Лекарственное растение сообщение 2 класс: Малина. Сообщение о лекарственном растении для 2 класса

ГДЗ 3 класс — Окружающий мир. Плешаков. Тетрадь рабочая 2 часть, стр 34


  • Тип: ГДЗ, Решебник.
  • Автор: Плешаков А. А.
  • Год: 2020.
  • Серия: Школа России.
  • Издательство: Просвещение.

Подготовили готовое домашнее задание к упражнениям на 34
странице по предмету окружающий мир за 3 класс. Ответы на задания: 6, 7, 1 и 2.

Рабочая тетрадь 2 часть — Страница 34.

Ответы 2020 года.

Номер 6.

Здесь запиши продукты растениеводства, которые ты потребляешь в пищу в течение одного дня. Укажи дату исследования.

14 февраля: овес, пшеница, помидор, капуста, лук, морковь, яблоки, банан.

Номер 7.

Выясни, какие книги о культурных растениях есть в библиотеке. С помощью одной из них подбери интересные факты по теме урока и подготовь сообщение. Сделай записи в тетради.

Книги о культурных растениях: Шустров С. «Культурные растения»; Хапова С. «Все о ягодных культурах»; Жуковский П. «Культурные растения и их сородичи».

Тема сообщения: «Травы под ногами. Лекарственные растения».

План сообщения: 1. Что такое лекарственные растения. 2. Анютины глазки. 3. Буквица лекарственная. 4. Валериана лекарственная.

Источник информации: книга «Большая иллюстрированная энциклопедия лекарственных растений» Т. А. Ильина.

Сообщение

Все растения нужны, все растения важны. Маленькие травы, что встречаются под ногами не такие уж и маленькие, ведь могут залечить рану, снять кашель и температуру, порадовать своей красотой. В своем сообщении я расскажу о таких лекарственных растениях, которые являются культурными, а еще растут прямо под нашими ногами.

Анютины глазки – цветы с разнообразными названиями, которые повсеместно используются людьми. Анютка, иван-да-марья, фиалка трехцветная – не только украшение клумб, но крайне полезное лекарственное растение, которое было окультурено. Его дикий собрат применялся для лечения зуда и аллергии, а также многих других кожных заболеваний.

Буквица лекарственная – второе лекарственное культурное растение, которое применяется в народной и не только медицине.

Растение высотой 90 см, с шершавым игольчатым стеблем и резными листками.

Буквицу лекарственную одомашнили и нередко выращивают на окнах, ведь она применяется для лечения печени и кожных заболеваний, проблем с пищеварением и головных болях.

У некоторых людей есть аллергия на пыльцу буквицы и сок, которые попадают на кожу через царапины иголочками.

Валериана лекарственная – еще одно полезное растение, которое используется людьми для лечения неврозов, ведь валериана обладает успокоительным воздействием. Применяют для приготовления настоек корневище валерианы, которые собирают весной или осенью.
Правда, у некоторых людей это растение вызывает не покой, а наоборот, состояние возбуждения. Поэтому все травы нужно использовать с большой осторожностью.

Номер 1.

С помощью учебника сформулируй и запиши определение.

Животноводство – это разведение домашних животных.

Номер 2.

Подумай и запиши , какие из твоих потребностей удовлетворяются благодаря животноводству.

Потребности в питании, потребности в витаминах, одежде, предметах быта (подушки).

Рейтинг

Травянистые растения леса. (Окружающий мир. 2 класс)

