Усложнение растений в процессе эволюции: 2. Усложнение растений в процессе эволюции, классификация покрытосеменных. Определите место вида ландыша майского в системе растительного мира (отдел, класс, семейство, род).

Содержание

2. Усложнение растений в процессе эволюции, классификация покрытосеменных. Определите место вида ландыша майского в системе растительного мира (отдел, класс, семейство, род).

Первые живые организмы возникли в момент
господства воды на Земле. Эти живые
организмы, обитающие в водной среде,
дали начало первым одноклеточным
жгутиковым водорослям (низшим растениям).
Предположительно, что многоклеточные
водоросли возникли из колониальных
форм одноклеточных водорослей. Произошел
переход одноклеточного организма к
многоклеточному. Многоклеточные
водоросли имеют самое простое строение,
тело образовано одним видом клеток, нет
тканей и органов, к субстрату прикрепляются
с помощью ризоидов.

С изменение. условий окружающей среды
(произошли крупные горообразовательные
процессы, появляется суша), происходит
изменение растительных организмов. Из
многоклеточных водорослей в условиях
периодического заливания прибрежных
зон водой, возникли первые обитатели
суш — псилофиты (вымершие представители
низших споровых растений0 и первые мхи
(слепая нить в эволюции). Из одного вида
многоклеточных водорослей развились
псилофиты, слоевище которых состояло
из нескольких тканей: покровной,
механической, проводящей, а из другого
вида многоклеточных водорослей развились
мхи, это наземные растения, имеющие
органы – побеги и листья, но не имеющие
корней. Прослеживается переход от
клеточного уровня к однотканевому
уровню, а также к организменному уровню.

Псилофиты и первые мхи размножались,
спорами. Современные мхи также размножаются
спорами. Из споры вырастает предросток,
похожий на водоросль. Оплодотворение
происходит только при наличии воды.
Сходство предростков мха с водорослями
указывает на происхождение мхов от
водорослей.

От псилофитов возникли папоротникообразные,
хвощи и плауны.

Они имели более сложное строение, чем
современные представители. В период
расцвета папоротникообразных на Земле
был влажный и теплый климат, частые
дожди, большая туманность, все это
способствовало интенсивному развитию
папоротникообразных. Они были представлены
гигантскими деревьями до 40 метров
высотой.

Размножались с помощью спор, а более
совершенные с помощью семян. Оплодотворение
происходило при наличии воды.

Современные папоротникообразные, хвощи
и плауны, гораздо меньших размеров, чем
предки, это травянистые растения. Но у
них сохранились черты сходства с
предками, размножаются спорами, споры
прорастают только при достаточном
количестве влаги. Заростки, развивающиеся
из спор, похожи .на слоевище многоклеточных
водорослей и как водоросли к почве
прикрепляются с помощью ризоидов.
Оплодотворение происходит только при
наличии воды. Почти все папоротникообразные
и хвощи влаголюбивые растения.

С наступлением ледника происходило
изменение климата, он становится СУХИМ
и холодным. Под воздействием условий
окружающей среды происходили изменения
в растительном мире. Споровые
папоротникообразные уменьшались в
размере, а из папоротников, размножающихся
семенами, возникли первые голосеменные
растения. Эти растения имели органы
(стебли, листья, корни) с более сложным
внутренним строением, у них развиваются
покровные ткани, клетки которых имеют
толстые стенки, а также совершенствуется
проводящая система (сосуды и ситовидные
трубки, образующие проводящие пучки).
Размножаются голосеменные семенами,
состоящими из зародыша растения и запаса
питательных веществ.

От древних голосеменных растений
произошли покрытосеменные растения.
Они имеют более сложное строение
организма, у покрытосеменных развивается
видоизмененный побег — цветок. В цветке
развиваются половые органы: тычинки и
пестик (пестик — женский половой орган,
тычинка — мужской половой орган). Процесс
оплодотворения произойдет лишь после
процесса опыления (перенос пыльцы с
тычинки на рыльце пестика). Оплодотворение
у цветковых растений двойное, после
которого из завязи пестика цветка
развивается плод с семенами внутри.
Таким образом, семена защищены от
неблагоприятных условий. Покрытосеменные
растения размножаются и распространяются
с помощью семян. За счет более сложною
строения и защищенности семян постепенно
господствующее положение заняли на
Земле покрытосеменные растения.

Следовательно, изменения уровня
организации растений в процессе эволюции
шли в направлении усложнений организации.
Вначале организм представлен одной
клеткой, далее возникают многочисленные
организмы, затем идет дифференцировка
на ткани и органы. Далее усложняется
строение органов, что приводит к
усложнению всего организма. Причинами
этих изменений являются факторы
окружающей среды, наследственная
изменчивость и естественный отбор.

Отдел Покрытосеменные подразделяется
на два класса:

Класс Однодольные; Класс Двудольные.

Классы, в свою очередь, делятся на
семейства. Каждому семейству характерны
определённые признаки, по которым
растения объединяют в конкретную
систематическую группу (род, вид-
наименьшая единица классификации).
Систематическое положение ландыша
майского:

Отдел Покрытосеменные, класс –
Однодольные, семейство – Лилейные, род
– Ландыш, вид – ландыш майский.

3. Используя знания об
иммунитете, объясните, с какой целью
человеку делают прививки и вводят
сыворотки. Как можно повысить защитные
свойства организма? Как защитить себя
от ВИЧ-инфекции и заболевания СПИДом?

1. Кожа, слизистые оболочки, выделяемые
ими жидкости (слюна, слезы, желудочный
сок и др.) — первый барьер в защите
организма от микробов. Их функции:
служат механической преградой,
защитным барьером, предупреждающим
попадание микробов в организм; вырабатывают
вещества, обладающие противомикробными
свойствами.

2. Роль фагоцитов в защите организма
от микробов. Проникновение фагоцитов
— особой группы лейкоцитов — через стенки
капилляров к местам скопления микробов,
ядов, чужеродных белков, попавших в
организм, обволакивание и переваривание
их.

3. Иммунитет. Выработка лейкоцитами
антител, которые разносятся кровью
по организму, соединяются с бактериями
и делают их беззащитными против
фагоцитов. Контакт некоторых видов
лейкоцитов с болезнетворными бактериями,
вирусами, выделение лейкоцитами
веществ, которые вызывают их гибель.
Наличие в крови этих защитных веществ
обеспечивает иммунитет невосприимчивость
организма к инфекционным заболеваниям.
Действие разных антител на микробы.

4. Предупреждение инфекционных
заболеваний. Введение в организм
человека (как правило, в детском возрасте)
вакцины — ослабленных или убитых
возбудителей наиболее распространенных
инфекционныx заболеваний — кори,
коклюша, дифтерии, полиомиелита и др. —
для предупреждения заболевания. Не
восприимчивость человека к этим
заболеваниям

или протекание болезни в легкой форме
благодаря выработке в организме антител.
При заражении человека инфекционной
болезнью введение ему сыворотки крови,
полученной от переболевших людей
или животных. Содержание в сыворотке
антител против той или иной болезни.

5. Профилактика ВИЧ-инфекции и
заболевания СПИДом. ВИЧ — вирус
иммунодефицита человека; вызывающий
синдром приобретенного иммyнoдeфицитa
(СПИД). ВИЧ инфицирует и уничтожает
лейкоциты определенного типа, которые
обеспечивают формирование иммунитета
человека. Больные СПИДом подвержены
различным инфекциям, которые и
становятся причиной их смерти. Обычно
ВИЧ передается с кровью или спермой. От
ВИЧ-инфицированной матери вирус может
заразить плод через плаценту или
попасть в организм ребенка через грудное
молоко. В связи с отсутствием
эффективного лечения важно соблюдать
меры предосторожности: избегать случайных
половых связей, при половых контактах
использовать презервативы, проверять
донорскую кровь на антитела к ВИЧ,
использовать одноразовые шприцы.

УСЛОЖНЕНИЕ ОРГАНИЗАЦИИ РАСТЕНИЙ В ПРОЦЕССЕ ЭВОЛЮЦИИ

Происхождение основных систематических групп растений

Какие отделы выделяют в царстве растений?

Как происходила эволюция растений?

