Пцр анализ растений. 4. Использование ПЦР-анализа для идентификации трансгенной природы трансформированных растений A. thaliana

Детский сад № 4 "Золотая рыбка"

город Карпинск Свердловской области

 

Тест-системы для диагностики инфекционных заболеваний растений методом ПЦР. Пцр анализ растений


Тест-системы для диагностики инфекционных заболеваний растений методом ПЦР

Наименование Форматы
Форез FLASH Rt
Кольцевая гниль картофеля (Clavibacter michiganensis subsp. Sepedonicus)
Бурая бактериальная гниль (Ralstonia solanacearum)
Вирус скручивания листьев картофеля (Potato Leafroll Virus)
M вирус картофеля (Potato Virus M)
S вирус картофеля (Potato Virus S)
Х вирус картофеля (Potato Virus X)
Вироид веретеновидности клубней картофеля (Potato Spindle Tuber Viroid)
Y вирус картофеля (Potato Virus Y)
A вирус картофеля (Potato Virus A)
Вирус метельчатости клубней картофеля (Potato Mop Top virus)
Андийский вирус крапчатости картофеля (Andean potato mottle virus)  
Андийский латентный вирус картофеля (Andean potato latent virus)  
Бледная картофельная цистообразующая нематода (Globodera pallida)
Золотистая картофельная цистообразующая нематода (Globodera rostochiensis)
Рак картофеля (Synchytrium endobioticum)    
Вирус черной кольцевой пятнистости картофеля (Potato black ringspot virus)  
Комплект реагентов для амплификации кДНК гена актина картофеля
Ризомания сахарной свеклы (вирус некротического пожелтения жилок сахарной свеклы, beet necrotic yellow vein virus)  
Гниль сахарной свёклы (Pseudomonas syringae)  
Ржавчина гороха (Uromyces pisi)*  
Ржавчина гороха (Uromyces fabae)*  
Черная бактериальная пятнистость томатов (Xanthomonas euvesicatoria, ранее Xanthomonas campestris pv. vesicatoria тип А)
Некроз сердцевины стебля томата (Pseudomonas corrugata)
Угловатая пятнистость листьев(Pseudomonas syringae pv. Lacrimans, ранее Pseudomonas lacrimans)
Бактериальный рак томатов (Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis)  
Водянистая гниль плодов (Pectobacterium carotovorum subsp. сarotovorum, син. Erwinia carotovora subsp. carotovora)  
Аскохитоз огурца (Ascochyta cucumis; Phoma cucurbitacearum; Didymella bryoniae)

 

Аскохитоз томата (Ascochyta lycopersici, син. Didymella lycopersici)

 

Грибы рода Ascochyta (Didymella, Phoma)
 
Вирус кольцевой пятнистости томата (Tomato ringspot virus)  
Вирус желтой курчавости листьев томата (Tomato yellow leaf curl begomovirus)уже в продаже    
Вирус бронзовости томата (Tomato spotted wilt virus)уже в продаже    
Септориоз пшеницы (Septoria nodorum)  
Септориоз пшеницы (Septoria tritici)  
Fusarium graminearum  
Fusarium culmorum  
Fusarium sporotrichioides  
Fusarium langsethiae  
Fusarium poae  
Fusarium avenaceum  
Fusarium tricinctum  
Fusarium cerealis  
Fusarium acuminatum*  
Fusarium torulosum*  
Fusarium solani*  
Токсины DON, 3-ADON,15-ADON, NIV, FUSX, ZEA Продуценты: Fusarium graminearum, Fusarium culmorum, Fusarium cerealis  
Токсины T-2, HT-2, DAS, NEO, ZEA Продуценты: Fusarium sporotrichiodes, Fusarium langsethiae  
Токсины NIV, FUSX, T-2, HT-2, DAS, ZEA Продуценты: Fusarium poae  
Токсины MON, BEA, ENN A, B Продуценты: Fusarium avenaceum, Fusarium tricinctum, Fusarium acuminatum, Fusarium torulosum  
Вирус шарки сливы (Plum Pox virus)
Бактериальный ожог плодовых (Erwinia amilovora)
Средиземноморская плодовая муха (Ceratitis capitata)  
Вирус кольцевой пятнистости малины (Raspberry ringspot virus)  
Фитоплазма золотистого пожелтения винограда (Candidatus Phytoplasma Vitis) уже в продаже    
Фитоплазма истощения груши (Candidatus Phytoplasma pyri)уже в продаже    
Фитоплазма пролиферации яблони (Candidatus Phytoplasma mali)уже в продаже    
Вироид латентной мозаики персика (Peach latent mosaic viroid)уже в продаже    
Кольцевая гниль картофеля (Clavibacter michiganensis subsp. Sepedonicus)
Бактериальный ожог плодовых (Erwinia amilovora)
Бурая бактериальная гниль (Ralstonia solanacearum)
Вирус шарки сливы (Plum Pox virus)
Бледная картофельная цистообразующая нематода (Globodera pallida)
Золотистая картофельная цистообразующая нематода (Globodera rostochiensis)
Сосновая древесная нематода (Bursaphelenchus xylophilus)
Сосновая древесная нематода (Bursaphelenchus mucronatus)
Бактериальный вилт кукурузы (Pantoea stewartii subsp. stewartii)
Средиземноморская плодовая муха (Ceratitis capitata)  
Ризомания сахарной свеклы (вирус некротического пожелтения жилок сахарной свеклы, beet necrotic yellow vein virus)
Андийский вирус крапчатости картофеля (Andean potato mottle virus)  
Андийский латентный вирус картофеля (Andean potato latent virus)  
Фомопсис подсолнечника Diaporthe helianthi (Phomopsis helianthi)
Рак картофеля (Synchytrium endobioticum)    
Вирус черной кольцевой пятнистости картофеля (Potato black ringspot virus)  
Вирус кольцевой пятнистости малины (Raspberry ringspot virus)  
Вирус кольцевой пятнистости табака (Tobacco ringspot virus)  
Вирус кольцевой пятнистости томата (Tomato ringspot virus)  
Фитоплазма золотистого пожелтения винограда (Candidatus Phytoplasma Vitis) уже в продаже    
Фитоплазма истощения груши (Candidatus Phytoplasma pyri)уже в продаже    
Фитоплазма пролиферации яблони (Candidatus Phytoplasma mali)уже в продаже    
Вироид латентной мозаики персика (Peach latent mosaic viroid)уже в продаже    
Вирус желтой курчавости листьев томата (Tomato yellow leaf curl begomovirus) уже в продаже    
Вирус бронзовости томата (Tomato spotted wilt virus)уже в продаже    
Бактериальная пятнистость тыквенных культур (Acidovorax citrulli)уже в продаже    
Вирус некротической пятнистости бальзамина (Impatiens necrotic spot tospovirus)уже в продаже    
Комплект реагентов для выделения РНК из растительной ткани «Проба-НК»      
Комплект реагентов для выделения ДНК «Проба-ГС»      
Комплект реагентов для выделения ДНК «Проба – ЦТАБ»      
Комплект реагентов для проведения обратной транскрипции      
Базовые комплекты реагентов для проведения ПЦР (в ассортименте)

www.agrodiagnostica.ru

Сайт компании «АгроДиагностика» / Наборы для ПЦР / Что такое ПЦР?