Окружающий мир
2 класс
Белик Елена Сергеевна
учитель начальных
классов
МБОУ « СОШ № 87»
г. Северск
Тема:
ТРАВЯНИСТЫЕ РАСТЕНИЯ ЛЕСА
5klass.net
Борец синий
Многолетнее растение, 50-150 см в высоту. Листья пальчатые, 5-7раздельные с пильчатым краем. Фиолетово-синие цветки с
лепестковидной чашечкой, образующей куполообразный шлём, под
которым 2 удлинённых лепестка-нектарника. Соцветие –
многоцветковая конечная кисть. Плод – трёхлистовка. Цветёт в июнеавгусте. Растёт во влажных лесах и нагорных лугах. Декоративное
лекарственное растение, ядовитое. В сходных местообитаниях,
главным образом, в горах, растёт похожий вид с желтыми цветками.
Вороний глаз четырехлистный
Многолетнее травянистое растение с длинным чешуйчатым корневищем.
Цветет в мае, семена созревают в июле-августе. Растет преимущественно в
широколистных лесах, обычно в затененных местах, а также в хвойных и
смешанных насаждениях, но хорошего развития там не достигает.
Ядовитое растение.
Дудник лесной
Двулетнее или многолетнее растение, отмирающее после
плодоношения. Стебель полый, высотой до 200 см, с сизоватым
налётом, в верхней части с немногочисленными ветвями.
Лепестки белые или снаружи розоватые. Плоды коричневые.
Цветёт с середины лета до глубокой осени, плоды созревают с
августа. Растёт в сырых лесах, на полянах, вырубках, опушках,
травянистых болотах, по берегам водоёмов. Хороший медонос.
Живучка ползучая
Многолетнее травянистое растение высотой от 8 до 35 см, с
длинными ползучими укореняющимися побегами и
прямостоячими цветоносными стеблями. Листья овальные.
Цветки синие или голубые, на верхушке стебля образуют плотное
колосовидное соцветие. Цветёт в мае – июле, плоды созревают в
июне – августе. Растёт в лесах, преимущественно лиственных, на
опушках, полянах, в зарослях кустарников. Медоносное растение.
Зеленчук жёлтый
Многолетнее растение, 15-45 см в высоту. Побеги прямостоячие или
приподнимающиеся. Листья городчатые; нижние – с длинными
черешками, тупые, сердцевидно – яйцевидные, верхние – с более
короткими черешками, острые. Цветки жёлтые, на нижней губе красные
крапинки. Цветёт в мае – июне. В сырых лесах и кустарниках.
Копытень европейский
Вечнозелёное многолетнее травянистое растение со шнуровидным
ползучим корневищем и ползучим укореняющимся разветвлённым
стеблем. Семена распространяются муравьями. Растение имеет
специфический запах. Цветёт в апреле-мае; семена созревают в июне. В
хвойных, широколиственных лесах и хвойно-широколиственных тенистых
лесах. Ядовитое растение. Препараты из корневищ и листьев издавна
применялись в народной медицине и ветеринарии.
Костяника
Многолетнее растение с ползучими побегами и прямостоячими
цветоносными стеблями высотой около 20см. Листья тройчатые, с
длинными черешками. Цветки белые, пятичленные, собраны по 3-10 в
верхушечных зонтиковидных или кистевидных соцветиях. Плодики костянки немногочисленные (обычно в числе 1- 6), крупные, яркокрасные, едва соединенные между собой. Цветет в мае – июне,
плодоносит в июне – июле. Плоды употребляются в пищу в сыром и
переработанном виде (соки, морс, джем). Медонос.
Крапива двудомная
Многолетнее травянистое растение высотой до 1,5 м, с длинными
горизонтальными корневищами. Цветёт и плодоносит всё лето.
Размножается семенами (одно растение даёт до 22000 семян) и
вегетативным путём. Образует обширные густые заросли. Разрастается у
жилищ, дорог, изгородей, на пустырях и т.п. Характерна для нарушенных
сырых лесов. Ценное пищевое и лекарственное растение. Из молодых
листьев и побегов варят весной зелёные щи. Как лечебное и
профилактическое средство они применяются при гипо- и авитаминозах.
Препараты крапивы используются как кровоостанавливающее и
ранозаживляющее средство, входят в состав желчегонных препаратов. В
народной медицине используется также как средство для укрепления
волос. Ценное кормовое растение, особенно для свиней и домашней
птицы. Побеги молодой крапивы в отваренном виде увеличивают удои
коров и повышают процент содержания жира в молоке. Из стеблей можно
получать волокно для изготовления верёвок и грубых тканей. Листья и
корневище прежде использовались для получения зелёной краски для
шерсти.
Лопух паутинистый
Двулетнее растение высотой 60-100 см, с мясистым веретенообразным
корнем. Стебли мощные, зелёные или красноватые, бороздчатые, сильно
ветвистые, под корзинками паутинисто опушенные. Листья крупные,
яйцевидные. Из корней получают так называемое «репейное масло»,
которое используют для укрепления волос на голове. Молодые мясистые
стебли, освобождённые от кожицы, съедобны.
Лютик ползучий
Многолетнее травянистое растение высотой от 10 до 40 см, с ползучими
укореняющимися побегами. Стебель толстый, сочный. Листья
длинночерешковые, тройчатые, листочки с черешочками. Цветок с пятью
оттопыренными чашелистиками, Цветёт с весны до конца лета,
соответственно плоды созревают в разное время. В средней полосе это
обычное растение сырых лугов, болот, разреженных лесов, грунтовых дорог.
Ядовитое растение.
Медуница неясная
Многолетнее травянистое растение высотой от 8 до 30 см. Цветки с
розовым в начале цветения, позднее синеющим венчиком. Цветет в апреле
– мае, плоды созревают в мае – июне. Растет в лесах, оврагах, зарослях
кустарников. Декоративное ранневесеннее растение. Хороший медонос.
Листья богаты аскорбиновой кислотой и другими витаминами, съедобны,
пригодны для салата.
Нивяник обыкновенный
Многолетнее травянистое растение с коротким корневищем, высотой 15-60
см и прикорневой розеткой. Краевые ложноязычковые цветки в корзинках
очень длинные, белые, не образуют семян. Срединные трубчатые цветки
жёлтой окраски, дают нормальные плоды-семянки. Цветёт в мае-августе,
плоды созревают в июне-сентябре. Произрастает на лугах, лесных полянах,
опушках, обочинах дорог, в редкостойных лесах, на вырубках. В народе по
всей России нивяник обычно зовут «ромашкой».
Горец змеиный (змеевик)
Многолетнее травянистое растение, образующее толстое
змеевидно изогнутое корневище до 1 -1,5 см в диаметре. Цветки
розовые, мелкие, собраны на верхушке стебля в густое, крупное,
цилиндрическое, колосовидное соцветие длиной 1,5-6 см и
шириной 1-1,5 см.
Цветёт с конца мая до конца июня. Является хорошим
медоносом.
Применяют при острых и хронических заболеваниях кишечника,
сопровождающихся поносами не дизентерийного
происхождения. Наружно препараты из горца змеиного
используют при заболеваниях слизистых оболочек, в частности
при стоматитах, гингивитах и других заболеваниях полости рта.
Борщевик сибирский
Многолетнее высокое жёсткоопушенное травянистое растение высотой
90-150 см. Листья крупные, с тремя — семью широкояйцевидными
долями. Цветки мелкие, зеленовато-белые, с пятью свободными
лепестками. Цветки собраны в сложные многолучевые зонтики. Цветёт в
июне-августе. Цветки дают пчёлам нектар и пыльцу. Настой травы и отвар
или настой корней улучшают плохое пищеварение, обладают вяжущим,
противоспазматическим, успокаивающим, противовоспалительным,
обезболивающим и антисептическим действием. Настой травы, а чаще
отвар корней применяют внутрь при расстройствах деятельности желудка
и кишечника, кожных заболеваниях и особенно при судорогах различного
происхождения, эпилепсии и других нервных заболеваниях. Наружно
спиртовую настойку корней употребляют при зубной боли, а отвар всего
растения с корнями используют в виде примочек при чесотке и, в виде
припарок, — при опухолях. Распаренные листья употребляют для
припарок при воспалении суставов и ревматических болях.

Лечебно-целебный сад | Фармацевтический колледж НГУ

«Цель нашей жизни – быть счастливыми» —
Далай-лама

Каждое утро в Азии миллионы людей проходят курс рефлексотерапии, чтобы улучшить свое самочувствие и уменьшить хроническую боль. Исследования, восхваляющие преимущества рефлексотерапии, пришли к выводу, что ходьба по мощеным коврикам в помещении снижает кровяное давление и улучшает равновесие (, Журнал Американского общества гериатрии, , 2005).