В предыдущих курсах биологии вы уже познакомились с основными систематическими группами живых организмов, обитающих на нашей планете. Вам известны особенности их строения и жизнедеятельности, их жизненные циклы и приспособления к условиям окружающей среды. Теперь предстоит обобщить всё то, что вы знаете о представителях основных двух царств живых существ — Растений и Животных в свете знаний об эволюционном процессе. Рассмотрим, как происходило усложнение организации растений и животных в процессе эволюции, когда появились основные систематические группы организмов, каковы их предковые формы.

Характерными чертами биологической эволюции являются её непрерывность и преемственная связь между ныне живущими организмами и древними обитателями планеты. Теория эволюции, предложенная Дарвином, в дальнейшем была расширена и дополнена трудами многих учёных. Современные научные данные позволили точно установить, как и в какой последовательности шло развитие животного и растительного мира на нашей планете.

Большой вклад в восстановление хронологии основных эволюционных событий внесла палеонтология — наука об организмах, существовавших в прошлые геологические периоды и сохранившихся в виде ископаемых останков, а также следов жизнедеятельности. Чем глубже расположен слой осадочных пород с окаменелостями, следами или отпечатками, пыльцой или спорами, тем древнее эти ископаемые организмы (рис. 115). Сравнение окаменелостей различных пластов горных пород позволило выделить в истории Земли несколько временных периодов, которые отличаются друг от друга особенностями геологических процессов, климатом, появлением и исчезновением определённых групп живых организмов.

Биологическую историю Земли подразделяют на эры, эры делят на периоды, а в периодах выделяют эпохи, или отделы.

Наша планета возникла около 4,5 млрд. лет назад, а эпоха биологической эволюции, которая продолжается и сейчас, наступила на нашей планете около 3,9 млрд. лет назад.

В настоящее время растения заселяют огромные территории суши и Мирового океана, образуя растительный покров нашей планеты, но так было не всегда.

Архейская эра. Жизнь зародилась в водной среде, потому что только вода могла защитить организмы от солнечного и космического излучений. Первыми живыми организмами на нашей планете были гетеротрофы — организмы, которые усваивали органические вещества из «первичного бульона». Обходились они без кислорода, которого в первичной атмосфере Земли было очень мало. По строению эти первые одноклеточные организмы напоминали современных бактерий.

Данные о заселении прокариотами новых водоёмов с экстремальными условиями свидетельствуют о том, что в основном первыми начинают осваивать новую среду организмы, которые сочетают гетеротрофный и автотрофный типы питания. Так что, возможно, первые организмы на Земле были миксотрофами — организмами, способными не только усваивать готовые органические вещества, но и использовать энергию, выделяющуюся при окислении неорганических соединений (хемосинтез).

Шло время, запасы питательных веществ в первичном океане истощались. Преимущество в конкурентной борьбе получили те, кто научился использовать в качестве источника энергии солнечный свет. Более 3 млрд. лет назад возникли первые автотрофные организмы. Важнейшим событием архейской эры стало появление кислородного фотосинтеза — в атмосфере начал накапливаться кислород.

Протерозойская эра. Около 2,5 млрд. лет назад началась протерозойская эра, продолжавшаяся почти 2 млрд. лет. В этот период, около 2 млрд. лет назад, количество кислорода в воздухе достигло 1% от его содержания в современной атмосфере. Учёные считают, что такой концентрации было достаточно для появления организмов, способных использовать кислород при дыхании. В результате сложного симбиоза разных групп прокариот сформировались и начали активно развиваться эукариоты. Образование ядра повлекло за собой возникновение митоза, а в дальнейшем и мейоза. Это дало возможность появиться половому размножению. Первые одноклеточные зелёные водоросли, имевшие настоящее ядро, стали родоначальниками всех современных групп растений.

Важнейший этап эволюции живой природы — появление многоклеточности начался около 2,1 млрд. лет назад. В результате резко увеличилось многообразие организмов. Появилась возможность специализации клеток, образования тканей и органов. Первыми многоклеточными растительными организмами в древнем океане стали водоросли.

Постепенное увеличение количества кислорода в атмосфере привело к формированию озонового слоя, защитившего Землю от ультрафиолетового излучения, поэтому жизнь могла завоёвывать и сушу. Согласно современным научным данным около 700 млн. лет назад на сушу вышли грибы, возможно, образовав вместе с древними водорослями первые лишайники.

Палеозойская эра. Палеозойская эра началась 541 млн. лет назад и длилась около 289 млн. лет. В это время на планете продолжались интенсивные горообразовательные процессы, сопровождавшиеся высокой вулканической активностью, сменяли друг друга оледенения, периодически на сушу наступали и отступали от неё моря.

В палеозойской эре выделяют шесть периодов: кембрийский (кембрий), ордовикский (ордовик), силурийский (силур), девонский (девон), каменноугольный (карбон) и пермский (пермь).

Важнейшим периодом в эволюции растительного мира современные учёные считают силур. Именно тогда предки современных растений вышли на сушу, дав начало всем высшим растениям. Первыми наземными споровыми растениями стали куксонии, от которых в девоне произошли риниофиты.

От первых примитивных споровых растений произошли все папоротникообразные. Расцвета эти растения достигли 350 млн. лет назад в каменноугольный период, когда климат на Земле был влажным и тёплым (рис. 116). Гигантские леса из древовидных хвощей, плаунов и папоротников покрывали Землю. Именно остатки этих древних растений человечество использует в качестве топлива (каменный уголь).

В конце каменноугольного периода климат сменился на холодный и сухой, и споровые растения оказались перед угрозой вымирания. В данных условиях преимущество получили растения, размножение которых не зависело от наличия воды, а зародыш был защищён от возможных неблагоприятных воздействий. В результате изменения климата по планете широко расселились семенные папоротники, возникшие ещё в начале карбона. Они потеснили споровые растения и в дальнейшем дали начало всем семенным растениям. Семенные растения лучше приспособлены к жизни на суше, чем споровые: процесс оплодотворения у них не зависит от наличия воды, а зародыш и запас питательных веществ для его развития находятся внутри семени.

Мезозойская эра. Около 252 млн. лет назад началась мезозойская эра. Она длилась примерно 186 млн. лет и включала три периода: триасовый, юрский и меловой. В течение почти всего мезозоя на суше господствовали голосеменные растения.

В триасовый период семенные папоротники вымерли практически полностью. В юрском периоде на Земле господствовали папоротники и голосеменные растения. Но уже в течение мелового периода появились и быстро распространились покрытосеменные (цветковые) растения, постепенно вытеснившие голосеменные и папоротникообразные. Цветковые растения имели значительные преимущества перед голосеменными: двойное оплодотворение, обеспечение зародыша большим количеством запасных питательных веществ, защита семени околоплодником и др. Некоторые покрытосеменные растения, возникшие в меловом периоде, сохранились до наших дней (дубы, ивы, эвкалипты, пальмы).

Кайнозойская эра. Начавшаяся около 66 млн. лет назад кайнозойская эра продолжается и в настоящее время. Она подразделяется на три периода: палеогеновый и неогеновый, общей продолжительностью 63,5 млн. лет, и антропогеновый, который начался 2,5 млн. лет назад.

В палеогене на суше господствовали покрытосеменные растения (субтропические леса). В неогене климат стал более сухим, образовались степи, широко распространились однодольные травянистые растения. А четыре гигантских оледенения антропогена полностью изменили растительный облик планеты. Между Азией и Северной Америкой, Европой и Британскими островами возникли сухопутные «мосты», что способствовало широкому расселению видов. В дальнейшем началось глобальное потепление, многие растения вымерли, сформировалась современная флора.

В настоящее время на смену термину «семенные папоротники» приходит термин «палеозойские голосеменные».

Крупнейшее событие антропогена — появление человека, чья деятельность стала ведущим фактором дальнейших изменений в животном и растительном мире Земли.

Запомнить: палеонтология; эры: архейская, протерозойская, палеозойская; периоды; многоклеточность; лишайники, водоросли, риниофиты, семенные папоротники, голосеменные растения, покрытосеменные (цветковые) растения.

Выводы

В процессе эволюции происходило постепенное усложнение организации живых организмов. Современные научные данные позволяют проследить, как и в какой последовательности шло развитие растительного мира на нашей планете.

Думай, делай выводы, действуй

Проверь свои знания

Что изучает палеонтология?

Почему первые живые организмы возникли в воде?

Когда появилась многоклеточность, какие преимущества она дала организмам?

Какова роль озонового слоя атмосферы?

Какими растениями был представлен растительный мир в палеозойскую эру?