Полимеразную цепную реакцию (ПЦР, PCR) изобрёл в 1983 году американский учёный Кэри Мюллис, получивший за эту работу Нобелевскую премию. В настоящее время ПЦР широко распространена не только в научно-исследовательских работах, но и является, одним из самых точных и чувствительных методов диагностики, в том числе и инфекционных заболеваний.

В основе метода ПЦР лежит многократное удвоение целевого участка ДНК при помощи термостабильной ДНК-зависимой ДНК-полимеразы. В результате нарабатываются количества ДНК, достаточные для легкодоступного анализа. Важно, что происходит амплификация только того участка, который соответствует исследуемой (диагностируемой) последовательности ДНК, и только в том случае, если он присутствует в исследуемом образце.

Специфичность и применение

ПЦР, как метод молекулярной диагностики, хорошо зарекомендовал себя, проверен временем и тщательно апробирован. Метод ПЦР, в частности, позволяет определить наличие патогена даже в случае, если в пробе присутствует всего несколько молекул нуклеиновой кислоты (ДНК или РНК) диагностируемого возбудителя болезни. ПЦР позволяет выявлять и точно идентифицировать наличие патогенов, включая конкретные штаммы, не прибегая к трудоёмким и, порой, дорогостоящим микробиологическим методам и растениям-индикаторам, что сегодня особенно актуально. Чувствительность и специфичность метода значительно превосходит таковую у иммунохимических и микробиологических методов, а его ключевые принципы позволяют диагностировать наличие инфекций независимо от антигенной изменчивости патогенов.

Сегодня свой выбор в пользу диагностики методом ПЦР-анализа делают в первую очередь на основе того, что данный подход позволяет обнаруживать наличие возбудителей инфекционных заболеваний в тех случаях, когда другими методами (иммунологическими, бактериологическими, микроскопическими) это сделать невозможно. Особенно эффективен метод ПЦР для диагностики трудно культивируемых, некультивируемых и скрыто существующих форм микроорганизмов, с которыми часто приходится сталкиваться при латентных инфекциях.

Специфичность ПЦР основана на образовании комплементарных комплексов между матрицей и специально подобранными высокоспецифичными праймерами — короткими синтетическими олигонуклеотидами длиной 18 — 30 нуклеотидов. Каждый из подбираемых праймеров комплементарен одной из цепей двуцепочечной матрицы, фланкируя с 3’- и 5’-концов амплифицируемый фрагмент ДНК. В зависимости от того какие участки были выбраны для амплификпции (консервативные или вариабельные), можно идентифицировать патоген, как в пределах определенного вида или семейства, так и с точностью до конкретного штамма. Именно от правильности анализа последовательности нуклеотидов целевой ДНК или РНК и сделанного на его основе подбора праймеров зависит специфичность конкретной тест-системы.

В ходе ПЦР на первом этапе под действием высокой температуры (~94°С) происходит денатурация ДНК — разделение антипаралельных цепей двойной спирали. На втором этапе температуру понижают до уровня, при котором праймеры могут комплементарно взаимодействовать с участками геномной ДНК или кДНК (этап отжига праймеров). Если на этом этапе установить слишком низкую температуру, то праймеры будут отжигаться не только на строго специфичных местах и в результате мы получим множество неспецифических фрагментов разного размера. Если же температуру слишком завысить, то праймеры будут «сваливаться» со своего «родного» сайта связывания, в результате чего мы или вообще не получим продукта, или чувствительность тест-системы будет существенно снижена. Поэтому оптимизация температуры отжига в каждом конкретном случае очень важна. На третьем этапе, следующем после отжига праймеров, устанавливают температуру на уровне 64-72°С (значение конкретной температуры оптимизируется) — этот диапазон температур оптимален для используемых в ПЦР термостабильных ДНК-полимераз. На этом этапе и происходит достройка новой цепи ДНК, начиная с праймера (элонгация цепи). Точно воспроизводящийся программируемый цикл денатурация-отжиг-элонгация обеспечивается в специальных приборах — амплификаторах, повторяется 25-45 раз. Поскольку при каждом цикле количество фрагментов ДНК удваивается, то за 35 циклов от одной молекулы ДНК образуется около 1010, что и определяет высокую чувствительность метода, позволяющего достоверно определять присутствие всего 10-100 молекул целевой ДНК в анализируемом материале.

Принцип флуоресцентной детекции

Классический метод детекции результатов ПЦР — электрофорез в агарозном геле в присутствии бромистого этидия. В ходе электрофореза однородные по размеру ПЦР-фрагменты ДНК движутся в геле под действием электрического поля узкой полосой, размер которой можно определить по специальному ДНК-маркеру. Однако следует иметь ввиду, что этот метод, помимо того, что требует времени и больших трудозатрат, обладает еще одним существенным недостатком — практически неизбежной контаминацией продуктами ПЦР-амплификации лабораторного пространства, следствием которой является получение ложноположительных результатов. Борьба с такой контаминацией очень сложна, требует длительного времени и нет гарантий того, что она не будет повториться снова.

Полностью избежать проблем, связанных с контаминацией позволяет применение методов ПЦР в формате FLASH-ПЦР и/или ПЦР в «реальном времени». В этом случае в реакционную смесь добавляется дополнительный олигонуклеотид (зонд) длиной 25-35 нуклеотидов, комплементарный области ДНК между концами амплифицируемого фрагмента, меченный флуорофором и тушителем флуоресценции. Если ПЦР не идет, зонд остается неповрежденным, и, поскольку тушитель «гасит» флуорофор, разгорания флуоресценции не регистрируется. Если же ПЦР имеет место, т. е. в смеси присутствует целевая ДНК, на которой отжигаются праймеры и зонд между ними, ДНК-полимераза при элонгации цепи, встречая зонд, благодаря своей 5’-3′ экзонуклеазной активности разрушает его, флуорофор отделяется от тушителя и мы регистрируем разгорание флуоресценции, интенсивность которой пропорциональна количеству целевой ДНК в анализируемом образце.