В апреле 2010 года Нова Юго-Восточный университет открыл первую дорожку рефлексологии стопы, построенную на Восточном побережье США, расположенную в0006 e Лечебный и лечебный сад университета . Гостям были предложены познавательные экскурсии и прогулки босиком по Саду и Тропе. Президент университета Джордж Л. Хэнбери II, доктор философии, и декан Фармацевтического колледжа Андрес Малаве, доктор философии, отметили в своих инаугурационных выступлениях, что Медицинский и лечебный сад НГУ знаменует собой приверженность университета здоровому образу жизни и интегративной медицине. .

Карстен Эванс, доктор философии ., исполнительный директор по непрерывному образованию и профессиональным вопросам в Фармацевтическом колледже НГУ, отвечает за видение, план действий и финансы включения пути рефлексологии и лечебного компонента в разлагающийся сорняк. за запущенный лекарственный сад. После очистки территории от пятнадцати оригинальных лекарственных растений он поручил Элизабет Маразите из Женевы, Швейцария, спроектировать путь рефлексотерапии. Она прибыла в начале января со своей командой монтажников, чтобы уложить специальные камни из Мексики, Перу, Китая, Индии и Теннесси по шаблонам, посвященным науке о рефлексологии стопы. Джесси Дюрко, всемирно известному ландшафтному дизайнеру, было поручено создать вспомогательную среду из редких и необычных растений, которые улучшали бы и способствовали исцелению через обоняние, зрение и слух (например, специи, мята, яркие цветные растения, бамбук, колокольчики и т. д.). водопады).

В самом сердце Лечебно-целебного сада НГУ находится 66-футовая усыпанная терапевтическими камнями тропа рефлексотерапии . Принципы рефлексотерапии основаны на древневосточном учении о самолечении путем стимуляции различных точек давления на стопах при ходьбе по замысловатому узору из камней. Путь отражает тему пяти элементов китайского меридиана: воды, дерева, огня, земли и металла, каждый из которых представляет время года, систему органов и цвет.

Лечебно-целебный сад украшен тропическими растениями со всего мира, обладающими целебными свойствами, что делает его интернациональным жилым классом. Некоторые растения были выбраны за их визуальные качества и привлекающий внимание дизайн, другие — за их ароматы, а некоторые — за их естественную гармонию с бабочками и птицами. Образец Инь/Ян насаждений вокруг Пути Рефлексологии представляет собой восточную философию баланса.

Остров Garden and Pathway в комплексе NSU, к западу от библиотеки и центра информационных технологий Элвина Шермана, за зданием Parker Building, приглашает как студентов, так и посетителей на уникальный опыт лечения и обучения. Это место, которое может будоражить чувства и исцелять тело, успокаивая душу.

Для индивидуальных или групповых туров и/или информации о предоставлении возможностей, свяжитесь с Carsten Evans, Ph. D. [email protected], тел.: (954) 262-1306

In Silico Оценка фитокомпонентов иранских лекарственных растений в качестве ингибиторов основной протеазы и рецептор-связывающего домена SARS-CoV-2

1. MacKenzie J.S., Smith Д.В. COVID-19-Новое зоонозное заболевание: обзор болезни, вируса и мер общественного здравоохранения. Азия-Тихоокеанский регион. Дж. Общественное здравоохранение. 2020; 32: 145–153. дои: 10.1177/1010539520931326. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

2. Чжоу М., Чжан С., Цюй Дж. Коронавирусная болезнь 2019 г. (COVID-19): клиническое обновление. Фронт. Мед. 2020;14:126–135. doi: 10.1007/s11684-020-0767-8. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

3. Айерди О., Пуэрта Т., Клаво П., Вера М., Баллестерос Дж., Фуэнтес М.Е., Эстрада В., Родригес К., Дель Ромеро Дж. Профилактическая эффективность тенофовира/эмтрицитабина против тяжелого острого респираторного синдрома Коронавирус 2 среди пользователей доконтактной профилактики. Откройте форум Infect. Дис. 2020;7:ofaa455. дои: 10.1093/ofid/ofaa455. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

4. Chien M., Anderson T.K., Jockusch S., Tao C., Kumar S., Li X., Russo J.J., Kirchdoerfer R.N., Ju J. , Аналоги нуклеотидов как ингибиторы полимеразы SARS-CoV-2. bioRxiv Prepr. Серв. биол. 2020 г.: 10.1101/2020.03.18.997585. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

5. Huang H., Gong X. Обзор предсказания расстояния между остатками белка. Курс. Биоинформ. 2020;15:821–830. дои: 10.2174/1574893615999200425230056. [CrossRef] [Google Scholar]

6. Tan Q., Duan L., Ma Y., Wu F., Huang Q., Mao K., Xiao W., Xia H., Zhang S., Zhou Э. и др. Подходит ли осельтамивир для борьбы с COVID-19: оценка in silico, исследование in vitro и ретроспективное исследование. биоорг. хим. 2020;104:104257. doi: 10.1016/j.bioorg.2020.104257. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

7. Ван Ю., Чжан Д., Ду Г., Ду Р. , Чжао Дж., Цзинь Ю., Фу С., Гао Л. , Cheng Z., Lu Q. и др. Ремдесивир у взрослых с тяжелой формой COVID-19: рандомизированное двойное слепое плацебо-контролируемое многоцентровое исследование. Ланцет. 2020; 395: 1569–1578. doi: 10.1016/S0140-6736(20)31022-9. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

8. Таллей Т.Е., Тумилаар С.Г., Ломбоджиа Л.Т., Адам А.А., Сакиб С.А., Эмран Т.Б., Идроэс Р. Потенциал бетацианина как ингибитора SARS-CoV- 2, обнаруженный при исследовании молекулярного докинга. ИОП конф. сер. Земная среда. науч. 2021;711:12028. doi: 10.1088/1755-1315/711/1/012028. [CrossRef] [Академия Google]