В каком направлении шла эволюция растений в мезозойскую эру?

Выполни задания

Назовите основные преимущества семенных растений перед споровыми.

Приведите примеры растений, сохранившихся на нашей планете с мелового периода.

Обсуди с товарищами

В каких направлениях шла эволюция растений на суше?

Какие особенности риниофитов позволили им выжить и развиваться на суше?

Что позволило покрытосеменным растениям занять господствующее положение на Земле?

Эволюционная генетика адаптации растений

1. Тишкофф С.А., и соавт. Конвергентная адаптация персистенции лактазы человека в Африке и Европе. Природа Обзоры Генетика. 2007; 39:31–40. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

2. Sattath S, et al. Повсеместная эволюция адаптивных белков, проявляющаяся в моделях разнообразия аминокислотных замен у Drosophila simulans . Публичная библиотека научной генетики. 2011;7:e1001302. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

3. Bakker E, et al. Полногеномный обзор полиморфизмов гена R у Arabidopsis . Растительная клетка. 2006; 18:1803–1818. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

4. Turner TL, et al. Повторное секвенирование популяции выявило локальную адаптацию Arabidopsis lyrata к змеевидным почвам. Генетика природы. 2010;42:260–263. [PubMed] [Google Scholar]

5. Excoffier L, et al. Выявление локусов при отборе в иерархически структурированной популяции. Наследственность. 2009 г.;103:285–298. [PubMed] [Google Scholar]

6. Chen H, et al. Дифференциация населения как тест для выборочных зачисток. Геномные исследования. 2010;20:393–402. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

7. Coop G, et al. Использование экологических корреляций для определения локусов, лежащих в основе локальной адаптации. Генетика. 2010; 185:1411–1423. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

8. Burke MK, et al. Полногеномный анализ долгосрочного эволюционного эксперимента с дрозофилой. Природа. 2010; 467: 587–590. [PubMed] [Google Scholar]

9. Hernandez RD, et al. Классические выборочные проверки были редкостью в недавней эволюции человека. Наука. 2011; 331:920–924. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

10. Pritchard J, Di Rienzo A. Не только зачистки. Природа Обзоры Генетика. 2010; 11: 665–667. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

11. Geber M, Griffen LR. Наследование и естественный отбор по функциональным признакам. Международный журнал растениеводства. 2003; 164:S21–S42. [Академия Google]

12. Metcalf CJE, Mitchell-Olds T. История жизни в модельной системе: открытие черного ящика с Arabidopsis thaliana . Экологические письма. 2009; 12: 593–600. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

13. Mitchell-Olds T, et al. Какие эволюционные процессы влияют на естественную генетическую изменчивость фенотипических признаков? Природа Обзоры Генетика. 2007; 8: 845–856. [PubMed] [Google Scholar]

14. Parachnowitsch AL, Caruso CM. Предрассеивающие семена травоядные, а не опылители, осуществляют отбор по цветочным признакам через приспособленность самок. Экология. 2008;89: 1802–1810. [PubMed] [Google Scholar]

15. Knight CA, et al. Профилирование экспрессии и локальная адаптация популяций Boechera holboellii для эффективности водопользования в условиях естественного градиента водного стресса. Молекулярная экология. 2006; 15:1229–1237. [PubMed] [Google Scholar]

16. Dechaine JM, et al. Ограничения эволюции адаптивной пластичности: затраты пластичности по отношению к плотности выражаются в сегрегации потомства. Новый фитолог. 2007; 176: 874–882. [PubMed] [Академия Google]

17. Донохью К. и соавт. Доказательства адаптивной дивергенции в пластичности: зависящий от плотности и места отбор на реакцию избегания тени у Impatiens capensis . Эволюция. 2000; 54:1956–1968. [PubMed] [Google Scholar]

18. Нил Д.Б., Ингварссон П.К. Популяционная, количественная и сравнительная геномика адаптации лесных деревьев. Текущее мнение в биологии растений. 2008; 11: 149–155. [PubMed] [Google Scholar]

19. Schranz ME, et al. Экологическая геномика Boechera stricta : идентификация QTL, контролирующего распределение глюкозинолатов, полученных из метионина и аминокислот с разветвленной цепью, и уровней травоядности насекомых. Наследственность. 2009; 102: 465–474. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

20. Anderson JT, et al. QTL жизненного цикла и естественный отбор по времени цветения у Boechera stricta , многолетнего родственника Arabidopsis . Эволюция. 2011; 65: 771–787. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

21. Андерсон Дж.Т., Митчелл-Олдс Т. Экологическая генетика и геномика защиты растений: доказательства и подходы. Функциональная экология. 2011; 25:312–324. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

22. Herrera CM, Bazaga P. Количественная оценка генетического компонента фенотипической изменчивости беспородных диких растений: адаптация геномного сканирования для использования внутри популяции. Молекулярная экология. 2009;18:2602–2614. [PubMed] [Google Scholar]

23. Stinchcombe JR, Hoekstra HE. Сочетание популяционной геномики и количественной генетики: поиск генов, лежащих в основе экологически важных признаков. Наследственность. 2008; 100:158–170. [PubMed] [Академия Google]

24. Manel S, et al. Перспективы использования ландшафтной генетики для выявления генетической адаптивной изменчивости в полевых условиях. Молекулярная экология. 2010;19:3760–3772. [PubMed] [Google Scholar]

25. Митчелл-Олдс Т. Комплексно-признаковый анализ растений. Геномная биология. 2010;11:113. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

26. Atwell S, et al. Полногеномное исследование ассоциации 107 фенотипов в общем наборе из инбредных линий Arabidopsis thaliana . Природа. 2010 [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

27. Ингварссон П.К., улица НР. Ассоциативная генетика сложных признаков у растений. Новый фитолог. 2011; 189:909–922. [PubMed] [Google Scholar]

28. Myles S, et al. Ассоциативное картирование: критические соображения переходят от генотипирования к экспериментальному дизайну. Растительная клетка. 2009;21:2194–2202. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

29. Hohenlohe PA, et al. Использование популяционной геномики для обнаружения отбора в естественных популяциях: ключевые концепции и методологические соображения. Международный журнал растениеводства. 2010;171:1059–1071. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

30. Pritchard J, et al. Генетика адаптации человека: жесткие зачистки, мягкие зачистки и полигенная адаптация. Текущая биология. 2010; 20: Р208–Р215. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

31. Лейму Р., Фишер М. Метаанализ локальной адаптации растений. Публичная научная библиотека номер один. 2008;3:e4010. [PMC бесплатная статья] [PubMed] [Google Scholar]

32. Бомбли К. Обреченные любовники: Механизмы изоляции и несовместимости у растений. Ежегодный обзор биологии растений. 2010;61:109–124. [PubMed] [Google Scholar]

33. Hall MC, et al. Вызвана ли локальная адаптация Mimulus guttatus компромиссами в отдельных локусах? Молекулярная экология. 2010;19:2739–2753. [PubMed] [Google Scholar]

34. Verhoeven KJF, et al. Естественный отбор, специфичный для среды обитания, во время цветения QTL является основным фактором локальной адаптации в двух популяциях дикого ячменя. Молекулярная экология. 2008;17:3416–3424. [PubMed] [Google Scholar]

35. Verhoeven KJF, et al. Генетическая основа адаптивной дифференциации популяций: количественный локусный анализ признаков приспособленности в двух популяциях дикого ячменя из контрастных местообитаний. Эволюция. 2004; 58: 270–283. [PubMed] [Академия Google]

36. Гарднер К.М., Латта Р.Г. Идентификация локусов при отборе в контрастных средах в Avena barbata с использованием картирования локусов количественных признаков. Молекулярная экология. 2006; 15:1321–1333. [PubMed] [Google Scholar]

37. Lowry DB, et al. Генетические и физиологические основы дивергенции адаптивной солеустойчивости между прибрежными и внутренними Mimulus guttatus . Новый фитолог. 2009; 183: 776–788. [PubMed] [Google Scholar]

38. Li ZK, et al. Взаимодействие среды QTL X в рисе. I. Дата колошения и высота растения. Теоретическая и прикладная генетика. 2003; 108: 141–153. [PubMed] [Академия Google]

39. Weinig C, et al. Гетерогенный отбор по определенным локусам в природных условиях у Arabidopsis thaliana. Генетика. 2003; 165: 321–329. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