Горячий старт

Как было указано ранее, праймеры могут неспецифично отжигаться на различные, только частично комплементарные им участки ДНК, что происходит и при раскапывании реакционной смеси для ПЦР до постановки пробирок в термоблок амплификатора. Чтобы этого не происходило применяют так называемый «горячий старт». Его осуществление возможно разными способами: физическое разделение смеси, применение модифицированных ферментов. В наших тест-системах используется разделение компонентов реакции слоем парафина. При прогреве смеси до 70°С парафин не дает смешаться компонентам реакции и неспецифического отжига праймеров не происходит.

Внутренний контроль

Внутренний контроль (ВК) позволяет оценить корректность постановки реакции и работоспособность всех компонентов тест-системы. В наших тест-системах используется экзогенный ВК. В реакционную смесь добавляют праймеры и ДНК-матрицу внутреннего контроля в концентрации, не позволяющей амплификации ВК подавлять процесс амплификации фрагментов ДНК диагностируемого патогена.

Размер продуктов амлификации ВК всегда составляет 560 пар нуклеотидов, в то время, как размер продуктов амплификации фрагментов ДНК определяемых патогенов лежит в диапазоне 100-400 пар нуклеотидов. Это обстоятельство позволяет четко различать ампликоны при анализе результатов методом гель-электрофореза. В модификациях ПЦР «в реальном времени» и FLASH-ПЦР детекция сигнала ВК осуществляется в канале HEX, в то время как детекция сигнала амплификации фрагментов ДНК определяемого патогена — в канале FAM.

Независимо от амплификации фрагментов ДНК определяемого патогена всегда должен присутствовать сигнал амплификации ВК. Его отсутствие указывает на то, что либо не были добавлены какие-либо компоненты (в этих случаях сигнал ВК отсутствует во всех пробирках поставленных реакций), либо в выделенной ДНК/РНК присутствуют ингибиторы ПЦР. В последнем случае сигнал ВК присутствует в образце отрицательного контроля, но отсутствует в пробирках с исследуемыми образцами.

Этапы ПЦР-анализа

ПЦР-анализ состоит из следующих этапов. 1. Выделение нуклеиновой кислоты (ДНК или РНК, далее — НК). На данном этапе растительную ткань гомогенизируют и выделяют тотальную НК (как определяемых патогенов, так и растения-хозяина), очищая ее от других соединений, в том числе являющихся ингибиторами ПЦР. Выделение РНК следует проводить только из свежих тканей. Этап занимает около 1-2 часов (время зависит от количества образцов).

1′ (Только для РНК содержащих вирусов). Проведение реакции обратной транскрипции. Так как вирусы растений в большей части являются РНК-содержащими, необходимо провести реакцию обратной транскрипции для наработки на матрице РНК комплементарной ДНК (кДНК). Для проведения реакции обратной транскрипции можно использовать набор производства ООО «АгроДиагностика». Время проведения этого этапа около 1 часа. Для проверки качества выделения РНК ООО «АгроДиагностика» предлагает использовать тест-систему на мРНК гена актина картофеля. Для постановки реакции обратной транскрипции можно использовать другой набор производства ООО «АгроДиагностика» — Комплект реагентов для проведения обратной транскрипции.

2. Постановка ПЦР и анализ результатов. В ходе этого этапа происходит амплификация специфического участка генома патогена (и/или внутреннего контроля). Гомогенные продукты, накопленные в ходе амплификации, можно детектировать различными способами.

При использовании тест-систем на основе ПЦР «в реальном времени» на этом этапе анализ заканчивается. Длительность всего этапа около 2 часов.

При использовании тест-систем в формате FLASH необходимо перенести пробирки в детектор «Джин» и провести детекцию. Длительность этого этапа не более 10 минут.

В случае использования тест-систем с детекций результатов методом электрофореза необходимо провести электрофоерез в агарозном геле в присутствии бромистого этидия. Визуализацию результатов проводят под УФ транслюминатором на длине волны 312 нм. Длительность этапа около 1 часа.

 схема ПЦР

С более подробной информацией о методе ПЦР, его модификациях, особенностях и др. можно ознакомиться на целом ряде сайтов в интернете, в том числе на сайте https://ru.wikipedia.org/wiki/

Все компоненты, необходимые для ПЦР-диагностики конкретного патогена, присутствуют в соответствующих наборах. Необходимо добавить выделенную из образца тотальную ДНК или, в случае диагностики РНК-содержащих вирусов, кДНК синтезированную на выделенной из анализируемого образца тотальной РНК. Все подробности проведения ПЦР и анализа результатов имеются в прилагаемых к наборам инструкциях.

www.agrodiagnostica.ru

Сайт компании «АгроДиагностика»

ООО "АгроДиагностика" совместно с АНО «АВТех» (Автономная некоммерческая организация «Аналитика и высокие технологии») проводят курс повышения квалификации «Молекулярно-генетическая диагностика и современная практика: методы ПЦР и секвенирования» со 2 по 5 октября 2018 г. в Москве. Приглашаются все желающие. Подробная информация и запись на курс по адресу: http://www.awtec.ru/courses/808/

Тренинги организуются по мере набора групп

Статья Сергея Кириаковича Завриева - Здоровье растений обеспечит Агродиагностика «Здоровье растений обеспечит АгроДиагностика»

Статья из журнала "Актуальные Агросистемы", №5, май 2018 г.

Скачать статью полностью в PDF (1,3 Мегабайта)

О компании

ООО «АгроДиагностика» предлагает инновационное оборудование и комплекты реагентов для выявления и идентификации широкого спектра патогенов, вызывающих болезни растений и детекции генно-модифицированных источников (ГМИ). В основе диагностических наборов, производимых компанией, лежит метод полимеразной-цепной реакции (ПЦР), разработанный в 1983 году американским ученым Кэри Мюллисом, получившим за свое открытие Нобелевскую премию. В настоящее время ПЦР-диагностика является одним из наиболее точных и чувствительных методов молекулярной диагностики.

Все комплекты реагентов производства ООО «АгроДиагностика» испытаны и сертифицированы в профильных научных учреждениях, совместно с которыми были разработаны методические указания.

Предлагаемые наборы не имеют аналогов в России и за ее пределами как по качеству и надежности диагностики, так и по широте спектра диагностируемых возбудителей болезней.

Наше производство

Наборы ООО «АгроДиагностика» производятся на Российском предприятии в условиях, отвечающих мировым стандартам GMP (Good Manufacturing Practice), с внедренной системой качества менеджмента ISO 13485 и ISO 9001, что исключает возможность контаминации компонентов наборов и обеспечивает высокий уровень продукции, полностью отвечающий принятым мировым стандартам.

Продукция ООО Агродиагностика производится на Российском предприятие

www.agrodiagnostica.ru

что это такое, показания и подготовка к исследованию

Метод полимеразной цепной реакции, или ПЦР, используется в лабораторной диагностике большинства инфекционных заболеваний. Он позволяет обнаружить в исследуемом материале генетический материал микроорганизмов и таким образом идентифицировать их.