9. Wiersinga W.J., Rhodes A., Cheng A.C., Peacock S.J., Prescott H.C. Патофизиология, передача, диагностика и лечение коронавирусной болезни 2019 (COVID-19): обзор. ДЖАМА. 2020; 324: 782–793. doi: 10.1001/jama.2020.12839. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

10. Du H., Hou X.-Y., Miao Y.-H., Huang B.-S., Liu D.-H. Традиционная китайская медицина: эффективное лечение новой коронавирусной пневмонии (NCP) 2019 г. Чин. Дж. Нат. Мед. 2020;18:206–210. doi: 10.1016/S1875-5364(20)30022-4. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

11. Ян Ю., Ислам М.С., Ван Дж., Ли Ю., Чен Х. Традиционная китайская медицина в лечении пациентов, инфицированных новым коронавирусом 2019 года (SARS-CoV-2): обзор и перспектива. Междунар. Дж. Биол. науч. 2020;16:1708–1717. doi: 10.7150/ijbs.45538. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

12. Бенарба Б., Пандиелла А. Лекарственные растения как источники активных молекул против COVID-19. Фронт. Фармакол. 2020;11:1189. doi: 10.3389/fphar.2020.01189. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

13. Цао Б., Ван Ю., Вэнь Д., Лю В., Ван Дж., Фан Г., Руан Л., Сун Б., Цай Ю., Вэй М. и др. Испытание лопинавира-ритонавира у взрослых, госпитализированных с тяжелой формой Covid-19. Н. англ. Дж. Мед. 2020; 382: 1787–1799. doi: 10.1056/NEJMoa2001282. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

14. Дутта М., Тарек А.М., Ракиб А., Махмуд С., Сами С.А., Маллик Дж., Ислам М.Н., Маджумдер М., Уддин М.З. , Алсубаи А. и др. Фитохимические вещества из Leucas zeylanica , нацеленные на основную протеазу SARS-CoV-2: химические профили, молекулярная стыковка и моделирование молекулярной динамики. Биология. 2021;10:789. doi: 10.3390/biology10080789. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

15. Махмуд С., Бисвас С., Пол Г.К., Мита М.А., Проми М.М., Афроз С., Хасан Р., Заман С., Уддин М.С. , Дхама К. и др. Фитохимический скрининг на основе растений путем нацеливания на основную протеазу SARS-CoV-2 для разработки эффективных сильнодействующих ингибиторов. Биология. 2021;10:589. doi: 10.3390/biology10070589. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

16. Ульрих С., Ницше К. Основная протеаза SARS-CoV-2 как мишень для лекарства. биоорг. Мед. хим. лат. 2020;30:127377. doi: 10.1016/j.bmcl.2020.127377. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

17. Tai W., He L., Zhang X., Pu J., Voronin D., Jiang S., Zhou Y., Du L. Характеристика рецептор-связывающего домена (RBD) нового коронавируса 2019 года: Значение для разработки белка RBD в качестве ингибитора прикрепления вируса и вакцины. Клетка. Мол. Иммунол. 2020; 17: 613–620. doi: 10.1038/s41423-020-0400-4. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

18. Дэвид А.Б., Диамант Э., Дор Э., Барнеа А., Натан Н., Левин Л., Чепмен С., Мимран Л.С., Эпштейн Э., Зичел Р. и др. Идентификация ингибиторов связывания рецепторов SARS-CoV-2 путем скрининга библиотек лекарств in vitro. Молекулы. 2021;26:3213. дои: 10.3390/молекул 26113213. [PMC free article] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

19. Bojadzic D., Alcazar O., Chen J., Chuang S.T., Condor Capcha J.M., Shehadeh L.A., Buchwald P. Низкомолекулярные ингибиторы Всплеск коронавируса: белок-белковое взаимодействие ACE2 как блокаторы вирусного прикрепления и проникновения для SARS-CoV-2. Заражение АКС. Дис. 2021; 7: 1519–1534. doi: 10.1021/acsinfecdis.1c00070. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

20. Махмуд С., Мита М.А., Бисвас С., Пол Г.К., Проми М.М., Афроз С., Хасан Р., Шиму С.С., Заман С. , Уддин С. и др. Исследование молекулярной стыковки и динамики для изучения молекул фитохимического лиганда против основной протеазы SARS-CoV-2 на основе обширных наборов фитохимических данных. Эксперт преп. клин. Фармакол. 2021: 1–11. дои: 10.1080/17512433.2021.1959318. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

21. Талеви А. Компьютерный дизайн лекарств: обзор. Методы Мол. биол. 2018; 1762:1–19. doi: 10.1007/978-1-4939-7756-7_1. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

22. Броги С. Вычислительные подходы к открытию лекарств. Молекулы. 2019;24:3061. doi: 10,3390/молекулы24173061. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

23. Hung C.-L., Chen C.-C. Вычислительные подходы к открытию лекарств. Наркотик Дев. Рез. 2014;75:412–418. doi: 10.1002/ddr.21222. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

24. Виейра Т.Ф., Соуза С.Ф. Сравнение AutoDock и Vina в распознавании лигандов/приманок для виртуального скрининга. заявл. науч. 2019;9:4538. doi: 10.3390/app9214538. [CrossRef] [Google Scholar]

25. Riva L., Yuan S., Yin X., Martin-Sancho L., Matsunaga N., Pache L., Burgstaller-Muehlbacher S., De Jesus P.D., Teriete P. , Hull M.V., et al. Открытие противовирусных препаратов против SARS-CoV-2 путем крупномасштабного перепрофилирования соединений. Природа. 2020; 586: 113–119. doi: 10.1038/s41586-020-2577-1. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

26. Чубук Х., Озбил М. Сравнение клинически одобренных молекул белков-мишеней лекарств против SARS-CoV-2: исследование молекулярного докинга. Турок. Дж. Хим. 2021;45:35–41. doi: 10.3906/kim-2008-35. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