40. Lowry DB, Willis JH. Широко распространенный полиморфизм хромосомной инверсии способствует серьезному изменению жизненного цикла, локальной адаптации и репродуктивной изоляции. Публичная библиотека научной биологии. 2010;8:e1000500. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

41. Elzinga JA, et al. Раз за разом: фенология цветения и биотические взаимодействия. Тенденции в экологии и эволюции. 2007; 22: 432–439.. [PubMed] [Google Scholar]

42. Inouye DW. Влияние изменения климата на фенологию, ущерб от заморозков и обилие цветков горных полевых цветов. Экология. 2008; 89: 353–362. [PubMed] [Google Scholar]

43. Li Y, et al. Ассоциативное картирование местных локусов количественных признаков, чувствительных к климату, у Arabidopsis thaliana . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 2010;107:21199–21204. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

44. Холл М.К., Уиллис Дж.Х. Дивергентный отбор по времени цветения способствует локальной адаптации в популяциях Mimulus guttatus . Эволюция. 2006; 60: 2466–2477. [PubMed] [Google Scholar]

45. Сандринг С., Огрен Дж. Опосредованный опылителями отбор на цветочный вид и время цветения многолетних трав Arabidopsis lyrata . Эволюция. 2009;63:1292–1300. [PubMed] [Google Scholar]

46. Wang R, et al. PEP1 регулирует многолетнее цветение в Арабис альпина . Природа. 2009; 459:423–427. [PubMed] [Google Scholar]

47. Kim DH, et al. Яровизация: зима и сроки цветения растений. Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития. 2009; 25: 277–299. [PubMed] [Google Scholar]

48. Franks SJ, et al. Быстрая эволюция времени цветения однолетних растений в ответ на колебания климата. Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 2007; 104:1278–1282. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

49. Ehrenreich IM, et al. Картирование ассоциации генов-кандидатов Arabidopsis Время цветения. Генетика. 2009; 183:325–335. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

50. Wellmer F, Riechmann JL. Генные сети, контролирующие инициацию развития цветка. Тенденции в генетике. 2010; 26: 519–527. [PubMed] [Google Scholar]

51. Turck F, et al. Регуляция и идентичность флоригена: ЦВЕТУЩИЙ ЛОКУС Т занимает центральное место. Ежегодный обзор биологии растений. 2008;59: 573–594. [PubMed] [Google Scholar]

52. Юнг С., Мюллер А.Е. Контроль сроков цветения и применение в селекции растений. Тенденции в растениеводстве. 2009; 14: 563–573. [PubMed] [Google Scholar]

53. Böhlenius H, et al. Модуль регулирования CO/FT контролирует сроки цветения и прекращения сезонного роста деревьев. Наука. 2006; 312:1040–1043. [PubMed] [Google Scholar]

54. Schwartz C, et al. Цис-регуляторные изменения в цветущем локусе T опосредуют естественные вариации реакции цветения у Arabidopsis thaliana. Генетика. 2009 г.;183:723–732. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

55. Skøt L, et al. Аллельная изменчивость райграса пастбищного гена локуса цветения T связана с изменениями времени цветения в ряде популяций. Физиология растений. 2011; 155:1013–1022. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

56. Hayama R, et al. Циркадный ритм, задаваемый сумерками, определяет экспрессию гомологов FT и реакцию фотопериодического цветения на короткий день у 9 растений. 0005 Фарбитис . Растительная клетка. 2007;19:2988–3000. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

57. Lin M-K, et al. Белок FLOWERING LOCUS T может действовать как дальний флоригенный сигнал в тыквенных растениях. Растительная клетка. 2007; 19: 1488–1506. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

58. Shalit A, et al. Гормон цветения флориген действует как общий системный регулятор роста и терминации. Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 2009 г.;106:8392–8397. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

59. Blackman BK, et al. Роль недавно полученных паралогов FT в одомашнивании подсолнечника. Текущая биология. 2010; 20:1–7. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

60. Weinig C, et al. Новые локусы контролируют изменение времени размножения у Arabidopsis thaliana в естественных условиях. Генетика. 2002; 162: 1875–1884. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

61. Brachi B, et al. Связывание и картирование ассоциации Arabidopsis thaliana Время цветения в природе. Публичная библиотека научной генетики. 2010;6:e1000940. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

62. Wu CA, et al. Естественная изменчивость признаков реакции на засуху в комплексе видов Mimulus guttatus. Экология. 2010; 162:23–33. [PubMed] [Google Scholar]

63. Hausmann N, et al. Количественные следовые локусы, влияющие на дельта-13C, и реакция на различную доступность воды у Arabidopsis thaliana . Эволюция. 2005;59: 81–96. [PubMed] [Google Scholar]

64. Bernier J, et al. Высокоэффективная засухоустойчивость QTL qtl12.1 увеличивает поглощение воды горным рисом. Исследования полевых культур. 2009; 110:139–146. [Google Scholar]

65. Рейнольдс М., Тубероза Р. Трансляционное исследование, влияющее на урожайность сельскохозяйственных культур в засушливых условиях. Текущее мнение в биологии растений. 2008; 11: 171–179. [PubMed] [Google Scholar]

66. Тардье Ф., Тубероза Р. Вскрытие и моделирование устойчивости растений к абиотическому стрессу. Текущее мнение в биологии растений. 2010;13:206–212. [PubMed] [Академия Google]

67. Maherali H, et al. Адаптивная ценность и издержки физиологической пластичности к ограничению влажности почвы у рекомбинантных инбредных линий Avena barbata. Американский натуралист. 2010;175:211–224. [PubMed] [Google Scholar]

68. Sherrard M, et al. Водный стресс изменяет генетическую архитектуру функциональных признаков, связанных с адаптацией к засухе у Avena barbata. Эволюция. 2009; 63: 702–715. [PubMed] [Google Scholar]

69. Juenger T, et al. Изучение генетических и экспрессионных различий между физиологически экстремальными экотипами: сравнительная геномная гибридизация и исследования экспрессии генов образцов Kas-1 и Tsu-1 из Arabidopsis thaliana . Растение, клетка и окружающая среда. 2010;33:1268–1284. [PubMed] [Google Scholar]

70. Oh S-J, et al. Сверхэкспрессия транскрипционного фактора AP37 в рисе повышает урожайность зерна в условиях засухи. Физиология растений. 2009; 150:1368–1379. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

71. Ackerly DD, et al. География изменения климата: последствия для природоохранной биогеографии. Разнообразие и распространение. 2010; 16: 476–487. [Академия Google]

72. Колаутти Р.И., Барретт С.Х. Естественный отбор и генетические ограничения фенологии цветения инвазивного растения. Международный журнал растениеводства. 2010; 171:960–971. [Google Scholar]

73. Ouborg NJ, et al. Острые края парадигмы генетики сохранения растений. Журнал экологии. 2006; 94: 1233–1248. [Google Scholar]

74. Willi Y, et al. Ограничения адаптивного потенциала малых популяций. Ежегодный обзор эволюции и систематики экологии. 2006; 37: 433–458. [Академия Google]

75. Hoffmeister TS, et al. Экологические и эволюционные последствия биологической инвазии и фрагментации местообитаний. Экосистемы. 2005; 8: 657–667. [Google Scholar]

76. Parker IM, et al. Эволюционный подход к пониманию биологии инвазий: локальная адаптация и универсальный генотип у сорняка Verbascum thapsus. Биология сохранения. 2003; 17:59–72. [Google Scholar]

77. Lankau RA, et al. Эволюционные ограничения смягчают негативное воздействие инвазивного растения. Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 2009 г.;106:15362–15367. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

78. Keller SR, et al. История адаптации и колонизации влияет на эволюцию клинов у двух интродуцированных видов. Новый фитолог. 2009; 183: 678–690. [PubMed] [Google Scholar]

79. Jump AS, Peñuelas J. Генетические эффекты хронической фрагментации среды обитания в опыляемом ветром дереве. Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 2006; 103:8096–8100. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

80. Хоффманн А.А., Вилли Ю. Обнаружение генетических реакций на изменение окружающей среды. Природа Обзоры Генетика. 2008; 9: 421–432. [PubMed] [Google Scholar]

81. Пармезан C. Экологические и эволюционные реакции на недавнее изменение климата. Ежегодный обзор эволюции и систематики экологии. 2006; 37: 637–669. [Google Scholar]