Что это такое

Метод был разработан в 1983 году, а в 1993 году его автор – Мюллис – получил Нобелевскую премию.

Основы метода

ПЦР-анализ обнаруживает в исследуемом материале уникальный генетическй материал, позволяющий идентифицировать микроорганизм.

Каждый вид микроорганизмов, растений или животных имеет уникальный набор хромосом. Они образованы ДНК – дезоксирибонуклеиновой кислотой. Мелкие фрагменты ДНК называются нуклеотидами, а их определенная последовательность составляет ген. Каждый ген кодирует синтез одного белка, например, коллагена, альбумина и всех остальных. Последовательность нуклеотидов уникальна. Для каждого вида живых организмов существуют общие участки ДНК, отвечающие за однообразие в пределах этого вида.

Анализ ДНК нескольких сотен микробов, попавших в материал для исследования, не позволит выявить видовые закономерности. Необходимо во много раз увеличить количество значимых генетических компонентов, что даст возможность их идентифицировать. Эту задачу и решает метод ПЦР.

Исследование относится к области молекулярной биологии. К ДНК микроба добавляются ДНК-полимераза и свободные нуклеотиды. Полимераза – фермент, обеспечивающий многочисленное копирование нужного участка из имеющихся нуклеотидов. Запускают процесс праймеры – короткие нити рибонуклеиновой кислоты (РНК), прикрепляющиеся к началу нужного гена.

Процесс анализа состоит из нескольких фаз, каждая из которых требует определенного времени и температурного режима. В течение нескольких часов из тысячной доли грамма ДНК бактерий получается нужное количество материала для анализа. Современная аппаратура дает возможность многократно копировать ДНК даже одной клетки, например, сперматозоида.

Ход исследования

Этапы анализа:

  • взятие биологического материала (крови, мочи, влагалищных выделений, слюны и так далее) у пациента и доставка в лабораторию;
  • разделение двух нитей ДНК, переплетение которых образует хромосому, и очищение их от посторонних примесей;
  • удвоение нужного участка нити ДНК, в результате ее количество растет в геометрической прогрессии;
  • обработка полученного материала растворами, вызывающими специфическое свечение полученных фрагментов ДНК, по этому окрашиванию распознают, какая бактерия или вирус были в источнике; для разделения фракций ДНК используют электрофорез.

Длительность анализа составляет 4-5 часов.

Преимущества метода ПЦР

Полимеразная цепная реакция обладает такими преимуществами перед традиционными способами определения возбудителей инфекции:

  • прямое определение генов микроорганизма, в отличие от выявления антител к нему при многих других способах идентификации;
  • специфичность, то есть определение конкретного вида возбудителя;
  • чувствительность: для диагностики бывает достаточно даже одной клетки микроорганизма; в целом требуемое количество возбудителя в 10 раз меньше, чем для других методов;
  • универсальность биоматериала – исследуется не только кровь, но и клетки плотных тканей, соскобы с эпителия, слизистые выделения и любые другие среды, где может быть микроб;
  • скорость получения результата в несколько раз выше, чем при использовании других методов;
  • возможность распознавания хронических, вялотекущих и скрытых инфекций;
  • дезинфекция взятого у больного материала и исключение заражения сотрудников лаборатории;
  • полная автоматизация процесса исследования.

Недостатки анализа

Минусы ПЦР связаны в основном с ее технической сложностью:

  • необходимо правильно выбрать последовательности РНК – праймеры, а также приготовить смесь нуклеотидов для синтеза ДНК;
  • метод очень чувствителен, поэтому если в образце есть разные виды микробов, он может давать неверные результаты;
  • нужно тщательно очищать анализируемый материал от примесей белков человека и лекарств, так как они снижают точность диагностики;
  • требуется контрольное сравнение результатов с образцами, заведомо содержащими или не содержащими материал микроорганизмов, а также вообще не включающими ДНК для определения ошибок и загрязнений.

Ложноотрицательные результаты ПЦР вызваны нарушением техники анализа и изменениями в генетической последовательности любого из компонентов реакции. Встречаются и ложноположительные данные – при случайном совпадении нуклеотидов праймеров и других применяемых реактивов с одним из генов микроорганизма.

Выделение микроорганизма не всегда говорит о том, что именно он стал причиной болезни. При анализе ДНК человека существует еще одна проблема: генетическая основа большинства заболеваний до сих пор неизвестна, что пока делает невозможной диагностику неинфекционной патологии на микробиологическом уровне. Это направление медицинской генетики очень активно развивается.

Показания для ПЦР-исследования

В большинстве случаев ПЦР-диагностику применяют у лиц с инфекционными заболеваниями с целью определения микроорганизма, вызвавшего болезнь.

Этот анализ используется в таких ситуациях:

  • необходимость выявления и идентификации вирусов, бактерий, простейших при любых инфекционных заболеваниях, когда требуется точность диагностики;
  • диагностика генетических заболеваний человека;
  • идентификация личности путем сравнения с генетическим материалом известного происхождения;
  • анализ тканей, полученных путем тонкоигольной биопсии, которые очень трудно исследовать другими методами;
  • диагностика лейкозов и злокачественных опухолей;
  • проведение экспериментов с приживляемостью эмбриональных стволовых клеток у животных (у людей применение таких клеток запрещено), а также выведение линий лабораторных мышей с заранее заданным генетическим заболеванием.

Перспективы применения ПЦР-реакции и ее разновидностей в медицине и биологии захватывают воображение – от испытания новых лекарств на генном уровне до создания трансгенных организмов с заданными свойствами. Работы в этом направлении ведутся в крупнейших лабораториях мира, что помогает совершенствовать метод ПЦР и на прикладном уровне, для диагностики инфекционных болезней человека.

В медицине ПЦР-метод обычно используется для диагностики и оценки эффективности лечения таких заболеваний:

Подготовка к исследованию

За 3 дня до выполнения исследования необходимо отказаться от употребления спиртных напитков. По назначению врача отменяются некоторые лекарственные препараты, например, антибиотики.

Правила подготовки при диагностике половых инфекций:

  • за 2 дня до анализа прекратить половые контакты;
  • за 2 часа до исследования не мочиться;
  • накануне вечером и утром не спринцеваться; подмываться только теплой водой без моющих средств;
  • не сдавать ПЦР во время менструации и в течение 4 дней после кольпоскопии (у женщин).

Общие правила подготовки:

  • за 2 дня исключить интенсивные физические нагрузки, занятия спортом;
  • с утра в день исследования не курить и не употреблять пищу;
  • если материал будет браться из полости рта и носоглотки – утром не чистить зубы.