27. Sailah I., Tumilaar S.G., Lombogia L.T. Изучение молекулярной стыковки и динамического моделирования отдельных фитокомпонентов листьев Pangi ( Pangium edule Reinw) в качестве средства против SARS-CoV-2. Филипп. J. Sci. 2021; 150: 925–937. [Академия Google]

28. Фатимавали, Маулана Р.Р., Виндах А., Вахонган И.Ф., Тумилаар С.Г., Адам А.А., Кепел Б.Дж., Бодхи В., Таллей Т.Е. Данные о докинге фитокомпонентов бетеля и зеленого чая маття на SARS-CoV-2. Данные Бр. 2021;36:107049. doi: 10.1016/j.dib.2021.107049. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

Антигепатитная активность изохинолиновых алкалоидов растительного происхождения. Арка Вирол. 2014;159: 1119–1128. doi: 10.1007/s00705-013-1937-7. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

30. Таллей Т.Е., Тумилаар С.Г., Ниоде Н.Дж., Фатимавали, Кепел Б.Дж., Идроес Р., Эффенди Ю., Сакиб С.А., Эмран Т.Б. Потенциал растительных биоактивных соединений в качестве ингибиторов основной протеазы (Mpro) и шипа (S) гликопротеина SARS-CoV-2: исследование молекулярной стыковки. Научная. 2020: 1–18. doi: 10.1155/2020/6307457. [PMC free article] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

31. Лутар З., Герм М., Ликар М. , Голоб А., Фогель-Микуш К., Понграк П., Кушар А., Правст И., Крефт И. Селекция гречихи на повышенное содержание рутина, кверцетина и других биоактивных соединений с потенциальным противовирусным действием. Растения. 2020;9:1638. doi: 10.3390/plants9121638. [Статья PMC free] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

32. Рахман Ф., Табрез С., Али Р., Алькахтани А.С., Ахмед М.З., Руб А. Молекулярный докинг-анализ рутина показывает возможное ингибирование ОРВИ -Жизненно важные белки CoV-2. Дж. Традит. Дополнение. Мед. 2021; 11: 173–179. doi: 10.1016/j.jtcme.2021.01.006. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

33. Calzada F., Correa-Basurto J., Barbosa E., Mendez-Luna D., Yepez-Mulia L. Антипротозойные компоненты от Annona cherimola Miller , растение, используемое в мексиканской народной медицине для лечения диареи и дизентерии. Фармакогн. Маг. 2017;13:148–152. дои: 10.4103/0973-1296.197636. [Статья бесплатно PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

34. Бхарати Д., Бхуванешвари В. Синтез наночастиц оксида цинка (ZnO NPs) с использованием чистого биофлавоноида рутина и их биомедицинские применения: антибактериальная, антиоксидантная и цитотоксическая активность . Рез. хим. промежуточный. 2019;45:2065–2078. doi: 10.1007/s11164-018-03717-9. [CrossRef] [Google Scholar]

35. Риццути Б., Гранде Ф., Конфорти Ф., Хименес-Алесанко А., Себальос-Лайта Л., Ортега-Аларкон Д., Вега С., Рейберн Х.Т., Абиан О. ., Веласкес-Кампой А. Рутин является низкомикромолярным ингибитором основной протеазы 3CLpro SARS-CoV-2: значение для разработки лекарственных препаратов аналогов кверцетина. Биомедицины. 2021;9:375. doi: 10.3390/биомедицины9040375. [PMC free article] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

36. Ракиб А., Пол А., Чи М., Сами С.А., Барал С.К., Маджумдер М., Тарек А.М., Амин М.Н., Шахриар А. , Уддин М.З. и соавт. Биохимический и вычислительный подход к отдельным фитосоединениям из Tinospora crispa при лечении COVID-19. Молекулы. 2020;25:3936. doi: 10,3390/молекулы25173936. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

37. Shang X.-F., Yang C.J., Morris-Natschke S.L., Li J.C., Yin X.D., Liu YQ., Guo X., Peng J.W., Гото М., Чжан Дж.Ю. и др. Биологически активные изохинолиновые алкалоиды за 2014-2018 гг. Мед. Рез. 2020; 40:2212–2289. doi: 10.1002/med.21703. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

38. Гарг С., Рой А. Анализ выбранных алкалоидов in silico против основной протеазы (M(pro)) SARS-CoV-2. хим. биол. Взаимодействовать. 2020;332:109309. doi: 10.1016/j.cbi.2020.109309. [PMC free article] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

39. Геби Г.А., Адегунлое А.П., Ибрагим И.М., Огуньеми О.М., Афолаби С.О., Огунро О.Б. Предотвращение проникновения в клетки SARS-CoV-2: данные in silico о взаимодействии лекарствоподобных алкалоидов с шиповидным гликопротеином, человеческим ACE2 и TMPRSS2. Дж. Биомол. Структура Дин. 2020: 1–25. дои: 10.1080/07391102.2020.1835726. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

Выделение, спектроскопическая характеристика, рентгеновские исследования, теоретические исследования, а также цитотоксичность самаркандина in vitro. биоорг. хим. 2016;66:27–32. doi: 10.1016/j.bioorg.2016.03.005. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

41. Хан Дж., Сакиб С.А., Махмуд С., Хан З., Ислам М.Н., Сакиб М.А., Эмран Т.Б., Симал-Гандара Дж. Идентификация потенциальных фитохимических веществ из Citrus limon против основной протеазы SARS-CoV-2: молекулярная стыковка, молекулярно-динамическое моделирование и квантовые вычисления. Дж. Биомол. Структура Дин. 2021;2021:1–12. doi: 10.1080/07391102.2021.1947893. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

42. Салим С., Мухаммад Г., Хуссейн М.А., Альтаф М., Бухари С.Н.А. Withania somnifera L.: взгляд на фитохимический профиль, терапевтический потенциал, клинические испытания и перспективы на будущее. Иран. J. Basic Med. науч. 2020; 23: 1501–1526. doi: 10.22038/IJBMS.2020.44254.10378. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