82. Lenoir J, et al. Значительный сдвиг вверх в оптимальной эволюции видов растений в течение 20-го века. Наука. 2008; 320:1768–1771. [PubMed] [Академия Google]

83. Massot M, et al. Потепление климата, сдерживание расселения и риск исчезновения. Биология глобальных изменений. 2008; 14: 461–469. [Google Scholar]

84. Fox CW, Reed DH. Инбредная депрессия усиливается при стрессе окружающей среды: экспериментальное исследование и метаанализ. Эволюция. 2010; 65: 246–258. [PubMed] [Google Scholar]

85. Damschen EI, et al. Коридоры увеличивают богатство видов растений в больших масштабах. Наука. 2006; 313:1284–1286. [PubMed] [Google Scholar]

86. Раушер, доктор медицины. Эволюционные переходы в цветочной окраске. Международный журнал растениеводства. 2008;169: 7–21. [Google Scholar]

87. Брэдшоу Х.Д., Шемске Д.В. Замена аллеля в локусе окраски цветка приводит к смене опылителей у обезьяноцветов. Природа. 2003; 426:176–178. [PubMed] [Google Scholar]

88. Streisfeld MA, Rausher MD. Популяционная генетика, плейотропия и предпочтительная фиксация мутаций в процессе адаптивной эволюции. Эволюция. 2011 [PubMed] [Google Scholar]

89. Cooley A, et al. Дупликация генов у Mimulus лежит в основе параллельной эволюции цветков посредством независимых трансрегуляторных изменений. Текущая биология. 2011 [PubMed] [Академия Google]

90. Хопкинс Р., Раушер М.Д. Идентификация двух генов, вызывающих подкрепление у техасского полевого цветка Phlox drummondii . Природа. 2011; 469:411–414. [PubMed] [Google Scholar]

91. Бергельсон Дж., Ру Ф. На пути к выявлению генов, лежащих в основе экологически значимых признаков у Arabidopsis thaliana . Природа Обзоры Генетика. 2010; 11: 867–879. [PubMed] [Google Scholar]

92. Hamblin MT, et al. Популяционная генетика методов улучшения сельскохозяйственных культур на основе геномики. Тенденции в генетике. 2011;27:98–106. [PubMed] [Google Scholar]

93. Anderson JT, et al. Фенотипическая пластичность, несмотря на динамику популяции источник-приемник у долгоживущего многолетнего растения. Новый фитолог. 2010; 188: 856–867. [PubMed] [Google Scholar]

94. Baythavong BS, Stanton ML. Характеристика отбора по фенотипической пластичности в ответ на естественную неоднородность окружающей среды. Эволюция. 2010;64:2904–2920. [PubMed] [Google Scholar]

95. Lacaze X, et al. Генетика фенотипической пластичности: анализ QTL у ячменя, Обыкновенная орда . Наследственность. 2009; 102: 163–173. [PubMed] [Google Scholar]

96. Steinger T, et al. Эволюция в стрессовых условиях II: Адаптивная ценность и стоимость пластичности в ответ на слабое освещение у Sinapis arvensis . Журнал эволюционной биологии. 2003; 16: 313–323. [PubMed] [Google Scholar]

97. Richards CL, et al. Какую роль играет наследуемая эпигенетическая изменчивость в фенотипической эволюции? Биология. 2010;60:232–237. [Академия Google]

98. Feng S, et al. Эпигенетическое перепрограммирование в развитии растений и животных. Наука. 2010;330:622–627. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

99. Oyama RK, et al. Уменьшенный геном Arabidopsis thaliana . Систематика растений и эволюция. 2008; 273: 257–271. [Google Scholar]

100. Hu TT, et al. Последовательность генома Arabidopsis lyrata и основа быстрого изменения размера генома. Генетика природы. (ожидается) [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

Геномика и эволюция традиционных лекарственных растений: путь к более здоровой жизни

1. Jiao Y, Wickett NJ, Ayyampalayam S, et al. Наследственная полиплоидия у семенных и покрытосеменных растений. Природа. 2011;473(7345):97–100. [PubMed] [Google Scholar]

2. Chen SL, Sun YZ, Xu J, et al. Стратегии изучения программы генома трав. Яо Сюэ Сюэ Бао. 2010;45(7):807–12. [PubMed] [Google Scholar]

3. Hao DC, Xiao PG, Ge GB, Liu M. Биологические, химические и омические исследования Taxus лекарственные ресурсы. Наркотики Dev Res. 2012;73:477–86. [Google Scholar]

4. Бутанаев А.М., Мозес Т., Зи Дж. и др. Исследование диверсификации терпенов в нескольких секвенированных геномах растений. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015;112(1):E81–8. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

5. Zhao Y, Yin J, Guo H, et al. Полный хлоропластный геном дает представление об эволюции и полиморфизме Panax ginseng . Фронт завод науч. 2015;5:696. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

6. Chen S, Luo H, Li Y, et al. 454 Анализ EST обнаруживает гены, предположительно участвующие в биосинтезе гинсенозидов в Panax ginseng . Отчет о растительных клетках 2011;30(9):1593–601. [PubMed] [Google Scholar]

7. Moses T, Pollier J, Shen Q, et al. OSC2 и CYP716A14v2 катализируют биосинтез тритерпеноидов для кутикулы надземных органов Artemisia annua . Растительная клетка. 2015;27(1):286–301. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

8. Hao da C, Chen SL, Osbourn A, Kontogianni VG, Liu LW, Jordán MJ. Временные изменения транскриптома, вызванные метилжасмонатом в Salvia sclarea . Ген. 2015;558(1):41–53. [PubMed] [Google Scholar]

9. Hao DC, Vautrin S, Song C, et al. Первое понимание генома Salvia ( Lamiaceae ) с помощью создания библиотеки BAC и высокопроизводительного секвенирования целевых клонов BAC. Пак Джей Бот. 2015;47(4):1347–57. [Google Scholar]

10. Hao DC, Gu XJ, Xiao PG. Лекарственные растения: химия, биология и омика. 1-е изд. Оксфорд: Эльзевир-Вудхед; 2015. [Google Scholar]

11. Хао Д.К., Чен С.Л., Сяо П.Г., Лю М. Применение высокопроизводительного секвенирования в исследованиях транскриптома лекарственных растений. Наркотики Dev Res. 2012; 73: 487–9.8. [Google Scholar]

12. Yao X, Peng Y, Xu LJ, Li L, Wu QL, Xiao PG. Фитохимические и биологические исследования лекарственных растений Lycium . Химические биодайверы. 2011;8(6):976–1010. [PubMed] [Google Scholar]

13. Hao DC, Xiao PG, Peng Y, Dong J, Liu W. Оценка маркеров штрих-кодирования хлоропластов по среднему и наименьшему межвидовому расстоянию. Пак Джей Бот. 2012;44(4):1271–4. [Google Scholar]

14. Хао Д.С., Ян Л., Сяо П.Г. Первое знакомство с Taxus геном с помощью создания библиотеки fosmid и конечного секвенирования. Мол Генет Геномикс. 2011;285(3):197–205. [PubMed] [Google Scholar]

15. Pan YZ, Zhang YC, Gong X, Li FS. Оценка размера генома четырех видов Panax с помощью проточной цитометрии. Ресурс разнообразия растений. 2014;36(2):233–6. [Google Scholar]

16. Polashock J, Zelzion E, Fajardo D, et al. Американская клюква: первые сведения о полном геноме вида, приспособленного к болотной среде обитания. BMC Растение Биол. 2014;14:165. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

17. Рубин Б.Е., Ри Р.Х., Моро К.С. Вывод филогении из данных последовательности RAD. ПЛОС Один. 2012;7(4):e33394. [PMC free article] [PubMed] [Google Scholar]

18. Носков В.Н., Чуанг Р.Ю., Гибсон Д.Г., Лием С.Х., Ларионов В., Куприна Н. Выделение кольцевых искусственных хромосом дрожжей для исследований в области синтетической биологии и функциональной геномики. Нат Проток. 2011;6(1):89–96. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

19. Qin C, Yu C, Shen Y, et al. Полногеномное секвенирование культивируемых и дикорастущих перцев дает представление о Capsicum Одомашнивание и специализация. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014;111(14):5135–40. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

20. Kim S, Park M, Yeom SI, et al. Последовательность генома острого перца дает представление об эволюции остроты у видов стручкового перца . Нат Жене. 2014;46(3):270–8. [PubMed] [Google Scholar]