От выполнения этих простых правил зависит достоверность этого точного, но недешевого метода диагностики. Самостоятельная интерпретация результата не даст нужной информации о болезни и ее лечении. Вот поэтому после получения данных ПЦР-исследования необходимо обратиться к врачу.

К какому врачу обратиться

При подозрении на венерическое заболевание на ПЦР направляет гинеколог, уролог, андролог, венеролог. Исследование при гепатитах и ВИЧ-инфекции назначает инфекционист, при туберкулезе – фтизиатр. ПЦР в своей практике используют врачи многих специальностей, например, онкологи, гематологи, гастроэнтерологи, генетики.

Полезная информация о ПЦР-анализе:

Врач-венеролог, уролог Ленкин С. Г. рассказывает о ПЦР-анализе:

ПЦР анализ на инфекции. Зачем сдавать? Как подготовиться? Как сдать?

Watch this video on YouTube Загрузка...

Посмотрите популярные статьи

myfamilydoctor.ru

4. Использование ПЦР-анализа для идентификации трансгенной природы трансформированных растений A. thaliana. Проведение экспериментов по инсерционному мутагенезу на практических занятиях

Похожие главы из других работ:

Биологическое значение белка

V. МЕТОДЫ ВЫДЕЛЕНИЯ И АНАЛИЗА БЕЛКА

Препараты высокоочищенных белков находят разнообразное применение в научных исследованиях, медицине и биотехнологии. Так как многие белки, и в особенности глобулярные, высоколабильны...

Вегетативное размножение хвойных растений

1.1 Использование хвойных растений в озеленении

Очень трудно представить парк или сад без хвойных растений. Хвойные растения - это лучшее украшение любого сада, его изюминка, неотъемлемая составляющая современного сада. К достоинствам хвойных растений следует отнести их долговечность...

Генетически модифицированные организмы. Принципы получения, применение

2.3 Использование трансгенных растений

Несмотря на впечатляющие достижения генетической инженерии в области медицины, наибольший резонанс в обществе, однако, вызвало применение генетически модифицированных организмов для производства сельскохозяйственной продукции...

Генно-инженерная технология

1.2 Методы идентификации трансгенов

Увеличение использования ГМО и их компонентов в производстве продуктов питания, сельскохозяйственных кормов и фармацевтических препаратов делает всё более актуальным вопрос разработки эффективных методов идентификации трансгенной ДНК...

Идентификация генов – основная задача нового этапа развития генетики

2. Основные методы идентификации генов растений

В настоящее время разработан ряд эффективно работающих методов идентификации генов растений. Большинство этих методов используются и для идентификации генов у животных...

Инсерционный мутагенез – основной метод идентификации генов

8. Методы трансформации A. thaliana с помощью Agrobacteriumtumefaciens

Молекулярно-генетические механизмы агробактериальной трансформации подробно описаны в целом ряде публикаций (Пирузян, 1988; Дрейпер и др., 1991; Лутова и др., 1998;Чумаков, 2001)...

Мезофауна почв окрестностей села Изюмовка Шербакульского района Омской области

3.1 Результаты анализа почв

С целью установления зависимости состояния мезофауны от качества среды обитания нами был проведен ряд исследований физических и химических свойств почвы, взятой на выбранных для исследования площадках...

Методы и условия культивирования изолированных клеток и тканей растений

1. Вспомогательное использование методов in vitro в селекции растений

В отдаленной гибридизации находят применение такие методы культуры изолированных тканей, как оплодотворение in vitro, эмбриокультура (выращивание изолированных зародышей на искусственных питательных средах)...

Население жужелиц (Coleoptera, Carabidae) п. Тарногский Городок

1. НАСЕЛЕНИЕ ЖУЖЕЛИЦ ЕСТЕСТВЕННЫХ И ТРАНСФОРМИРОВАННЫХ СООБЩЕСТВ ПРИРОДНОЙ ЗОНЫ ТАЙГИ.

...

Прибрежно-водная растительность Адлерского района города-курорта Сочи

3.5 Методы химического анализа

Индикатор состояния водных объектов в зоне воздействия промышленного предприятия (по ИЗВ). Геохимическая обстановка на любом природном объекте является косвенной оценкой его экологического состояния. Так...

Проведение экспериментов по инсерционному мутагенезу на практических занятиях

1. Трансформация Arabidopsis thaliana с помощью векторов на основе Ti-плазмиды Agrobacterium tumefaciens

Исходный растительный материал. В экспериментах по трансформации используются семена или растения расы Dijon или Kцln. Для трансформации семян необходимы свежие семена с 95-100% всхожестью. Обычно в эксперименте используют 4-5 тыс. семян...

Трансформация бактерий как основа генной инженерии и молекулярного клонирования

5. Практическое применение трансформированных микроорганизмов

Важной составной частью биотехнологии является генетическая инженерия. Родившись в начале 70-х годов, она добилась сегодня больших успехов. Методы генной инженерии преобразуют клетки бактерий...

Физико-химические свойства воды и грунта

2.2 Проведение анализа

Точно отмеряют 50 мл исследуемой воды и добавляют несколько капель раствора метилового оранжевого. При титровании в растворе произойдут следующие реакции: Размещено на http://www.allbest.ru/ Сравним это и приведенное выше уравнение, которое показывало...

Фотосинтез и необходимые для него условия

Роль голосеменных растений в растительном покрове. Их использование и охрана

Голосеменные растения (лат. Gymnospermae) - группа семенных растений, к которой относятся хвойные и им подобные растения. Ныне живущие голосемянные подразделяются на четыре класса: саговниковые, гнетовые, гинкговые и хвойные...

Частная микробиология, систематика и методы идентификации бактерий рода Mycobacterium

8. Среды для выделения и идентификации микобактерий

Выделение возбудителя является более эффективным, чем бактериоскопия, и позволяет выявить 20 - 100 и более микобактерий в 1 мл исследуемого материала, а также определить их устойчивость к лекарственным препаратам, вирулентность...

bio.bobrodobro.ru

ПЦР (ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ) КАК МЕТОД ИССЛЕДОВАНИЯ В ДНК-ДИАГНОСТИКЕ

Диагностика инфекционных заболеваний

ДНК-диагностика – новая область медицины, использующая молекулярно-генетические методы для ранней диагностики заболеваний, выявления предрасположенности к ним и профилактических рекомендаций.