43. Уайт П.Т., Субраманиан К., Мотивала Х.Ф., Коэн М.С. Натуральные витанолиды в лечении хронических заболеваний. Доп. Эксп. Мед. биол. 2016; 928:329–373. doi: 10.1007/978-3-319-41334-1_14. [PMC free article] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

44. Ханал П., Чихале Р., Дей Ю.Н., Паша И., Чанд С., Гурав Н., Айянар М., Патил Б.М., Гурав S. Витанолиды из Withania somnifera в качестве усилителя иммунитета и их терапевтические возможности против COVID-19. Дж. Биомол. Структура Дин. 2021: 1–14. дои: 10.1080/07391102.2020.1869588. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

45. Ding F., Liu J., Du R., Yu Q., Gong L., Jiang H., Rong R. Качественный и количественный анализ химических составляющих Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg Использование сверхвысокоэффективной жидкостной хроматографии/гибридной масс-спектрометрии с квадрупольно-орбитальной ловушкой и предварительный скрининг на наличие вируса гриппа. Эвид. Основан. Дополнение. Альтернативный. Мед. 2019;2019:9414926. doi: 10.1155/2019/9414926. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

46. Свидерек К., Молинер В. Выявление молекулярных механизмов протеолиза SARS-CoV-2 M(pro) с помощью вычислительных методов QM/MM. хим. науч. 2020;11:10626–10630. doi: 10.1039/D0SC02823A. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

47. Датта М., Незам М., Чоудхури С., Ракиб А., Пол А., Сами С.А., Уддин М.З., Рана М.С., Хоссейн С. ., Эффенди Ю. и др. Оценка бангладешского лекарственного растения Calotropis gigantea , используемого народными врачами при лечении COVID-19: биохимический и вычислительный подход. Фронт Мол. Бионауч. 2021;8:625391. doi: 10.3389/fmolb.2021.625391. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

48. Lan J., Ge J., Yu J., Shan S., Zhou H., Fan S., Zhang Q., Shi X. , Ван К., Чжан Л. и др. Структура домена, связывающего шиповидный рецептор SARS-CoV-2, связанного с рецептором ACE2. Природа. 2020; 581: 215–220. doi: 10.1038/s41586-020-2180-5. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

49. Yan R., Zhang Y., Li Y., Xia L., Guo Y., Zhou Q. Структурная основа распознавания SARS-CoV-2 полным -длина человека ACE2. Наука. 2020;367:1444–1448. doi: 10.1126/science.abb2762. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

50. Махмуд С., Пол Г.К., Афрозе М., Ислам С., Гупт С.Б.Р., Разу М.Х., Бисвас С., Заман С., Уддин М.С., Хан М. и др. Эффективность фитохимических веществ, полученных из Avicennia officinalis , для лечения COVID-19: комбинированное исследование in silico и биохимическое исследование. Молекулы. 2021;28:2210. doi: 10,3390/молекулы26082210. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

51. Хан А., Зия Т., Сулеман М., Хан Т., Али С.С., Аббаси А.А., Мохаммад А., Вей Д.К. Более высокая инфекционность новых вариантов SARS-CoV-2 связана с мутантами K417N/T, E484K и N501Y: анализ структурных данных. Дж. Селл. Физиол. 2021 г.: 10.1002/jcp.30367. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

52. Юань М., Ву Н.К., Чжу С., Ли К.Д., Со Р., Лв Х., Мок С., Уилсон И.А. Высококонсервативный криптический эпитоп в доменах связывания рецепторов SARS-CoV-2 и SARS-CoV. Наука. 2020; 368: 630–633. doi: 10.1126/science.abb7269. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

53. Huo J., Zhao Y., Ren J., Zhou D., Duyvesteyn H., Ginn H.M., Carrique L., Malinauskas T., Руза Р.Р., Шах П. и др. Нейтрализация SARS-CoV-2 путем разрушения префузионного спайка. Клеточный микроб-хозяин. 2020;28:445–454.e6. doi: 10.1016/j.chom.2020.06.010. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

54. Лонг Ф., Николлс Р.А., Эмсли П., Гражулис С., Меркис А., Вайткус А., Муршудов Г.Н. AceDRG: Генератор стереохимического описания лигандов. Pt 2Acta Crystallogr. Разд. D Структура. биол. 2017;73:112–122. doi: 10.1107/S2059798317000067. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

55. Guterres H., Im W. Улучшение результатов стыковки белков-лигандов с помощью высокопроизводительного моделирования молекулярной динамики. Дж. Хим. Инф. Модель. 2020;60:2189–2198. doi: 10.1021/acs.jcim.0c00057. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

56. Serillon D., Bo C., Barril X. Тестирование автоматических методов для прогнозирования свободной энергии связывания комплексов «хозяин-гость» при заражении SAMPL7. Дж. Вычисл. Помощь. Мол. Дес. 2021; 35: 209–222. doi: 10.1007/s10822-020-00370-6. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

57. Угоне В., Санна Д., Руджиу С., Шортино Г., Гаррибба Э. Ковалентное и нековалентное связывание в ванадий-белковых аддуктах. неорг. хим. Фронт. 2021; 8: 1189–1196. doi: 10.1039/D0QI01308K. [Перекрестная ссылка] [Академия Google]

58. Ракиб А., Наин З., Ислам М.А., Сами С.А., Махмуд С., Ислам А., Ахмед С., Сиддики А.Б.Ф., Бабу С.М.О.Ф., Хоссейн П. и др. Подход к молекулярному моделированию для выявления противовирусных селенсодержащих гетероциклических соединений, которые ингибируют основную протеазу SARS-CoV-2: исследование in silico. Краткий. Биоинформ. 2021; 22: 1476–1498. doi: 10.1093/bib/bbab045. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

59. Де Андраде F.d.C.P., Мендес А.Н. Вычислительный анализ ингибирующей активности эвгенола в путях липоксигеназы и циклооксигеназы. науч. Респ. 2020; 10:16204. дои: 10.1038/s41598-020-73203-з. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