21. Denoud F, Carretero-Paulet L, Dereeper A, et al. Геном кофе дает представление о конвергентной эволюции биосинтеза кофеина. Наука. 2014;345(6201):1181–4. [PubMed] [Академия Google]

22. Chalhoub B, Denoud F, Liu S, et al. Ранняя аллополиплоидная эволюция в постнеолитическом геноме масличных культур Brassica napus . Наука. 2014;345(6199):950–3. [PubMed] [Google Scholar]

23. Cai J, Liu X, Vanneste K, et al. Последовательность генома орхидеи Phalaenopsis equestris. Нат Жене. 2015;47(1):65–72. [PubMed] [Google Scholar]

24. Zhan QQ, Sui C, Wei JH, Fan SC, Zhang J. Построение карты генетического сцепления Bupleurum chinense DC. с использованием маркеров ISSR и SSR. Яо Сюэ Сюэ Бао. 2010;45(4):517–23. [PubMed] [Академия Google]

25. Liu L, Ma X, Wei J, Qin J, Mo C. Первая карта генетического сцепления Luohanguo ( Siraitia grosvenorii ) на основе маркеров ISSR и SRAP. Геном. 2011;54(1):19–25. [PubMed] [Google Scholar]

26. Cviková K, Cattonaro F, Alaux M, et al. Высокопроизводительная привязка физической карты с помощью секвенирования BAC-пула. BMC Растение Биол. 2015;15(1):99. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

27. Ariyadasa R, Stein N. Достижения в области физического картирования на основе BAC и стратегии интеграции карт в растениях. Дж. Биомед Биотехнолог. 2012;2012:184854. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

28. Qian J, Song J, Gao H, et al. Полная последовательность генома хлоропластов лекарственного растения Salvia miltiorrhiza . ПЛОС Один. 2013;8(2):e57607. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

29. Su HJ, Hogenhout SA, Al-Sadi AM, Kuo CH. Полная последовательность генома хлоропластов оманского лайма ( Citrus aurantiifolia ) и сравнительный анализ розидов. ПЛОС Один. 2014;9(11):e113049. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

30. Wu CS, Chaw SM, Huang YY. Филогеномика хлоропластов указывает на то, что Гинкго билоба является сестрой саговника. Геном Биол Эвол. 2013;5:243–54. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

31. Malé PJ, Bardon L, Besnard G, et al. Филогеномика и разделение апостериорных данных разрешают меловое излучение покрытосеменных Malpighiales . Proc Natl Acad Sci U S A. 2012;109:17519–24. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

32. Xu Q, Xiong G, Li P, et al. Анализ полных нуклеотидных последовательностей 12 Gossypium Геномы хлоропластов: происхождение и эволюция аллотетраплоидов. ПЛОС Один. 2012;7(8):e37128. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

33. Ma PF, Zhang YX, Zeng CX, Guo ZH, Li DZ. Филогеномный анализ хлоропластов разрешает отношения глубокого уровня неподатливого бамбукового племени Arundinarieae ( poaceae ) Syst Biol. 2014;63(6):933–50. [PubMed] [Google Scholar]

34. Park S, Ruhlman TA, Sabir JS, et al. Полные последовательности геномов органелл лекарственного растения Rhazya stricta ( Apocynaceae ) и контрастирующие модели эволюции митохондриального генома у астерид. Геномика BMC. 2014;15:405. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

35. Моралес-Санчес В., Риверо-Крус И., Лагуна-Эрнандес Г., Салазар-Чавес Г., Мата Р. Химический состав, потенциальная токсичность и процедуры контроля качества препарат-сырец Cyrtopodium macrobulbon . J Этнофармакол. 2014;154(3):790–7. [PubMed] [Академия Google]

36. Basavarajappa HD, Lee B, Fei X, et al. Синтез и механистические исследования нового гомоизофлаванонового ингибитора роста эндотелиальных клеток. ПЛОС Один. 2014;9(4):e95694. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

37. Ponnuchamy S, Kanchithalaivan S, Ranjith Kumar R, Ali MA, Choon TS. Антимикобактериальная оценка новых гибридных арилидентиазолидин-2,4-дионов. Bioorg Med Chem Lett. 2014;24(4):1089–93. [PubMed] [Google Scholar]

38. Нагананда Г.С., Сатишчандра Н. Антимикробная активность холодных и горячих последовательных экстрактов псевдобульб Flickingeria nodosa (Dalz.) Seidenf. Пак Дж. Биол. Науки. 2013;16(20):1189–93. [PubMed] [Google Scholar]

39. Luo J, Hou BW, Niu ZT, Liu W, Xue QY, Ding XY. Сравнительные хлоропластные геномы фотосинтезирующих орхидей: понимание эволюции Orchidaceae и разработка молекулярных маркеров для филогенетических приложений. ПЛОС Один. 2014;9(6):e99016. [Статья бесплатно PMC] [PubMed] [Google Scholar]

40. Koide CL, Collier AC, Berry MJ, Panee J. Влияние экстракта бамбука на печеночные биотрансформирующие ферменты — результаты исследования мышиной модели с ожирением и диабетом. J Этнофармакол. 2011;133(1):37–45. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

41. Cao H, Hu H, Colagiuri B, Liu J. Лекарственная баночная терапия у 30 пациентов с фибромиалгией: наблюдение серии случаев. Форш Комплементмед. 2011;18(3):122–6. [PubMed] [Google Scholar]

42. Jiao J, Lü G, Liu X, Zhu H, Zhang Y. Снижение уровня свинца в крови у мышей, подвергшихся воздействию свинца, с помощью пищевых добавок и натуральных антиоксидантов. J Sci Food Agric. 2011;91(3):485–91. [PubMed] [Google Scholar]

43. Wang J, Yue YD, Tang F, Sun J. Скрининг и анализ потенциальных биоактивных компонентов в плазме кроликов после перорального введения экстрактов горячей воды из листьев Bambusa textilis McClure. Молекулы. 2012;17(8):8872–85. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

44. Wysocki WP, Clark LG, Attigala L, Ruiz-Sanchez E, Duvall MR. Эволюция бамбука ( Bambusoideae ; Poaceae ): полный филогеномный анализ пластома. БМС Эвол Биол. 2015;15:50. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

45. Wu K, Mo C, Xiao H, Jiang Y, Ye B, Wang S. Imperialine и вертицинон из луковиц Fritillaria wabuensis ингибируют провоспалительные медиаторы в стимулированных ЛПС макрофагах RAW 264.7. Планта Мед. 2015;81(10):821–9. [PubMed] [Google Scholar]

46. Day PD, Berger M, Hill L, et al. Эволюционные отношения в важном с медицинской точки зрения роде Fritillaria L. ( Liliaceae ) Mol Phylogenet Evol. 2014; 80:11–9. [PubMed] [Google Scholar]

47. Hao DC, Gu XJ, Xiao PG, Peng Y. Фитохимические и биологические исследования Fritillaria медицинских ресурсов. Чин Дж. Нат Мед. 2013;11(4):330–44. [PubMed] [Академия Google]

48. Хао Д.К., Сяо П.Г., Лю М., Пэн И., Он С.Н. Фармафилогенез против фармакофилогеномики: молекулярная филогения, эволюция и открытие лекарств. Яо Сюэ Сюэ Бао. 2014;49(10):1387–94. [PubMed] [Google Scholar]

49. He K, Jiang XL. Небесные острова юго-западного Китая. I. Обзор филогеографических закономерностей. Чин Научный Бык. 2014;59:585–97. [Google Scholar]

50. Eaton DA, Ree RH. Вывод филогении и интрогрессии с использованием данных RADseq: пример цветковых растений ( Pedicularis : Orobanchaceae ) Syst Biol. 2013;62(5):689–706. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

51. Hao DC, Gu XJ, Xiao PG. Химико-биологические исследования клематисов лекарственных средств. Чин Научный Бык. 2013;58:1120–9. [Google Scholar]

52. Хао Д.С., Гу XJ, Сяо П.Г. Последние достижения в химических и биологических исследованиях фармацевтических ресурсов Aconitum . Дж. Чин Фарм. наук. 2013;22(3):209–21. [Google Scholar]

53. Hao DC, Xiao PG, Liu LW, et al. Основы фармакофилогении: родословная знаний, эпистемология и сдвиг парадигмы. Китай J Chin Mat Med. 2015;40(13):1–8. [PubMed] [Академия Google]

