Содержание
Цифровой гербарий МГУ: новая жизнь исторической коллекции растений
Переход «в цифру» — уже давно не новость для различных коллекций. Множество музеев мира готовы принять посетителей в своих виртуальных стенах, библиотеки предоставляют открытый доступ к нужным книгам через интернет.
Не стали исключением и гербарии — научные коллекции засушенных растений по всему миру. И не зря. Ведь оцифровка коллекций — это не только «получение картинок», но и обработка и получение огромных массивов ботанической информации, большой шаг в эпоху больших данных для коллекций растений. Сегодня ботаника развивается в том числе и за счет обобщений крупных массивов информации, приемов математического моделирования и матстатистики.
Для второго по величине гербария нашей страны — коллекции МГУ имени М. В. Ломоносова переход на новый уровень начался еще в 2015 году. И к 2020 году мы имеем большой структурированный портал, который помогает ботаникам из любой точки мира.
Рис. 1. Примеры гербарных образцов из коллекции МГУ имени М. В. Ломоносова, опубликованных на портале Цифрового гербария. В правом верхнем углу располагаются штрихкоды — уникальные идентификаторы каждого образца в коллекции
Так что же получили ученые в итоге этой трудоемкой и длительной работы?
- Доступность более чем 1 млн. изображений растений из любой точки мира.
- Базу метаданных, которая также открыта для запросов ученых и представляет собой классический образец больших данных. И если отсканированные картинки — это наиболее видимый результат, то база данных цифрового гербария — это очень важная и ценная часть проекта именно с точки зрения возможностей анализа информации.
- У каждого образца появился уникальный идентификатор — стало гораздо проще ссылаться на нужные образцы в своих статьях
- Привязки к карте для более чем 50% образцов. Это очень ценная информация. Вопрос «где растет этот вид» — один из базовых в ботанике и по сей день не теряет актуальности, ведь в изменяющихся под влиянием человека условиях еще важнее знать «где что растет», чтобы потом можно было спрогнозировать «а будет ли расти там и там при таких и таких условиях». И здесь в игру вступает информация с этикеток гербария и ее «привязка» к карте.
Вплоть до 1990-х годов для составления гербариев GPS системы практически не использовались, и места сбора растений отмечали как «5 км к ЮВ от деревни X». Чтобы найти по словесным описаниям точку на современной карте требуется много времени и сил. Один человек за рабочий день может «привязать» от 50 до 300 точек.
В базе гербария МГУ таких точек уже 578063. Для их определения, помимо ручного труда, людям помогал специально настроенный алгоритм. Система группировала образцы, собранные в один день одним и тем же человеком и экстраполировала на эту группу геопривязку, если она имелась хотя бы для одного образца из группы.
Конечно, такая привязка не столь точна, как «ручная», но она тем не менее позволила уточнить расположение мест сбора многих тысяч растений. Такие автоматические привязки помечены в системе отдельным значком.
- Названия растений на портале синхронизированы с международной базой данных названий «Catalogue of Life». Можно сразу посмотреть не только актуальное название растения, но и его положение в системе растительного мира и возможные синонимы.
- Распознаны тексты этикеток (в том числе рукописных) для почти половины образцов
Рис.2. Пример этикетки гербарного образца
7. Гибкая система поиска позволяет найти нужное растение за пару минут, используя самые разные параметры: от названия растения до даты сбора образца.
Конечно же гербарий МГУ существует и в оффлайн формате. Образцы XVIII-XXI веков хранятся в специальных шкафах и ждут заинтересованных специалистов.
Рис. 3. Образцы привычных нам липы сердцелистной (слева) и клена Гиннала (справа) конца XIX из коллекции Цифрового гербария МГУ.
Однако перевод в цифровую форму открыл гербарий не только для пользователей со всего мира, но и сделал возможным детальный анализ данных по разнообразию и географии растений. Ну а в периоды дистанционной работы гербария из-за пандемии его онлайн-портал — это единственная возможность ознакомиться с образцами и получить данные для своей курсовой, диссертации, научной статьи.