60. Мхатре С., Найк С., Патравейл В. Исследование молекулярной стыковки EGCG и дигаллата теафлавина с лекарственными мишенями SARS-CoV-2. вычисл. биол. Мед. 2021;129:104137. doi: 10.1016/j.compbiomed.2020.104137. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

61. Бхардвадж В.К., Сингх Р., Шарма Дж., Дас П., Пурохит Р. Структурное исследование для выявления новых потенциальных ингибиторов тирозина двойной специфичности. киназа, регулируемая фосфорилированием. вычисл. Методы Программы Биомед. 2020;194:105494. doi: 10.1016/j.cmpb.2020.105494. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

62. Артур Д.Э., Узаиру А. Молекулярные исследования взаимодействия противораковых аналогов NCI с каталитической субъединицей фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфат-киназы человека. Университет Дж. Короля Сауда. науч. 2019;31:1151–1166. doi: 10.1016/j.jksus.2019.01.011. [CrossRef] [Google Scholar]

63. Оласупо С.Б., Узаиру А., Шаллангва Г., Уба С. Моделирование QSAR, молекулярный докинг и ADMET/фармакокинетические исследования: хемометрический подход к поиску новых ингибиторов переносчика норадреналина в качестве мощных антипсихотических средств. наркотики. Дж. Иран. хим. соц. 2020;17:1953–1966. doi: 10.1007/s13738-020-01902-5. [CrossRef] [Google Scholar]

64. Де Фрейтас Р.Ф., Шапира М. Систематический анализ взаимодействий атомных белок-лиганд в PDB. Медхимком. 2017; 8: 1970–1981. doi: 10.1039/C7MD00381A. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

65. Ван Ю., Лю М., Гао Дж. Усиленное связывание рецептора SARS-CoV-2 посредством сетей водородных связей и гидрофобных взаимодействий. проц. Натл. акад. науч. США. 2020;117:13967–13974. doi: 10.1073/pnas.2008209117. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

66. Ниманн Т., Штанге П., Страте А., Людвиг Р. Когда водородная связь преодолевает кулоновское отталкивание: от кинетической к термодинамической стабильности катионного димеры. физ. хим. хим. физ. 2019;21:8215–8220. doi: 10.1039/C8CP06417B. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

67. Liu K., Watanabe E., Kokubo H. Изучение стабильности режимов связывания лиганда с белками с помощью моделирования молекулярной динамики. Дж. Вычисл. Помощь. Мол. Дес. 2017;31:201–211. doi: 10.1007/s10822-016-0005-2. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

68. Геада И.Л., Рамезани-Дакхел Х., Джамиль Т., Сулпизи М., Хайнц Х. Изучение индуцированных зарядов на металлических поверхностях и биоинтерфейсах с использованием поляризуемого потенциала Леннарда-Джонса. Нац. коммун. 2018;9:716. doi: 10.1038/s41467-018-03137-8. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

69. Стивенс К., Тамваттана Н., Тран-Дук Т. Новые функциональные параметры Леннарда-Джонса для гетерогенных молекул. Дж. Заявл. физ. 2020;128:204301. doi: 10.1063/5.0025066. [Перекрестная ссылка] [Академия Google]

70. Чоудхури К.Х., Чоудхури М.Р., Махмуд С., Тарек А.М., Ханиф Н.Б., Бану Н., Реза А.С.М.А., Эмран Т.Б., Симал-Гандара Дж. Подход к повторному использованию лекарств против новой коронавирусной болезни (COVID-19) посредством виртуального скрининга Ориентация на основную протеазу SARS-CoV-2. Биология. 2020;10:2. doi: 10.3390/biology10010002. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

71. Nocentini A., Bonardi A., Gratteri P., Cerra B., Gioiello A., Supuran C.T. Стероиды влияют на активность карбоангидразы человека, используя альтернативные механизмы связывания. Дж. Энзим. Ингиб. Мед. хим. 2018;33:1453–1459. doi: 10.1080/14756366.2018.1512597. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

72. Диана Р., Карузо У., ди Костанцо Л. , Бакайоко Г., Панунци Б. Новый Т-образный AIEgen DR/NIR: синтез и рентгеноструктурное исследование кристаллической структуры. Кристаллы. 2020;10:269. doi: 10.3390/cryst10040269. [CrossRef] [Google Scholar]

73. Таллей Т.Э., Фатимавали, Елнетти А., Идроес Р., Кусумавати Д., Эмран Т.Б., Есилоглу Т.З., Сиппл В., Махмуд С., Алкахтани Т. и др. Анализ, основанный на молекулярном докинге и молекулярно-динамическом моделировании бромелаина как вариантов анти-SARS-CoV-2. Фронт. Фармакол. 2021;12:2192. doi: 10.3389/fphar.2021.717757. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

74. Yu Z., Kan R., Ji H., Wu S., Zhao W., Shuian D., Liu J., Li J. Идентификация пептидов, полученных из белка тунца, в качестве мощных ингибиторов SARS-CoV-2 с помощью молекулярного докинга и молекулярно-динамического моделирования. Пищевая хим. 2021;342:128366. doi: 10.1016/j.foodchem.2020.128366. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

75. Herschlag D., Pinney M. M. Водородные связи: все-таки просто? Биохимия. 2018;57:3338–3352. doi: 10.1021/acs.biochem.8b00217. [PubMed] [CrossRef] [Академия Google]

76. Shao Q. Влияние конъюгированного (EK)(10) пептида на структурные и динамические свойства белка убиквитина: исследование моделирования молекулярной динамики. Дж. Матер. хим. Б. 2020; 8: 6934–6943. doi: 10.1039/D0TB00664E. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

77. Zhang L., Lin D., Sun X., Curth U., Drosten C., Sauerhering L., Becker S., Rox K., Hilgenfeld R. Crystal Структура основной протеазы SARS-CoV-2 служит основой для создания улучшенных ингибиторов α-кетоамидов. Наука. 2020;368:409–412. doi: 10.1126/science.abb3405. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

