рук и мытья рук на разнообразие бактерий поверхности рук. Proc Natl Acad Sci U S A
105:17994–17999. doi: 10.1073/pnas.0807920105. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

100. Jami E, Mizrahi I.
2012.
Состав и сходство микробиоты рубца крупного рогатого скота у отдельных животных. PLoS один
7:e33306. doi: 10.1371/journal.pone.0033306. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

101. Hong PY, Wheeler E, Cann IK, Mackie RI.
2011.
Филогенетический анализ фекального микробного сообщества травоядных наземных и морских игуан Галапагосских островов с использованием пиросеквенирования на основе 16S рРНК. ИСМЕ J
5:1461–1470. doi: 10.1038/ismej.2011.33. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

102. Булгарелли Д., Шлеппи К., Спаепен С., Вер Лорен ван Темаат Э., Шульце-Леферт П.
2013.
Структура и функции бактериальной микробиоты растений. Анну Рев Растение Биол
64:807–838. doi: 10.1146/annurev-arplant-050312-120106. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

103. Whipps JM, Hand P, Pink D, Bending GD.
2008.
Микробиология филлосферы с особым упором на разнообразие и генотип растений. J Appl микробиол
105: 1744–1745. doi: 10.1111/j.1365-2672. 2008.03906.x. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

104. Берендсен Р.Л., Питерс К.М., Баккер П.А.
2012.
Ризосферный микробиом и здоровье растений. Тенденции Растениеводство
17: 478–486. doi: 10.1016/j.tplants.2012.04.001. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

105. Burke C, Thomas T, Lewis M, Steinberg P, Kjelleberg S.
2011.
Состав, уникальность и изменчивость эпифитного бактериального сообщества зеленой водоросли Ulva australis . ИСМЕ J
5: 590–600. doi: 10.1038/ismej.2010.164. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

106. Купман М.М., Fuselier DM, Hird S, Carstens BC.
2010.
Плотоядное растение бледного кувшина содержит различные и зависящие от времени бактериальные сообщества. Appl Environ Microbiol
76: 1851–1860. doi: 10.1128/АЕМ.02440-09. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

Скрытый микробиом укрепляет животных, а также растения — Источник

Микробиом — это совокупность микробов, которые колонизируют среду обитания, человеческое тело или что-то еще. Благодаря новаторским исследованиям микробиома в Медицинской школе Вашингтонского университета в Сент-Луисе люди во всем мире теперь гораздо лучше понимают фундаментальную роль кишечных микробов в здоровье и болезнях человека.

Животным и растениям также необходимы тысячи различных микробов. Хотя об этих ассоциациях известно меньше, новое поколение ученых исследует отношения между скрытой армией микробов и существами, которых они поддерживают и укрепляют. Эти микробы разнообразных экосистем (mDivE-STL) были в центре внимания исследовательского симпозиума 3 октября, организованного организацией Living Earth Collaborative.

В нескольких научно-исследовательских учреждениях Сент-Луиса исследователи изучают как человеческие, так и нечеловеческие микробиомы. Этот симпозиум был организован, чтобы помочь создать сообщество исследователей, изучающих различные микробные системы, и в то же время извлечь выгоду из большого местного опыта человеческого микробиома. 900:03 Посетители внимательно рассматривают «Парки», черепаху, помеченную и отслеженную в рамках проекта St. Louis Box Turtle Project. При поддержке организации Living Earth Collaborative исследователи расширили проект, чтобы охарактеризовать местные микробиомы трехпалых коробчатых черепах. (Фото: Сид Гастингс/Вашингтонский университет)

Возьмем, к примеру, исследователей, изучающих черных обезьян-ревунов ( Alouatta pigra ) в Северной и Центральной Америке. Эти большие харизматичные обезьяны известны тем, что издают один из самых громких криков в тропических лесах Мексики, Гватемалы и Белиза.

Живущие на деревьях травоядные, черные обезьяны-ревуны, питаются в основном листьями деревьев и винограда, цветами и плодами. Поскольку им не хватает ферментов, способных переваривать целлюлозу — углевод, из которого состоит клеточная стенка листа, — черные ревуны полагаются на ферментацию, запускаемую микробиотой их кишечника, чтобы получить необходимую им энергию из этих продуктов.