Источники:
- Цифровой гербарий
- Цифровой гербарий МГУ — Moscow Digital Herbarium (группа ВКонтакте)
Научные статьи про Цифровой гербарий МГУ:
- Серегин А. П. Цифровой гербарий МГУ-крупнейшая российская база данных по биоразнообразию //Известия Российской академии наук. Серия биологическая. – 2017. – №. 6. – С. 610-616.
- Серегин А. П. Гербарий Московского университета (MW) сегодня: фонды, онлайн доступ и научная работа //Ботанический журнал. – 2017. – Т. 102. – №. 3. – С. 281-308.
- Alexey S. Moscow Digital Herbarium: OCR-mining of the text data for the Russia¨ s largest biodiversity database //INFORMATION TECHNOLOGIES IN THE RESEARCH OF BIODIVERSITY (BIT-2018). – 2018. – С. 88-89.
- Seregin A. P. The largest digital herbarium in Russia is now available online! //Taxon. – 2018. – Т. 67. – №. 2. – С. 465-467.
- Seregin A. P. Making the Russian flora visible: fast digitisation of the Moscow University Herbarium (MW) in 2015 //Taxon. – 2016. – Т. 65. – №. 1. – С. 205-207.
Собираем гербарий: как сделать это правильно
Йогурты и творожки «Растишка» обогащены Ca и D3.
100 г йогурта или творожка обеспечивают 20-27% суточной потребности в кальции детей дошкольного и школьного возраста.
О кальции
Наталья Колесникович
Умеете ли вы сушить листики-травинки? «Конечно! Что в этом сложного?», – скажет мама, увидев в дневнике запись «Принести засушенные листья и цветы». Вышли на улицу, нарвали чего-попало, прогладили утюгом – готово! Держи, доча, неси на урок труда. Стоп! Не все так просто, давайте разберемся без спешки.
Что такое гербарий?
С детства знакомое слово «гербарий» в дословном переводе с латинского звучит как «трава» и подразумевает засушенные растения. «Википедия» рассматривает и более широкий смысл этого слова – это здание, в котором хранят коллекции засушенных растений или даже учреждение, которое занимается организацией и обработкой засушенных коллекций. Крупнейшие гербарии мира находятся на базе музеев, ботанических садов.
Не всегда мы, конечно же, собираем растения так, как того требует классически составленный гербарий (все части растения, вместе с корнем и увядшими листьями), да и альбомы с подписанными на листах названиями, местом и датой сбора делают разве что заядлые ботаники.
Большинство мам и пап в детстве наверняка засушивали растения в книгах, называя это «…мы собирали гербарий», подразумевая высушивание отдельных частей растений в плоском виде. На самом деле, гербарный метод сушки растений (под прессом), далеко не единственный, и в зависимости от того, для чего мы в дальнейшем хотим использовать травы и цветы, можно воспользоваться и другими методами.
Гербарный метод (прессование)
Гербарный метод позволяет высушить растения в плоском виде. Дино подготовил специальный подробный мастер-класс о том, как сделать это правильно. Смотрите ТУТ.
Все просто. Берем толстую книгу и укладываем в нее растения, пропуская несколько страниц. Кладем книгу под пресс и через пару дней перекладываем материал на сухие странички, чтобы не завелась плесень.
ВАЖНО! Берите книгу, которую не жалко испортить, т.к. странички испачкаются соком растений и станут впоследствии сморщенными от влаги. Если вы идете на прогулку, возьмите транспортную книгу с собой, так растения не завянут и не помнутся. Дома вы сможете разложить их в другую книгу или под специальный пресс для окончательной просушки.
Для того, чтобы растения окончательно высохли, может понадобиться от 2 до 4 недель, все зависит от толщины стеблей и бутонов, от наличия влаги. В дальнейшем, удобно хранить их в сухом месте в книгах, рассортировав по видам. Если переложить их в коробки, то со временем, они могут сморщиться, реагируя на влажность в квартире.