Развитие таких технологий амплификации ДНК как ПЦР, произвело буквально революцию в клинической вирусологии, позволив быстро, точно и достаточно просто определить наличие вирусов в образце, поскольку известны последовательности ДНК многих болезнетворных микроорганизмов. Можно создать два праймера ПЦР, соответствующих последовательности исследуемого патогена (например, вируса) и расположенных на известном расстоянии на ДНК. Если затем выполнить ПЦР с использованием этих праймеров и с помощью гель-электрофореза провести анализ полученных продуктов, то в случае принадлежности исследуемого образца тому же вирусу, мы получим фрагмент, длина которого соответствует взятой для сравнения последовательности ДНК. Высокая специфичность ПЦР обусловлена тем, что в исследуемом материале появляется характерный только для данного вида возбудителя фрагмент ДНК.

Выявляя единичные клетки бактерий или вирусов, ПЦР-диагностика обнаруживает наличие возбудителей инфекционных заболеваний в тех случаях, когда другими методами (иммунологическими, бактериологическими, микроскопическими) это сделать невозможно.

В клинической практике метод ПЦР часто используется для выявления вирусных гепатитов, опасных для человека, таких как: А , В , С, "Проведение типирования вируса гепатита С" , Дельта , Е, G , TTV.

Важную роль метод играет в диагностике заболеваний, передающихся половым путем (ЗППП). Этиологическим фактором являются вирусы, бактерии и простейшие.

К таким заболеваниям можно отнести появление доброкачественных аногенитальных бородовок (кондилом) , вызываемых вирусом папилломы человека (ВПЧ). Такие бородавки обычно появляются на участках, травмированных во время полового контакта. Генотипы ВПЧ 6 и 11 обнаруживаются более чем в 90% случаев. Такие пациенты могут быть одновременно инфицированы и ВПЧ типа 16 и 18, которые являются источником субклинических поражений, сочетающихся с внутриэпителиальной неоплазией и аногенитальным раком. Имеются доказательства, что папилломавирусы, относящиеся к высокоонкогенным (папилломавирусы высокого онкогенного риска - 16,18, 31,33,35, 39,45, 51, 56, 58, 59, 68), являются этиологическим фактором возникновения рака шейки матки.

К заболеваниям передающихся половым путем относятся также и гепатиты В и С. Высокой степени риска инфицирования подвержены гомосексуалисты, лица занятые в сфере оказания сексуальных услуг.

К наиболее распространенным инфекция, передающихся половым путем и диагностируемых методом ПЦР, являются урогенитальные инфекции, вызываемые патогенным микроорганизмом как у мужчин, так и у женщин - Chlamydia trachomatis (хламидия трахоматис). Их диагностика особенно важна для установления диагноза и лечения у лиц с бессимптомным течением. Выявление хламидий трахоматис важно также для установления этиологического фактора, вызвавшего у мужчин орхоэпидидимит (в таких случаях одновременно следует проводить и диагностику методом ПЦР на выявлении гонореи –Neisseria gonorrhoeae). Обнаружение хламидий является важным моментом для диагностики воспалительных заболеваний малого таза у женщин: сальпингита (воспаление маточных труб), эндометрита, параметрита, оофорита (воспаление яичников), тазового перитонита. Другим распространенным инфекционным агентом является бактерия, относящаяся к виду микоплазм - уреаплазма, как правило, передающаяся половым путем (Ureaplasma urealyticum) и ее клинически значимые биовары Parvum/T960, вызывающие воспалительные заболевания органов мочевыделительного тракта и их осложнения: простатит, бактериальный вагиноз, бесплодие.

Применения метода ПЦР оправдано для выявления этиологического фактора уретрита. При гонококковом уретрите методом ПЦР выявляют Neisseria gonorrhoeae. Причиной негонококковых уретритов чаще бывают - Chlamydia trachomatis (в 30-50% случаев), Ureaplasma urealyticum и Mycoplasma genetalium (возможно 10-20% случаев). К другим факторам негонококковых уретритов можно отнести Trichomonas vaginalis(до 17% случаев) - жгутиковое постейшее, передающееся у взрослых практически только половым путем , а также грибки рода Candida albicans (кандида), вызывающие вульвовагинальный кандидоз.

Хотя бактериальный вагиноз (при синдроме влагалищных выделений) не относится к заболеваниям передающимся половым путем, методом ПЦР диагностики при этом заболевании можно выявить таких микроорганизмов как, Gardnerella vaginalis, Mycoplasma hominis, Mobiluncus, избыточная концентрация которых приводит к замещению молочнокислых бактерий влагалища и увеличению рН среды.

К числу распространенных заболеваний, передаваемых половым путем, относятся заболевания вызываемые вирусом герпеса 2 типа (ВПГ-2 - генитальный герпес), который в классических случаях проявляется появлением типичных папулезных высыпаний, переходящих в пузырьки и изъявления, а также местным лимфаденитом. Следует учитывать, что и вирус простого герпеса 1 (ВПГ- 1) также выявляется при поражении гениталий. Герпес ВПГ 1 является причиной, так называемого орально-лабиального герпеса, и вызывает герпес слизистых, кожи, герпетические энцефалиты, офтальмогерпес.

Инфицирование любым из этих двух вирусов приводит к развитию сходного первичного заболевания. Но частота рецидивов заболевания выше при инфицировании герпесом второго типа. Клинические признаки заболевания у пациентов существенно различаются. Инфицирование герпесом может протекать, например, в виде дерматозов или других генитальных инфекций. Поэтому лабораторная диагностика, и в частности ПЦР-метод, является важным приемом в установлении этиологического фактора болезни и назначении соответствующего лечения.

К другим герпес-вирусам, тропным для человека и выявляемым при помощи ПЦР, относится вирус герпеса 3 типа – вызывающий ветряную оспу и опоясывающий лишай. Вирус герпеса 4 типа – вирус Эпштейн-Барр является причиной инфекционного мононуклеоза, а также ассоциируется с лимфомой Беркита и назофарингеальной карциномой. Вирус герпеса 5 типа – вирус цитомегалии (ЦМВ), является причиной поражения печени, центральной нервной системы, возникновением интерстициальной пневмонии и нефритов, опасен для плода в ранние сроки заражения матери при беременности (выкидыши, мертворождения, рождения с пороками органов и систем). Вирус герпеса 6 и 7 типов (лимфотропные вирусы) относятся к вирусам, ассоциированным с синдромом хронической усталости. Вирус герпеса 8 типа – этиологический фактор саркомы Капоши (часто ассоциируемой с ВИЧ инфекцией).

С появлением ПЦР стало возможным количественное определение вирусной нагрузки (уровня виремии), что особенно важно при острых и персистирующих инфекциях, так как просто детекция вируса не дает всей необходимой информации о течении болезни. К тому же определение вирусной нагрузки позволяет следить за лечением и возникновением резистентности к терапевтическим средствам.