54. Джаббур Ф., Реннер С.С. Филогенез Delphinieae ( Ranunculaceae ) показывает, что Aconitum гнездятся внутри Delphinium и что переходы позднего миоцена к длинным жизненным циклам в Гималаях и Юго-Западном Китае совпадают со всплесками диверсификации. Мол Филогенет Эвол. 2012;62(3):928–42. [PubMed] [Google Scholar]

55. Whittall JB, Syring J, Parks M, et al. Нахождение (сосновой) иголки в стоге сена: расхождение последовательности генома хлоропластов у редких и широко распространенных сосен. Мол Экол. 2010;19(С1): 100–14. [PubMed] [Google Scholar]

56. Чжао З.З., Го П., Бранд Э. Формирование лекарственных материалов даоди. J Этнофармакол. 2012;140(3):476–81. [PubMed] [Google Scholar]

57. Henriquez CL, Arias T, Pires JC, Croat TB, Schaal BA. Филогеномика семейства растений Araceae . Мол Филогенет Эвол. 2014;75:91–102. [PubMed] [Google Scholar]

58. Сюй С.Ю., Хуан П.Л., Чен С.М., Мао С.Т., Чау С.М. Острый аромат в Toona sinensis ( Meliaceae ) листовки: выделение, функциональная характеристика и регуляция TsTPS1 и TsTPS2, двух ключевых генов терпенсинтазы в биосинтезе ароматического соединения. Карр Фарм Биотехнолог. 2012;13(15):2721–32. [PubMed] [Google Scholar]

59. Barrett CF, Specht CD, Leebens-Mack J, Stevenson DW, Zomlefer WB, Davis JI. Разгадка древних излучений: могут ли полные наборы пластидных генов пролить свет на глубокие взаимоотношения между тропическим имбирем (Zingiberales) [J]? Энн Бот. 2014; 113:119–33. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

60. Cai Z, Liu H, He Q, et al. Дифференциальная эволюция генома и видообразование Coix lacryma -jobi L. и Coix aquatica Roxb. гибрид guangxi, выявленный анализом повторяющихся последовательностей и точным кариотипированием. Геномика BMC. 2014;15:1025. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

61. Hofberger JA, Zhou B, Tang H, Jones JD, Schranz ME. Новый подход к идентификации многодоменных и многогенных семейств дает представление об эволюционной динамике генов устойчивости к болезням у основных растений эвдикота. Геномика BMC. 2014;15:966. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

62. Dutartre L, Hilliou F, Feyereisen R. Филогеномика пути биосинтеза бензоксазиноидов Poaceae : дупликации генов и происхождение кластера Bx. БМС Эвол Биол. 2012;12:64. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

63. Manrique-Carpintero NC, Tokuhisa JG, Ginzberg I, Holliday JA, Veilleux RE. Разнообразие последовательностей в кодирующих областях генов-кандидатов в пути биосинтеза гликоалкалоидов диких видов картофеля. G 3 (Бетесда) 2013; 3: 1467–79. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

64. Hofberger JA, Lyons E, Edger PP, Chris Pires J, Eric Schranz M. Сохранение всего генома и тандемных дубликатов способствовало диверсификации путей поступления глюкозинолатов в семейство горчичных. Геном Биол Эвол. 2013;5:2155–73. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

65. Han FM, Peng Y, Xu L, Xiao PG. Идентификация, характеристика и использование единичных копий генов в 29 геномах покрытосеменных растений. Геномика BMC. 2014;15:504. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

66. Yang Y, Moore MJ, Brockington SF, et al. Анализ молекулярной эволюции очень разнообразной ветви растений Caryophyllales с использованием секвенирования транскриптома. Мол Биол Эвол. 2015: pii–msv081. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

67. Cannon SB, McKain MR, Harkess A, et al. Множественные полиплоидии в ранней радиации клубеньковых и неклубеньковых бобовых. Мол Биол Эвол. 2015;32(1):193–210. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

68. Hollister JD, Greiner S, Wang W, et al. Периодическая потеря пола связана с накоплением вредных мутаций у энотер. Мол Биол Эвол. 2015;32(4):896–905. [PubMed] [Google Scholar]

69. Zhang F, Gao Q, Khan G, Luo K, Chen S. Сравнительный транскриптомный анализ надземных и подземных тканей Rhodiola algida , важного этномедицинского растения, эндемичного для Цинхая. -Тибетское нагорье. Ген. 2014;553(2):90–7. [PubMed] [Google Scholar]

70. Hao D, Ma P, Mu J, et al. De novo характеристика корневого транскриптома традиционного китайского лекарственного растения Polygonum cuspidatum . Наука Китая Life Sci. 2012;55(5):452–66. [PubMed] [Академия Google]

71. Hao da C, Ge G, Xiao P, Zhang Y, Yang L. Первое понимание транскриптома тканеспецифического таксона с помощью секвенирования второго поколения Illumina. ПЛОС Один. 2011;6(6):e21220. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

72. Wickett NJ, Mirarab S, Nguyen N, et al. Филотранскриптомный анализ происхождения и ранней диверсификации наземных растений. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014;111(45):E4859–68. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

73. Zeng Y, Guo LP, Chen BD, et al. Арбускулярный микоризный симбиоз для устойчивого выращивания китайских лекарственных растений: перспективное направление исследований. Am J Chin Med. 2013;41(6):1199–221. [PubMed] [Google Scholar]

74. Delaux PM, Varala K, Edger PP, Coruzzi GM, Pires JC, Ané JM. Сравнительная филогеномика раскрывает влияние симбиотических ассоциаций на эволюцию генома хозяина. Генетика PLoS. 2014;10(7):e1004487. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

75. Koenig D, Jiménez-Gómez JM, Kimura S, et al. Сравнительная транскриптомика выявляет закономерности отбора у одомашненных и диких томатов. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013;110(28):E2655–62. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

76. Sveinsson S, McDill J, Wong GK, et al. Филогенетическое выявление события палеополиплоидии в пределах рода льна ( Linum ) с использованием транскриптомики. Энн Бот. 2014;113(5):753–61. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

77. Kaliswamy P, Vellingiri S, Nathan B, Selvaraj S. Анализ микросателлитов в геноме Acanthaceae : подход in silico . Фармакогн Маг. 2015;11(41):152–6. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

78. Карими А., Хадиан Дж., Фарзанех М., Хадиви-Хуб А. Оценка генетической изменчивости, устойчивости к ржавчине и обнаружение маркеров в культивируемом Artemisia dracunculus из Ирана. Ген. 2015;554(2):224–32. [PubMed] [Google Scholar]

79. Li MM, Kasun M, Yan L, et al. Генетическое участие Camellia taliensis в одомашнивании C. sinensis var. assamica (ассимика чайная), выявленная ядерными микросателлитными маркерами. Ресурс разнообразия растений. 2015;37(1):29–37. [Google Scholar]

80. Wang S, Liu Y, Ma L, et al. Выделение и характеристика микросателлитных маркеров и анализ генетического разнообразия зизифуса китайского ( Ziziphus jujuba Mill.) PLoS One. 2014;9(6):e99842. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

81. Хао Д.К., Чен С.Л., Сяо П.Г., Пэн Ю. Аутентификация лекарственных растений с помощью ДНК-маркеров и геномики. Подбородок Herb Med. 2010;2(4):250–61. [Google Scholar]

82. Li XK, Wang B, Zheng YC, Song X, Wu YN, Chen L. Молекулярные символы Schisandra chinensis с белыми плодами от производителей RAPD и ISSR. Чжун Яо Цай. 2014;37(4):568–72. [PubMed] [Google Scholar]

83. Liu W, Yin D, Liu J, Li N. Генетическое разнообразие и структура Sinopodophyllum hexandrum (Royle) Ying в горах Циньлин, Китай. ПЛОС Один. 2014;9(10):e110500. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

84. Клевенджер Дж., Чаварро С., Перл С. А., Озиас-Акинс П., Джексон С.А. Идентификация однонуклеотидного полиморфизма у полиплоидов: обзор, пример и рекомендации. Мол завод. 2015;8(6):831–46. [PubMed] [Академия Google]

85. Guichoux E, Lagache L, Wagner S, et al. Современные тенденции микросателлитного генотипирования. Мол Эколь Ресурс. 2011;11(4):591–611. [PubMed] [Google Scholar]