Существуют и более быстрые способы сушки растений для гербария – это утюг или микроволновка. Использовать их нужно в редких случаях, когда нужно сэкономить время. Главное, не пересушить материал, иначе он станет хрупким и ломким, потеряет цвет. При сушке утюгом нужно обязательно гладить через бумагу.
Правила сбора растений для гербария
1. Нельзя собирать растения для гербария ранним утром, когда не высохла роса или сразу после дождя.
2. Не вырывать растение с корнем, брать только несколько листиков и цветков, чтобы не повредить все растение.
3. Не срывать редкие растения, занесенные в Красную книгу.
4. Не рвать больше, чем нужно.
5. Собирать листья и цветы разного размера, чтобы в дальнейшем, при составлении цветочных композиций, был выбор (маленькие, большие, раскрытый цветок, бутон).
Советы и секреты
- Помните: чем «моложе» цветки или соцветия (1–2 дня), тем устойчивее их окраска. Взятые в конце цветения, они, как правило, при сушке распадаются, теряют лепестки, колер становится тусклым.
- Если растения собирают вдали от дома, их сразу же кладут в книгу или газету. Если вы не успели обработать и заложить цветы для засушки, то поставьте их в воду, а на следующий день начните засушивать.
- Если какие-то цветы пришлось сорвать после дождя, то их ставят в воду и дают высохнуть, а затем засушивают.
- Можно собирать увядшие цветы: засушенные, они дают графичность и живописность композиции.
- Лепестки, листья, стебли сушат отдельно. Нельзя закладывать вместе нежные и грубые части растений, так как для них необходим разный груз: для нежных – 8–16 кг, грубых – 20–40 кг и более.
- У таких пышных цветов, как астра, георгин, пион, роза, стебли и листья засушиваются отдельно. С цветочных головок удаляются все зеленые части, кроме тех, что непосредственно держат лепестки. Медицинским пинцетом ряд за рядом лепестки приподнимают и прокладывают между ними тонкие слои ваты. Обработанный цветок (или 3—4) помещают в закладку под пресс. Часть лепестков кладут и засушивают отдельно под грузом 5– 10 кг.
- Пионы разрезают (разрывают) на 4– 8 частей, прокладывают ватой и засушивают. В дальнейшем из таких частей легко и быстро можно монтировать целые цветы.
- При засушивании осенних георгин нужно брать самые распустившиеся экземпляры. Середина цветка удаляется и заполняется ватой, лепестки приподнимаются рядами, прокладываются тонким слоем ваты и весь цветок с лицевой и обратной стороны покрывается ватой.
- Тюльпаны можно сушить отдельными лепестками (удаляя середину), а потом монтировать цветок. Если же сушить цветок тюльпана целиком, то ему нужно дать подвянуть.
- Ромашки, герберы, однолетние георгины, ноготки и другие подобные им цветы кладут на газету стеблем вверх, лепестки вокруг плодоножки полностью закрывают валиком из ваты, сушат в закладках с несколькими прокладками под грузом не менее 15 кг. Особенно трудно засушить нежные белые и розовые лепестки. Их помещают в белую закладку или бумажные салфетки без рисунка и часто меняют газеты, которые выполняют роль прокладок.
- Мелкие цветочки, необходимые для создания миниатюр и пейзажей, засушивают целиком. Незабудки, лютики, болиголов, тысячелистник, цветущую рябину, цветки жасмина и черемухи укладывают в газетную закладку вместе с веточкой, накрывают газетными прокладками, картоном (фанерой) и сушат под прессом не менее 15–20 кг.
- Розы также сушатся отдельными лепестками или целиком – хорошо подвянувшими.
- Не выбрасывайте увядшие букеты! Кое-что из них можно взять для будущих панно.
- Летом и осенью постарайтесь запастись разнообразными семенами, плодами, тополиным пухом, пухом от пушицы, иван-чая, мать-и-мачехи, одуванчика, осота. Это удивительная «белая краска».