Весь этот процесс может быть гораздо более динамичным, чем предполагалось ранее, согласно исследованию ученых из Вашингтонского университета. Начинают появляться доказательства того, что микробы кишечника, связанные с питанием, изменяют буферную энергию и доступность питательных веществ для таких животных, как черные обезьяны-ревуны.

Mallott

Элизабет Маллотт, доцент кафедры биологии факультета искусств и наук, использует метаболомику для изучения того, как микробный метаболизм реагирует на изменения в том, что и сколько едят их хозяева. Недавно она провела исследование с популяцией диких черных обезьян-ревунов, которые ежегодно испытывают три разных сезона, влияющих на их рацион: влажный сезон с преобладанием фруктов; сухой сезон с преобладанием листьев; и сухой сезон с преобладанием фруктов.

«Мы видим, что, когда обезьяны едят больше определенного питательного вещества, кишечные микробы больше усваивают это питательное вещество», — сказал Маллотт, первый автор исследования, опубликованного в Molecular Ecology. «Но помимо этого, что было захватывающим, так это то, что мы могли наблюдать за взаимодействием между микробами и метаболитами в разные времена года, включая сезоны, когда обезьяны были ограничены в питании или энергетике пищей, доступной в их среде».

Микробы склонны компенсировать голодные времена, обнаружил Маллотт, отдавая приоритет функциям, обеспечивающим хозяина большим количеством питательных веществ. Но эта система разваливается, когда доступность еды становится действительно ограниченной.

«Тогда микробы, кажется, карабкаются. Они просто пытаются украсть как можно больше питательных веществ друг у друга», — сказал Маллотт, который также изучает, как изменения окружающей среды влияют на микробиом кишечника у людей.

Изучение микробиомов популяций животных, которые процветают в дикой природе, важно, потому что это может предоставить исследователям микробы-кандидаты и микробные консорциумы, которые можно использовать для повышения устойчивости к болезням, усвоения питательных веществ и, в конечном итоге, приспособленности исчезающих видов или животных, которые обитают в деградировавших среда обитания.

Это верно для млекопитающих, включая черных обезьян-ревунов, а также для рептилий, таких как коробчатые черепахи, обитающие в штате Миссури, в том числе те, которых Институт природоохранной медицины зоопарка Сент-Луиса изучал на двух участках в районе Сент-Луиса с 2012 года, как часть проекта St. Louis Box Turtle Project.

Дикая коробчатая черепаха в Исследовательском центре Тайсона, экологической полевой станции Вашингтонского университета. При поддержке организации Living Earth Collaborative исследователи расширили проект St. Louis Box Turtle Project, чтобы охарактеризовать местные микробиомы трехпалых коробчатых черепах. (Фото: Томас Малкович/Вашингтонский университет)

При поддержке организации Living Earth Collaborative исследователи расширяют свои усилия, включив в них описание микробиомов трехпалых коробчатых черепах и изучение их различий внутри популяций и между ними. Ученые из лаборатории Фанцюн Линга, доцента кафедры энергетики, окружающей среды и химической инженерии в Инженерной школе МакКелви, сотрудничают в этом проекте по черепахам, чтобы интегрировать микроорганизмы в набор инструментов для сохранения дикой природы.

«В целом, микробиомы диких животных — бактерии, археи, протисты и вирусы, которые находятся внутри и на теле — являются недостаточно изученным аспектом сохранения биоразнообразия», — сказала Шарон Л. Дим, директор Института охраны природы зоопарка Сент-Луиса. Медицина и Центр охраны Челонии Института дикой природы зоопарка Сент-Луиса.

Дим и Маллотт выступили на исследовательском симпозиуме 3 октября, который был организован Лингом, Гаутамом Дантасом, профессором патологии и иммунологии Медицинской школы, и Джонатаном Лососом, заслуженным профессором биологии Университета Уильяма Х. Данфорта. в области искусств и наук и директор организации Living Earth Collaborative.

Около половины исследований микробиома, которые будут представлены, относятся к животным, растениям и окружающей среде, а остальные более тесно связаны со здоровьем человека.

«Вы не сможете по-настоящему понять микробиом человека и его интересную динамику, если не будете рассматривать его в контексте окружающей среды», — сказал Дантас, который описывает исследование микробиома в своей лаборатории как на 90% сосредоточенное на людях. и 10% в других средах обитания, включая растения, почву и искусственную среду.