Самое широкое распространение методы ПЦР получили в диагностике таких инфекционных заболеваний, как СПИД (вызываемого ретровирусом ВИЧ), клещевой энцефалит, туберкулез, токсоплазмоз, листериоз, краснуха, вирус, вызывающий инфекционную эритему (парвовирус В19),. гемолитический стрептококк, хеликобактер пилори (Helicobacter pylori – этиологический фактор возникновения язвы желудка). ПЦР диагностике подлежат такие вирусы как: аденовирус, риновирус, респираторно-синцитиальный вирус, коронавирус, метапневмовирус, вирус парагриппа, вызывающие поражение дыхательных путей и заболевания протекающие у детей часто в виде энтеритов (клиника дизентерии – боли в животе, поносы). При поражении дыхательных путей (пневмонии) метод ПЦР часто используется для идентификации этиологически значимых микроорганизмов в мазках из зева: Chlamydia pneumonia , Mycoplasma pneumonia , Streptococcus pneumonia (при подозрении на стрептококковую пневмонию). У детей использование ПЦР метода, наряду с бактериологическими и серологическими методами диагностики, позволяет установить или опровергнуть диагноз коклюша и обнаружить токсигенные штаммы дифтерии ( Corynebacterium diphtheriae ).

Очень важно, что часто, нет необходимости дожидаться симптомов болезни. Например, видимые симптомы СПИДа проявляются иногда спустя несколько лет после заражения вирусом. Тем не менее, можно провести анализ ДНК в образцах крови, используя праймеры ПЦР, соответствующие последовательностям, которые присутствуют только в геноме ВИЧ. Особую ценность для диагностики ВИЧ-инфекции ПЦР имеет на двух этапах: в самом начале, когда инфицирование уже произошло, а антитела еще не успели образоваться, и на поздних стадиях заболевания, когда количество антител может снижаться вплоть до полного исчезновения. К тому же количественное определение РНК ВИЧ позволяет оценить варианты противовирусной терапии и осуществить индивидуальный подбор противовирусных препаратов.

ПЦР позволяет диагностировать наличие долго растущих возбудителей, не прибегая к трудоёмким микробиологическим методам. Примером этому является туберкулез. В отличие от многих бактерий, микобактерия, вызывающая это заболевание, растет очень медленно. Ее культивирование для выполнения классических диагностических испытаний может занять примерно месяц, в то время как идентификация микобактериальной ДНК с помощью ПЦР может быть выполнена в течение одного дня.

Метод ПЦР эффективен как в отношении внутриклеточных паразитов, выявленных как в клиническом материале, полученном от больного, так и в образцах воды, почвы и т.д.

 

www.smed.ru

ПЦР анализ что это такое: расшифровка, как делают, цена

Ответить на вопрос: «Что это такое, ПЦР анализ?» – можно в нескольких словах. Полимеразная цепная реакция является методом лабораторных исследований, который используют для определения присутствия ДНК возбудителей болезней в любой из жидких сред организма, куда этот ДНК может проникнуть: кровь, моча, слюна, сопли, выделения из половых органов, кал.

Благодаря этому ПЦР обладает намного большей чувствительностью к патогенам по сравнению с другими методами исследования. Например, иммуноферментный анализ может показывать отрицательный результат на наличие бактерии или вируса, тогда как ПЦР анализ даст положительный в силу большей чувствительности.

Как проводят анализ?

исследование

исследованиеКлючевым понятием метода является понимание того, что каждое живое существо, будь то человек, животное, растение, паразит, бактерия или вирус, содержит генетический материал (ДНК или РНК), последовательность структур которых являются уникальным как для вида, так и для отдельного индивидуума. Таким образом, если в исследуемом образце есть ДНК или РНК, благодаря полимеразной цепной реакции есть возможность многократно увеличить их количество для того, чтобы повысить вероятность их идентификации. Это позволяет по микрочастицам определить конкретного человека, животное или микроорганизм.

Процесс амплификации (так называют увеличение количества копий ДНК) – лишь одна из частей анализа. После того, как произведена реакция, амплифицированные сегменты надо сравнивать с другими нуклеотидными частями, которые принадлежат источнику (например, человеку или патогену).

Это сравнение уникальных сегментов производят в желеобразной среде путём сопоставления нуклеотидных звеньев, которые генерируются анализатором ПЦР с искомыми нуклеотидными звеньями конкретного человека или микроорганизма. После того, как через эту среду пропускают электрический ток, нуклеотидные звенья связываются друг с другом, образуя цепочки ДНК, которые группируются в изучаемой среде, что позволяет произвести их идентификацию.

Туберкулез, ВИЧ и ПЦР

Особо ценен метод ПЦР при диагностике болезней, обнаружить которые непросто на начальной стадии. Например, возбудители туберкулёза тяжело выявляются простыми методами исследования, тогда как ПЦР способен обнаружить как живых, так и погибших возбудителей болезни.

женщина у врача

женщина у врача

Очень важно значение метода ПЦР при обнаружении вируса иммунодефицита. Методы анализа, которые использовались ранее для диагностики ВИЧ-инфекции, основывались на присутствии в крови антител. Такой метод имеет минусы, поскольку антитела против этой опасной болезни могут появиться лишь спустя месяцы после проникновения в организм инфекции. А если речь идет о грудничках, сложность в идентификации вируса еще и в том, что материнские антитела в крови могут замаскировать наличие ВИЧ-инфекции у новорожденного.

ПЦР диагностирует это заболевание значительно быстрее, поскольку способен обнаружить всего один геном вируса на пятьдесят тысяч клеток. При этом высокая специфичность анализа позволяет нацелиться на определение именно возбудителя вируса иммунодефицита.

ПЦР и мочеполовая система

Широкое распространение метод ПЦР получил в исследовании функционирования мочеполовой системы женщин и мужчин. Анализ мочи в данном случае представляет собой поиск в урине ДНК возбудителей инфекций. Огромным преимуществом ПЦР является то, что исследование мочи этим методом способно обнаружить все половые болезни. Кроме того, этот анализ способен выявить возбудителя туберкулёза, который не относится к половым инфекциям. Стрептококки и некоторые вирусы также определяются по анализу ПЦР во взятом образце мочи.

моча

моча

Исследование анализа мочи само по себе является точным диагностическим показателем. Но гораздо лучше, если он дополняется анализом ПЦР мазка, поскольку изучение мочи показывает возбудителей болезни лишь в том случае, если патоген локализуется в местах, через которые проходит моча. А именно, через:

  • почки;
  • мочеточники;
  • мочевой пузырь;
  • уретру.

Если возбудитель болезни находится в предстательной железе или яичках у мужчин или в матке у женщин, проба мочи на ПЦР не покажет присутствие инфекции. В этом случае нужно брать мазок из предстательной железы у мужчин или из шейки матки у женщин.