- Обязательно засушите яркие осенние листья. Перед тем как положить их на сушку, очистите от пыли и грязи мокрой ватой, мягкой тряпочкой. Белую, серую, серо-голубоватую окраску имеют с нижней стороны листья серебристого тополя, осенней малины, мать-и-мачехи, остролистного клена, девясила. Листья клена обыкновенного бывают разных цветов и оттенков, что дает возможность создавать прекрасные фоны для композиций.
- Чтобы сочные стебли (тюльпан, нарцисс, дицентра) сохранили окраску, перед закладкой в гербарий их надо разрезать лезвием бритвы или острым ножом продольно и выскоблить сердцевину. Толстые или деревянистые стебли (лук, гвоздика, гербера, роза) просто разделяют пополам.
- Плотные, кожистые, сочные, а также яркие осенние листья хорошо сушить, проглаживая горячим утюгом через бумагу. Цветы утюгом не сушат. Исключение составляет василек, который можно сушить утюгом.
Для чего нужен гербарий?
Детям нравится собирать гербарий. Научите их делать это правильно. Параллельно можно повторять названия растений, сравнивать форму листьев и цветов у разных экземпляров, находить сходства и различия, рассуждать о том, как растение приспособилось к месту произрастания, что помогает ему выжить и добыть необходимое количество влаги, как размножается, когда созревают семена и пр. Информация, которую ребенок может получить во время сбора растений для гербария, запомнится гораздо быстрее той, что прочитана в учебнике.
Высушенные растения можно использовать для поделок, панно, аппликаций или просто хранить в альбомах с подписями и пометками на память.
Одинаковые растения можно наклеить на карточки и сделать настольную игру, лото и др. пособия. Кроме всего прочего, создание гербария – это отличный способ сохранить воспоминания о теплых днях.
Уважаемые читатели! Собирали ли вы гербарий в детстве? Делаете ли вы гербарии со своими детьми сейчас? Для чего вы используете засушенные листья? Ждем ваших ответов в комментариях.
ЧИТАЙТЕ ТАКЖЕ
126 753
Обзоры и статьи
Растишка
статья
Детский день рождения в стиле миньонов: подробное руководство
Наверняка в вашей квартире живет не только любитель миньонов, но и сами «виновники торжества» — забавные желторотые создания, которые смотрят …
Растишка
статья
Миньонотворчество: емкости для хранения своими руками
Забавных и прикольных желто-синих миньонов можно сделать из каких угодно подручных материалов. И сделать не просто ради забавы, а с …
Растишка
статья
Миньономания: как сделать миньонов своими руками
Пока прикольные желторотые миньоны странствуют по земле в надежде захватить мир своей харизмой и найти новых «друзей», мы расскажем родителям, …
13 529
загрузить еще
баз данных коллекций | Burke Museum
Фото: Cathy Morris/Burke Museum
Фото: Cathy Morris/Burke Museum
Благодарим вас за посещение веб-сайта музея Берка. Доступ к базам данных коллекций в настоящее время недоступен. Мы работаем над их восстановлением как можно быстрее. Спасибо за Ваше понимание.
Поиск в коллекциях
Коллекция музея Берка состоит из более чем 18 миллионов биологических, геологических и культурных объектов из штата Вашингтон и со всего мира.
Поиск в коллекциях Берка
Коллекция музея Берка состоит из более чем 18 миллионов биологических, геологических и культурных объектов из штата Вашингтон и со всего мира; более 10 миллионов доступны через нашу онлайн-базу данных.
Поиск
Картографические данные Google 2019
Картографические данные Google 2019
Найдите коллекции Burke из вашего региона
The Burke заботится о коллекциях со всего штата Вашингтон (и со всего мира) за более чем 130 лет сбора.
Поиск
Коллекции Берка из штата Вашингтон
Карты, показывающие распределение оцифрованных образцов и артефактов Музея Берка из штата Вашингтон.
Поиск
Археологические коллекции
База данных археологических коллекций включает артефакты со всего мира с акцентом на тихоокеанском северо-западе.
Коллекции искусства и культуры
Ищите изображения и данные во всемирно известных коллекциях искусств и культур Музея Берка.