86. Wee AK, Takayama K, Chua JL, et al. Генетическая дифференциация и филогеография частично симпатрического комплекса видов Rhizophora mucronata Lam. и R. stylosa Грифф. с использованием маркеров SSR. БМС Эвол Биол. 2015;15:57. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

87. You FM, Huo N, Gu YQ и др. BatchPrimer3: высокопроизводительное веб-приложение для разработки праймеров для ПЦР и секвенирования. Биоинформатика BMC. 2008;9:253. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

88. He J, Zhao X, Laroche A, Lu ZX, Liu H, Li Z. Генотипирование путем секвенирования (GBS), окончательный отбор с помощью маркеров ( MAS) инструмент для ускорения селекции растений. Фронт завод науч. 2014;5:484. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

89. Quan QM, Chen LL, Wang X, et al. Генетическое разнообразие и закономерности распространения насекомых-хозяев гусеничного гриба Ophiocordyceps sinensis на Цинхай-Тибетском нагорье. ПЛОС Один. 2014;9(3):e92293. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

90. Jiao Y, Paterson AH. Модификации генома, связанные с полиплоидией, в ходе эволюции наземных растений. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2014;369(1648):0355. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

91. Вэнь Дж., Чжан Дж. К., Ни З. Л., Чжун Й., Сун Х. Эволюционная диверсификация растений на Цинхай-Тибетском нагорье. Фронт Жене. 2014;5:4. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

92. Sternberg ED, de Roode JC, Hunter MD. Трансгендерная защита от паразитов, связанная с диетой отца. Дж Аним Экол. 2015;84(1):310–21. [PubMed] [Академия Google]

93. Шуази М., де Руд Дж.К. Экология и эволюция лекарств для животных: генетически фиксированная реакция против фенотипической пластичности. Я Нат. 2014;184(С1):С31–46. [PubMed] [Google Scholar]

94. Кеннеди Д.О. Полифенолы и человеческий мозг: экологические роли «вторичных метаболитов» растений и эндогенные сигнальные функции обеспечивают преимущества. Ад Нутр. 2014;5(5):515–33. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

95. Howitz KT, Sinclair DA. Ксеногормезис: восприятие химических сигналов других видов. Клетка. 2008; 133(3):387–9.1. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

96. Qi HY, Li L, Yu J. Xenohormesis: понимание биологических эффектов традиционной китайской медицины с эволюционной и экологической точки зрения. Чжунго Чжун Яо За Чжи. 2013;38(19):3388–94. [PubMed] [Google Scholar]

97. Юань XF, Пэн С.М., Ван Б.Л., Дин З.С. Влияние лет роста Paeonia lactiflora на бактериальное сообщество в ризосферной почве и содержание пеонифлорина. Чжунго Чжун Яо За Чжи. 2014;39(15): 2886–92. [PubMed] [Google Scholar]

98. Shi JY, Yuan XF, Lin HR, Yang YQ, Li ZY. Различия в свойствах почвы и бактериальных сообществах между ризосферой и насыпной почвой и между различными зонами выращивания лекарственного растения Fritillaria thunbergii . Int J Mol Sci. 2011;12(6):3770–85. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

99. Ying YX, Ding WL, Li Y. Характеристика почвенных бактериальных сообществ в ризосферной и неризосферной почве Женьшень обыкновенный . Биохим Генет. 2012; 50(11–12):848–59. [PubMed] [Google Scholar]

100. He C, Peng B, Dan Y, Peng Y, Xiao P. Химическая таксономия видов древовидных пионов из Китая на основе метаболических отпечатков пальцев коры корня. Фитохимия. 2014;107:69–79. [PubMed] [Google Scholar]

101. Xiao PG. Предварительное исследование корреляции между филогенезом, химическими составляющими и фармацевтическими аспектами в таксонах китайских Ranunculaceae . Acta Phytotaxo Sin. 1980;18(2):142–53. [Google Scholar]

102. Peng Y, Chen SB, Liu Y, Chen SL, Xiao PG. Фармакофилогенетическое исследование Berberidaceae (sl) Acta Phytotaxo Sin. 2006;44(3):241–57. [Google Scholar]

103. Searls DB. Фармакофилогеномика: гены, эволюция и лекарственные мишени. Nat Rev Drug Discov. 2003;2(8):613–23. [PubMed] [Google Scholar]

104. Yang Y, Smith SA. Вывод ортологии в немодельных организмах с использованием транскриптомов и геномов с низким охватом: повышение точности и заполнения матрицы для филогеномики. Мол Биол Эвол. 2014;31(11):3081–92. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

105. Hao DC, Xiao PG, Ma HY, Peng Y, He CN. Добыча хеморазнообразия из биоразнообразия: фармакофилогенез лекарственных растений Ranunculaceae . Чин Дж. Нат Мед. 2015;13(7):507–20. [PubMed] [Google Scholar]

106. Rønsted N, Symonds MR, Birkholm T, et al. Может ли филогенез предсказать химическое разнообразие и потенциальную лекарственную активность растений? Тематическое исследование Amaryllidaceae . БМС Эвол Биол. 2012;12:182. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

107. Леонти М., Кабрас С., Кастелланос М.Е., Челленджер А., Герч Дж., Касу Л. Биоразведка: эволюционные последствия постольмекской фармакопеи и актуальность широко распространенных таксонов. J Этнофармакол. 2013;147(1):92–107. [PubMed] [Google Scholar]

108. Saslis-Lagoudakis CH, Savolainen V, Williamson EM, et al. Филогении раскрывают предсказательную силу традиционной медицины в биоразведке. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012;109(39):15835–40. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

109. Грейс О.М., Буерки С., Саймондс М.Р. и др. Эволюционная история и сочность листьев как объяснение использования алоэ в медицинских целях и всемирной популярности Aloe vera . БМС Эвол Биол. 2015;15:29. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

110. Xiao PG, Wang LW, Lv SJ. Статистический анализ этнофармакологических данных на основе китайских лекарственных растений с помощью ЭВМ I. Magnoliidae. Чжун Си И Цзе Хэ За Чжи. 1986; 6 (4): 253–6. [PubMed] [Академия Google]

111. Xiao PG, Wang LW, Qiu GS, Sun J. Статистический анализ этнофармакологических данных на основе китайских лекарственных растений с помощью электронного компьютера II. Hamamelidae и Caryophylidae . Чжун Си И Цзе Хэ За Чжи. 1989;9(7):429–32. [PubMed] [Google Scholar]

112. Виллар М., Попара М., Мангольд А.Дж., де ла Фуэнте Дж. Сравнительная протеомика для характеристики наиболее важных видов клещей Amblyomma как переносчиков зоонозных патогенов во всем мире. J Протеомика. 2013;105:204–16. [PubMed] [Академия Google]

113. Martin DI, Singer M, Dhahbi J, et al. Филоэпигеномное сравнение человекообразных обезьян обнаруживает корреляцию между соматическими и зародышевыми состояниями метилирования. Геном Res. 2011;21:2049–57. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

114. Brindefalk B, Ettema TJ, Viklund J, Thollesson M, Andersson SG. Филометагеномное исследование океанических альфапротеобактерий выявило митохондриальных родственников, не связанных с кладой SAR11. ПЛОС Один. 2011;6:e24457. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

115. Хао Д.С., Гу XJ, Сяо П.Г. Недавний прогресс в химических и биологических исследованиях фармацевтических ресурсов Cimicifugeae . Подбородок Herb Med. 2013;5(2):81–95. [Google Scholar]

116. Чжу М., Сяо П.Г. Хемосистематические исследования Thalictrum L. в Китае. Acta Phytotaxon Sin. 1991;29(4):358–69. [Google Scholar]

117. Wang W, Lu AM, Ren Y, Endressc ME, Chen ZD. Филогенез и классификация Ranunculales свидетельствуют о четырех молекулярных локусах и морфологических данных. Perspect Plant Ecol Evol Systemat. 2009 г.;11:81–110. [Google Scholar]

118. Xiao PG, Wang FP, Gao F, et al. Фармакофилогенетическое исследование Aconitum L. ( Ranunculaceae ) из Китая. Acta Phytotaxon Sin. 2006;44(1):1–46. [Google Scholar]

119. Wang W, Liu Y, Yu SX, Gao T-G, Chen ZD. Gymnaconitum , новый род Ranunculaceae , эндемичный для Цинхай-Тибетского нагорья.