78. Ислам М.С., Махмуд С., Султана Р., Донг В. Идентификация и исследование молекулярного моделирования in silico недавно выделенного штамма Bacillus subtilis SI-18 против Белок S9 Rhizoctonia solani . араб. Дж. Хим. 2020;13:8600–8612. doi: 10.1016/j.arabjc.2020.09.044. [CrossRef] [Google Scholar]

79. Али С.А., Хассан М.И., Ислам А., Ахмад Ф. Обзор методов, доступных для оценки доступных растворителям площадей поверхности растворимых белков в свернутом и развернутом состояниях. Курс. Белковый пепт. науч. 2014; 15:456–476. дои: 10.2174/1389203715666140327114232. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

80. Махмуд С., Уддин М., Пол Г.К., Шиму М., Ислам С., Рахман Э., Ислам А., Ислам М.С., Проми М.М., Эмран Т.Б. и др. Виртуальный скрининг и молекулярно-динамическое моделирование соединений растительного происхождения для выявления потенциальных ингибиторов основной протеазы SARS-CoV-2. Краткий. Биоинформ. 2021; 22: 1402–1414. doi: 10.1093/bib/bbaa428. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

81. Мондал И., Басак Т., Банерджи С., Чаттопадхьяй С. Теоретическое представление о жесткой сетке с водородными связями в твердотельной структуре два комплекса цинка (ii) и их сильное флуоресцентное поведение. CrystEngComm. 2020;22:3005–3019. doi: 10.1039/D0CE00125B. [CrossRef] [Google Scholar]

82. О’Бойл Н.М., Бэнк М., Джеймс К.А., Морли К., Вандермеерш Т., Хатчисон Г.Р. Откройте Вавилон. [(по состоянию на 26 июля 2021 г.)]; J. Химинформ. 2011 3: 1–14. Доступно в Интернете: https://jcheminf.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/1758-2946-3-33 [Google Scholar]

83. Morris G., Huey R., Lindstrom W., Sanner M.F., Belew Р.К., Гудселл Д.С., Олсон А.Дж. AutoDock4 и AutoDockTools4: автоматическая стыковка с селективной гибкостью рецепторов. Дж. Вычисл. хим. 2009 г.;30:2785–2791. doi: 10.1002/jcc.21256. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

84. Tian W., Chen C., Lei X., Zhao J., Liang J. CASTp 3.0: Компьютерный атлас топографии поверхности белков. Нуклеиновые Кислоты Res. 2018;46:W363–W367. doi: 10.1093/nar/gky473. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

85. Tumilaar S.G., Siampa J.P., Fatimawali , Kepel B.J., Niode N.J., Idroes R. , Rakib A., Emran T.B., Tallei T.E. Потенциал экстракта листьев Pangium edule Reinw как ингибитор протеазы ВИЧ-1: подход вычислительной биологии. Дж. Заявл. фарм. науч. 2021 г.: 10.7324/JAPS.2021.110112. [CrossRef] [Google Scholar]

86. Daina A., Michielin O., Zoete V. SwissADME: Бесплатный веб-инструмент для оценки фармакокинетики, сходства с лекарственными препаратами и пригодности малых молекул к химической химии. науч. 2017;7:42717. doi: 10.1038/srep42717. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

87. Pires D.E.V., Blundell T.L., Ascher D.B. pkCSM: прогнозирование фармакокинетических и токсических свойств малых молекул с использованием сигнатур на основе графиков. Дж. Мед. хим. 2015;58:4066–4072. doi: 10.1021/acs.jmedchem.5b00104. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

88. Banerjee P., Eckert A.O., Schrey A.K., Preissner R. ProTox-II: веб-сервер для прогнозирования токсичности химических веществ. Нуклеиновые Кислоты Res. 2018;46:W257–W263. doi: 10.1093/nar/gky318. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

89. Berendsen HJC, van der Spoel D., van Drunen R. GROMACS: реализация параллельной молекулярной динамики с передачей сообщений. вычисл. физ. коммун. 1995; 91: 43–56. doi: 10.1016/0010-4655(95)00042-E. [CrossRef] [Академия Google]

90. Van der Spoel D., Lindahl E., Hess B., Groenhof G., Mark A.E., Berendsen H.J.C. GROMACS: быстрый, гибкий и бесплатный. Дж. Вычисл. хим. 2005; 26: 1701–1718. doi: 10.1002/jcc.20291. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

91. Абрахам М.Дж., Муртола Т., Шульц Р., Палл С., Смит Дж.К., Хесс Б., Линдал Э. Громакс: Высокопроизводительное молекулярное моделирование с помощью многоуровневого параллелизма от ноутбуков до суперкомпьютеров. Программное обеспечениеX. 2015;1–2:19–25. doi: 10.1016/j.softx.2015.06.001. [Перекрестная ссылка] [Академия Google]

92. Vanommeslaeghe K., Hatcher E., Acharya C., Kundu S., Zhong S., Shim J., Darian E. , Guvench O., Lopes P., Vorobyov I., et al. Общее силовое поле CHARMM: силовое поле для лекарствоподобных молекул, совместимое с полностью атомными аддитивными биологическими силовыми полями CHARMM. Дж. Вычисл. хим. 2010; 31: 671–690. doi: 10.1002/jcc.21367. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

93. Huang J., Mackerell A.D. Силовое поле аддитивного белка CHARMM36 для всех атомов: проверка на основе сравнения с данными ЯМР. Дж. Вычисл. хим. :2013. doi: 10.1002/jcc.23354. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

94. Прайс Д.Дж., Брукс С.Л. Модифицированный водный потенциал TIP3P для моделирования с суммированием Эвальда. Дж. Хим. физ. 2004; 121:10096–10103. doi: 10.1063/1.1808117. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

95. Lu J., Qiu Y., Baron R., Molinero V. Крупнозернистая обработка TIP4P/2005, TIP4P-Ew, SPC/E и TIP3P до моноатомной анизотропии. Модели воды, использующие минимизацию относительной энтропии. Дж. Хим. Теория вычисл.