Коллекции растений и грибов
Сосудистые и несосудистые растения, грибы, лишайники и морские водоросли.
Герпетологические коллекции
Выберите «Образцы амфибий и рептилий» в разделе «Музей естественной истории и культуры Берка (UWBM)» в раскрывающемся меню «Коллекция».
Коллекции ихтиологии
Образцы, включая взрослых рыб, молодь, личинок, икру, скелеты, ткани, отолиты и чешую.
Коллекции малакологии
Большое разнообразие современных моллюсков, собранных со всего мира.
Коллекции маммологии
Образцы млекопитающих со всех континентов, кроме Антарктиды, с особым акцентом на северо-западе Тихого океана.
Коллекции Орнитологии
Шкуры птиц для изучения, расправленные крылья, скелеты птиц, наборы яиц, гнезда и образцы замороженных тканей.
Коллекции отолитов
Примерно 2,4 миллиона пар отолитов рыб.
Палеонтологические коллекции
Обыщите палеонтологические коллекции Берка — ископаемые беспозвоночные, листья, цветы, млекопитающие, птицы, динозавры и многое другое.
Наша работа
В Burke мы объединяем людей, предметы и истории, которые наполняют их смыслом.
Учить больше
Фото: Марк Стоун/Вашингтонский университет
Фото: Марк Стоун/Вашингтонский университет
коллекций ботаники Поиск
Коллекции растений Смитсоновского института начались с приобретения образцов, собранных Исследовательской экспедицией Соединенных Штатов (1838-1842 гг. ). Они легли в основу Национального гербария, который сегодня насчитывает более 5 миллионов исторических записей о растениях, что делает его одним из крупнейших и наиболее важных в мире.
В настоящее время в этом онлайн-каталоге доступно более 4,2 миллиона записей об образцах (в том числе более 115 000 типовых образцов с изображениями).
Выберите вкладку на этой странице для поиска по ключевому слову или выбранным полям. Поиск ограничен 10000 записей, а результаты сортируются по таксономической группе. Если вам нужно получить больший набор записей, обратитесь к менеджеру данных Департамента ботаники.
Отказ от ответственности: Записи коллекций Гербария США могут содержать этикетки образцов, содержащие оскорбительные или культурно нечувствительные выражения. Эти записи отражают не текущую точку зрения Гербария США, а скорее социальные отношения и обстоятельства того периода времени, когда образцы были собраны или каталогизированы.
См. вкладку «Справка», чтобы узнать больше о поиске и последующем изучении возвращенных результатов (сортировка, экспорт и т. д.).
Поиск в реестре ботанических типов | Поиск Завод Фото Изображения | Искать ботаническое искусство |
Используйте поиск по полю , чтобы найти данные образца, которые соответствуют значениям в определенных полях базы данных.
Введите значение или выберите его из раскрывающихся списков.
- Нажмите кнопку Поиск , чтобы начать поиск. Очистить сбрасывает все поля.
- Некоторые списки связаны между собой, поэтому, например, выбор Country сужает выбор для
Провинция/штат/территория и округ/округ . Выпадающие варианты также
узкий по мере ввода, например, ввод zing в поле Family может сузить выбор до Zingiberaceae . - Установите флажок Только записи с изображениями , если вы хотите ограничить поиск записями с мультимедийным содержимым.
- Вы можете принудительно выполнить точный поиск, заключив текст поиска в двойные кавычки. Точный значит точный,
поиск чувствителен к регистру и должен соответствовать значению всего поля. Точный поиск также
потребуется гораздо больше времени для завершения. - Вы получите предупреждение, если введете неверную информацию в текстовые поля. Например,
Каталожные номера состоят исключительно из букв и цифр; другие персонажи поднимают предупреждение.
Введите ключевые слова, разделенные пробелами, и нажмите Поиск . Записи, соответствующие вашему запросу
условия будут возвращены.