В целом в лабораториях, которые специализируются по анализу мочи методом ПЦР, возможно определить несколько десятков различных инфекций. Для анализа сдаётся первая порция мочи, поскольку в это время концентрация бактерий в ней максимальна. К сбору мочи надо приступать с утра. Перед этим желательно не принимать антибиотики, противовирусные препараты в течение двух недель. Если это невозможно, необходимо посоветоваться с врачом.

ПЦР и мазок

ПЦР используется в гинекологии и андрологии как высокоточное средство обнаружения инфекции. Как у женщин, так и у мужчин этот метод применяется для диагностики урогенитальной инфекции. Для анализа со слизистой оболочки органов женщины берётся мазок на ПЦР со слизистой оболочки матки и влагалища, у мужчин – с передней уретры.

Показаниями к проведению ПЦР у женщин и мужчин являются:

  • Выяснение причин бесплодия.
  • Болезни, передающиеся половым путём.

Анализ мазка у женщин и мужчин методом ПЦР позволяет выявить такие инфекционные заболевания, как хламидии, молочница, трихомонады, гепатит, вагиноз, мононуклеоз, микоплазмоз, рак и другие заболевания. Особенно опасны для женщин болезни, передающиеся половым путём, поскольку они могут оказать негативное влияние на здоровье ребёнка. Поэтому анализ ПЦР при беременности является обязательным в гинекологии.

анализ

анализ

Перед проведением ПЦР анализа женщина должна хорошо подготовиться. Прежде всего, за месяц перед анализом нужно прекратить употребление лекарственных препаратов. Во время месячных этот анализ не проводят.

Изучение экскрементов

Анализ кала методом ПЦР также позволяет изучить немало показателей. Дело в том, что кал являет собой шлаки, остатки непереваренной пищи, различных продуктов распада, которые организм выводит через кишечник в процессе жизнедеятельности. Поэтому если кал разложить на составляющие, в нем можно найти вещества, позволяющие исследовать состояние пищеварительного тракта, функционирование жёлчного пузыря, обнаружить кровотечения.

Здесь же присутствуют различные бактерии, гельминты и другие паразитические микроорганизмы. Вот почему не удивительно, что застой кала в толстой кишке способен вызвать отравление организма.

Во время исследования кала преимущество метода ПЦР перед другими анализами в том, что полимеразная цепная реакция способна определить непосредственное присутствие в кале возбудителей болезни по ДНК патогена. Тогда как остальные способы исследования лишь косвенно, по следам отходов жизнедеятельности обнаруживают их присутствие в кале. Ещё одним преимуществом метода ПЦР при исследовании кала являются высокая чувствительность и скорость получения результата.

Что это такое – анализ методом ПЦР?

Что это такое – анализ методом ПЦР?

Например, метод ПЦР во время исследования кала быстро позволяет обнаружить у женщин и мужчин такое широко распространённое заболевание, как лямблиоз. Известно, что лямблии даже если присутствуют в организме, могут годами ничем не выдавать своего присутствия.

Во время сдачи кала на ПЦР пациент должен особенно четко придерживаться правил личной гигиены. Во время забора материала он должен проследить, чтобы в образец кала не попали посторонние вещества (например, следует избегать попадания мочи).

Интерпретация данных

Если говорить о расшифровке анализов ПЦР, в первую очередь нужно обратить внимание на то, какая формулировка использована в расшифровке. То есть положительный или отрицательный результат.

Слово «отрицательный» в расшифровке анализа зачастую говорит о том, что в представленном образце биологического материала инфекция не была обнаружена. Таким образом, отрицательный результат анализа ПЦР означает, что ДНК искомого возбудителя болезни в организме нет.

Означает ли это, что при отрицательном результате можно не делать других анализов и проходить обследования? Отвечая на этот вопрос, всегда надо учитывать, что ПЦР может дать ложный, отрицательный результат, если инфекция в латентном или хроническом состоянии. В таком случае другие методы диагностики окажутся более эффективными и способны дать более четкую картину о том, сколько патогенов в изучаемом образце.

Что это такое – анализ методом ПЦР?

Что это такое – анализ методом ПЦР?

Интересно, что хоть иммуноферментный анализ считается менее точным, возможен вариант, когда он будет показывать более достоверные результаты. Например, если на стадии ремиссии ПЦР показывает, как правило, отрицательный результат, ИФА дает положительный ответ, обнаружив антитела к инфекции.

Таким образом, ещё одним фактором, влияющим на расшифровку ПЦР, является сила иммунитета человека. Если иммунная система работает в полную силу, присутствие антител можно зафиксировать уже на начальных стадиях заболевания.

Вместе с тем, если отсутствуют жалобы у пациента и присутствуют антитела при отрицательном результате ПЦР, это говорит о том, что лечение в настоящий момент не требуется. Но при этом грамотный врач будет учитывать присутствие возбудителей, и при необходимости назначит иные анализы. Таким образом, подобный случай является примером того, когда отрицательный результат ПЦР требует дальнейшего исследования.

Плюсы и минусы ПЦР

Таким образом, если говорить о положительных и отрицательных сторонах изучения материала методом полимеразной цепной реакции, то можно сказать, что к достоинствам ПЦР можно отнести:

  • Прямое и непосредственное выявление возбудителей болезней, в отличие от других методов, что основываются на косвенных показателях.
  • Специфичность и точность метода, его узкая направленность на конкретного возбудителя.
  • Высокая чувствительность данного метода, обнаружение патологических агентов вне зависимости от того, сколько их есть (даже в единичных случаях присутствия).
  • Универсальность метода позволяет использовать любые вещества жидкой среды организма, такие как мокроты, моча, кровь, слизь и другие.
  • Скорость анализа (если говорить о том, сколько делается анализ ПЦР, то много зависит от лаборатории: от нескольких часов до нескольких суток).

К недостаткам данного метода можно отнести то, что положительный результат возможен даже в том случае, если возбудитель инфекции будет мёртв, что может быть результатом лечения. Также следует помнить, что любой микроорганизм способен к генетической мутации. Например, каждый год возникают новые штаммы вирусов гриппа. И теоретически возможна ситуация, что ДНК вируса изменится до такого состояния, когда она уже не будет определяться ПЦР, поскольку не будет образца, с которым он будет сравниваться.

Минусом также может быть цена анализа: не каждый может позволить себе сделать полное обследование. Вызвано это тем, что аппаратура и химические реактивы производятся и импортируются из США и Европы, что в основном и влияет на то, сколько стоит этот анализ. Цены на ПЦР могут колебаться около одной тысячи рублей за одно исследование. Однако то, сколько он стоит, с лихвой окупается его повышенной точностью, что очень важно, если в организме развивается опасная патология.

proanalizy.com


Смотрите также

Sad4-Karpinsk | Все права защищены © 2018 | Карта сайта