- Вы можете объединить термины с помощью ИЛИ, чтобы соответствовать любому, например. Гуам ИЛИ Палау
- Вы можете включить термины изображение(я) или тип(ы) , чтобы найти записи, которые содержат изображения или являются типовыми образцами.
- Для поиска каталожных номеров замените пробелы тире, например вместо АВС 12345 ,
используйте ABC-12345 . Не включайте никакие другие термины.
Обратите внимание, что поиск общеупотребительных (народных) имен может не дать ожидаемых результатов. Связывание общих имен с записями образцов находится в стадии разработки.
Пример поиска по ключевому слову: marantaceae australia images
Результаты ваших поисков могут отображаться в сетке (сортируемая, настраиваемая таблица)
или Просмотр галереи (лучше всего подходит для просмотра изображений). Используйте кнопку переключения
для переключения между этими представлениями.
- Вы можете выбрать, отображать ли 5, 10, 20, 50 или 100 записей одновременно.
В Вид листа :
- Нажмите на научное название, чтобы просмотреть полную запись.
- Нажмите на миниатюру, чтобы просмотреть изображение в большем разрешении. Используйте Control+щелчок
(Command+щелчок), чтобы открыть новую вкладку браузера.
В представлении сетки :
- Вы можете выбрать столбцы для отображения в раскрывающемся меню любого столбца (наведите указатель мыши на
заголовок столбца и щелкните значок раскрывающегося списка). В разделе Столбцы щелкните имя
для отображения или скрытия поля (специально ставить галочку не нужно). - Вы можете перетащить заголовок столбца, чтобы изменить порядок его появления в сетке.
- Вы также можете перетащить край столбца, чтобы сделать его шире или уже.
- Нажмите в расширении
()
столбец для просмотра полной записи.
В просмотре галереи :
- Щелкните изображение, чтобы просмотреть полную запись.
См. Экспорт результатов для получения информации о загрузке результатов, например, в
Excel или Google Планета Земля.
Откройте полную запись коллекции, нажав кнопку расширения
()
в Вид сетки ,
по научному названию в представлении листа,
или в любом месте кадра изображения в просмотре галереи . Кнопки обратного расширения
()
указывают записи с мультимедиа (как правило, изображения).
- В окне «Запись» метаданные для мультимедийного содержимого доступны при наведении указателя мыши на миниатюру.
- Щелчок по миниатюре открывает содержимое в вашем браузере или другом подходящем приложении.
- Окна записи могут быть изменены в размере или перемещены в пределах окна браузера.
- Одновременно у вас может быть открыто до десяти окон записи.
Отсортируйте результаты в представлении сетки , щелкнув заголовок столбца (или выбрав Сортировать из
раскрывающееся меню столбца).
- Сортировка по нескольким столбцам путем последовательной сортировки столбцов в обратном порядке.
Например, чтобы просмотреть результаты, отсортированные по странам и провинциям/штатам, сначала выполните сортировку по
Провинция/Штат, а затем снова отсортируйте по стране. - Для любого столбца вы можете выбрать сортировку по возрастанию или по убыванию.
Экспортируйте все или выбранные результаты, нажав кнопку Экспортировать результаты в формате CSV в
нижняя панель инструментов в сетке
, Лист,
или Просмотр галереи .
- Выберите отдельные записи для экспорта, установив флажок выбора экспорта.
(вдоль левого края сетки Grid View ). - Очистите все выделения с помощью кнопки Очистить выборки на нижней панели инструментов.
- Результаты экспортируются в виде значений, разделенных запятыми, по одной записи в строке, которые можно сохранить.
на диск или открываются непосредственно в таких приложениях, как Microsoft Excel.
Вы также можете экспортировать все или выбранные результаты в файл KML для просмотра с помощью Google Планета Земля или других средств просмотра KML, нажав кнопку Экспортировать как KML. Эта кнопка становится серой, если во всех или выбранных результатах отсутствуют значения широты/долготы.
Вот несколько советов по поиску:
- Результаты запроса ограничены 10000 записей. Избегайте очень общих запросов, которые
вернуть очень большое количество записей, например. поиск злаков .